76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0129 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0129  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  387  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.374028  normal  0.0265018 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2543  hypothetical protein  36.94 
 
 		 126 aa  73.6  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  32.58 
 
 		 283 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0103  hypothetical protein  31.58 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0322  hypothetical protein  29.75 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  37.5 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  34.01 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  34.45 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  28.4 
 
 		 168 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2631  putative signal peptide protein  34.17 
 
 		 151 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  0.77547 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  32.79 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0418  hypothetical protein  31.4 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  32.26 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  28.18 
 
 		 300 aa  55.5  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3041  conserved hypothetical signal peptide protein  33.33 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3486  hypothetical protein  33.06 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1598  hypothetical protein  29.05 
 
 		 144 aa  54.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1542  hypothetical protein  35.29 
 
 		 139 aa  54.3  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714923 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1867  hypothetical protein  35.29 
 
 		 151 aa  53.9  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.526654  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1124  hypothetical protein  34.58 
 
 		 137 aa  52.8  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  33.61 
 
 		 146 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3075  putative signal peptide protein  33.04 
 
 		 153 aa  52  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  28.77 
 
 		 145 aa  51.6  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  31.19 
 
 		 280 aa  51.2  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  33.9 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6081  hypothetical protein  39.06 
 
 		 168 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29440  hypothetical protein  32.19 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809204  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2874  putative signal peptide protein  34.58 
 
 		 157 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000419101  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0944  hypothetical protein  40.85 
 
 		 148 aa  49.3  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.502231  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  26.79 
 
 		 272 aa  48.5  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  32.76 
 
 		 147 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  30.08 
 
 		 140 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1435  hypothetical protein  31.75 
 
 		 153 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152926  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  26.27 
 
 		 123 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2798  putative signal peptide protein  41.54 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00624822  normal  0.61981 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  27.86 
 
 		 143 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1033  hypothetical protein  31.25 
 
 		 153 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2649  hypothetical protein  31.48 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799269 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0550  hypothetical protein  29.31 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000170844 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4654  hypothetical protein  31.4 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388163  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1395  hypothetical protein  31.75 
 
 		 153 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1489  hypothetical protein  31.25 
 
 		 153 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  hitchhiker  0.000316489 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1513  hypothetical protein  31.25 
 
 		 153 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.715574  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  25.6 
 
 		 143 aa  46.6  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  30.83 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2807  putative signal peptide protein  29.73 
 
 		 161 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1046  hypothetical protein  30.72 
 
 		 153 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.29497  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1617  hypothetical protein  29.69 
 
 		 154 aa  45.4  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000464775  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1005  hypothetical protein  30.72 
 
 		 153 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.660844  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1493  hypothetical protein  30.72 
 
 		 153 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0161  hypothetical protein  30.72 
 
 		 153 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0566  hypothetical protein  28.35 
 
 		 133 aa  45.4  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406238  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1175  putative signal peptide protein  38.36 
 
 		 148 aa  45.1  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01791  hypothetical protein  33.04 
 
 		 149 aa  44.7  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1779  putative lipoprotein  31.25 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1742  hypothetical protein  29.69 
 
 		 153 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00050816 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  27.52 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1929  hypothetical protein  31.25 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.612499  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5549  hypothetical protein  42.86 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.355042 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2551  putative lipoprotein  45.45 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846128  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1757  putative lipoprotein  31.25 
 
 		 160 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.980329  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  28.03 
 
 		 161 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.399726 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1716  putative signal peptide protein  33.33 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4794  hypothetical protein  27.93 
 
 		 150 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0246667  normal  0.215514 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  26.17 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  30 
 
 		 136 aa  43.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  29.45 
 
 		 148 aa  42.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  25.66 
 
 		 145 aa  42.4  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09958  hypothetical protein  28.68 
 
 		 141 aa  42.4  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150312  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0773  hypothetical protein  38.1 
 
 		 144 aa  42  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0802  hypothetical protein  38.1 
 
 		 144 aa  42  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0572  hypothetical protein  30.4 
 
 		 144 aa  41.6  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4104  hypothetical protein  29.31 
 
 		 141 aa  42  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0593  hypothetical protein  30.4 
 
 		 144 aa  41.6  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.438813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  26.8 
 
 		 151 aa  41.6  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  28.69 
 
 		 202 aa  41.2  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>