98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5609 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  273  5e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  64.29 
 
 		 146 aa  166  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  60.63 
 
 		 147 aa  163  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  60.94 
 
 		 147 aa  161  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  48.18 
 
 		 134 aa  124  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  49.23 
 
 		 134 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  42.66 
 
 		 139 aa  105  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  42.75 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  41.8 
 
 		 154 aa  101  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  43.26 
 
 		 178 aa  101  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  42.03 
 
 		 145 aa  100  7e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  46.22 
 
 		 147 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  41.67 
 
 		 170 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  41.67 
 
 		 170 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  38.52 
 
 		 123 aa  98.6  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  44.44 
 
 		 146 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  39.13 
 
 		 169 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  41.67 
 
 		 179 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  40.15 
 
 		 135 aa  96.7  9e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  37.96 
 
 		 165 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  45.69 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  35.25 
 
 		 167 aa  95.1  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  37.88 
 
 		 213 aa  94.4  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  39.53 
 
 		 207 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  40 
 
 		 231 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  44.35 
 
 		 147 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  41.27 
 
 		 202 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  40.68 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  37.5 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  39.16 
 
 		 204 aa  88.6  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  41.61 
 
 		 162 aa  86.7  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  38.76 
 
 		 138 aa  84.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  36.36 
 
 		 228 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  34.92 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  37.19 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  39.13 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  36.36 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  36.3 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  39.32 
 
 		 137 aa  80.1  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  40.71 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  35.54 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4104  hypothetical protein  36.75 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1874  hypothetical protein  35.29 
 
 		 225 aa  78.2  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  40 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  32.8 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  40 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  39.47 
 
 		 300 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  32.43 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  36.36 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  37.82 
 
 		 283 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  36.61 
 
 		 280 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  35.09 
 
 		 272 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4794  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0246667  normal  0.215514 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  35 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  34.51 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  35 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5099  hypothetical protein  36.36 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0959389  normal  0.741523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  33.09 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6954  hypothetical protein  34.68 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  30.28 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  34.81 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4317  hypothetical protein  34.72 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2244  hypothetical protein  38.26 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  31.16 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0919  hypothetical protein  38.26 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539754  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0663  hypothetical protein  38.94 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0965  hypothetical protein  38.26 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.996069  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1124  hypothetical protein  38.54 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1118  hypothetical protein  37.39 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  31.82 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  28.91 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1419  hypothetical protein  36.28 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.874564  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1598  hypothetical protein  27.14 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1885  hypothetical protein  39.39 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  32.85 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  23.97 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3056  hypothetical protein  30.77 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  32.8 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  28.47 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0322  hypothetical protein  31.29 
 
 		 155 aa  52  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03893  putative signal peptide protein  36.11 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.536357 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4322  putative signal peptide protein  30.43 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338595  normal  0.0273369 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3722  Protein of unknown function DUF2147  27.78 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861772  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2293  hypothetical protein  33.58 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.401413  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0038  putative signal peptide protein  30.47 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0418  hypothetical protein  33.59 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130226  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1046  hypothetical protein  29.37 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.29497  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1005  hypothetical protein  29.37 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.660844  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0161  hypothetical protein  29.37 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1493  hypothetical protein  29.37 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0129  hypothetical protein  30 
 
 		 188 aa  43.9  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.374028  normal  0.0265018 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3518  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.446687  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2925  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2410  hypothetical protein  28.24 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0608791  hitchhiker  0.0000618483 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0802  hypothetical protein  31.5 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0773  hypothetical protein  31.5 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0576  Protein of unknown function DUF2147  25.36 
 
 		 166 aa  40  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>