91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1333 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  254  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  65.29 
 
 		 145 aa  179  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  69.57 
 
 		 147 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  63.87 
 
 		 145 aa  170  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  65 
 
 		 147 aa  170  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  63.25 
 
 		 147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  62.71 
 
 		 146 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  57.63 
 
 		 156 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  49.19 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  47.2 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  45.97 
 
 		 203 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  43.55 
 
 		 199 aa  110  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  42.98 
 
 		 204 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  41.13 
 
 		 202 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  43.55 
 
 		 228 aa  106  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  43.8 
 
 		 230 aa  105  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  44.35 
 
 		 154 aa  104  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  44.26 
 
 		 228 aa  104  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  45.08 
 
 		 170 aa  103  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  45.08 
 
 		 170 aa  103  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  41.13 
 
 		 135 aa  103  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  39.2 
 
 		 134 aa  102  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  39.5 
 
 		 204 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  43.44 
 
 		 179 aa  100  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  41.46 
 
 		 178 aa  99.8  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  40.32 
 
 		 167 aa  95.5  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  40.83 
 
 		 149 aa  94.7  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  39.67 
 
 		 213 aa  94.4  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  40.98 
 
 		 207 aa  92.8  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  37.61 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  41.18 
 
 		 134 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1874  hypothetical protein  37.59 
 
 		 225 aa  89.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  40.65 
 
 		 139 aa  89.4  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  38.02 
 
 		 231 aa  87.4  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  37.7 
 
 		 133 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  37.7 
 
 		 111 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  33.33 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  37.7 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  36.89 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  33.61 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  36 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  35.77 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  36.44 
 
 		 283 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  31.97 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  32.79 
 
 		 146 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  37.29 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  35.83 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3722  Protein of unknown function DUF2147  31.67 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861772  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  36.07 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  34.4 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  34.68 
 
 		 300 aa  74.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  32.48 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  32.79 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  35.25 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4794  hypothetical protein  31.03 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0246667  normal  0.215514 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  35.9 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  30.51 
 
 		 272 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1598  hypothetical protein  28.33 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  28.1 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  31.15 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  30 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03893  putative signal peptide protein  26.98 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.536357 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4104  hypothetical protein  29.92 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0919  hypothetical protein  27.42 
 
 		 126 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539754  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  29.69 
 
 		 129 aa  51.2  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2925  hypothetical protein  35.38 
 
 		 147 aa  50.8  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2244  hypothetical protein  27.42 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1124  hypothetical protein  29.29 
 
 		 137 aa  50.4  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0038  putative signal peptide protein  25.45 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4322  putative signal peptide protein  24.8 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338595  normal  0.0273369 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2874  putative signal peptide protein  39.29 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000419101  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  28.46 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0550  hypothetical protein  27.78 
 
 		 148 aa  47.4  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000170844 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0129  hypothetical protein  26.27 
 
 		 188 aa  47.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.374028  normal  0.0265018 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  24.41 
 
 		 148 aa  47  0.00009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1090  hypothetical protein  27.78 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177825  normal  0.714021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3486  hypothetical protein  34.29 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4317  hypothetical protein  22.61 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01791  hypothetical protein  37.14 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3056  hypothetical protein  21.55 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  25.4 
 
 		 129 aa  44.3  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2631  putative signal peptide protein  31.54 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  0.77547 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3041  conserved hypothetical signal peptide protein  31.54 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0576  Protein of unknown function DUF2147  27.84 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09958  hypothetical protein  27.78 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150312  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2841  Protein of unknown function DUF2147  30.77 
 
 		 170 aa  41.2  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1885  hypothetical protein  26.98 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3075  putative signal peptide protein  29.92 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0322  hypothetical protein  30.88 
 
 		 155 aa  40.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>