71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2829 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  567  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  68.77 
 
 		 283 aa  325  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  45.49 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  74.76 
 
 		 300 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  59.79 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  41.35 
 
 		 119 aa  87  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  30.28 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  36.44 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  32.03 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  38 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  31.21 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  32.74 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  33.86 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  35.9 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  32.12 
 
 		 145 aa  75.1  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4794  hypothetical protein  32.14 
 
 		 150 aa  75.1  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0246667  normal  0.215514 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  30.99 
 
 		 199 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  32.14 
 
 		 135 aa  73.6  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  36.73 
 
 		 138 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  32.23 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  35.9 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  35.4 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  37 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  37.76 
 
 		 133 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  33.87 
 
 		 128 aa  72  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  35.04 
 
 		 147 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  30.23 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  32.74 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  28.8 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  31.4 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  31.4 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  30.58 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  36.36 
 
 		 136 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1598  hypothetical protein  29.29 
 
 		 144 aa  67.8  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  31.93 
 
 		 147 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  34.51 
 
 		 207 aa  67  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  30.15 
 
 		 134 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  29.58 
 
 		 178 aa  64.7  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  34.11 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0919  hypothetical protein  40.57 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539754  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  34.75 
 
 		 139 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2244  hypothetical protein  39.62 
 
 		 126 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  26.72 
 
 		 134 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  30.17 
 
 		 129 aa  58.5  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  30 
 
 		 143 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  28.24 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  29.77 
 
 		 129 aa  55.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  31.09 
 
 		 165 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  28 
 
 		 151 aa  53.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  29.32 
 
 		 147 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  31.93 
 
 		 179 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  28.07 
 
 		 162 aa  50.8  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0129  hypothetical protein  31.19 
 
 		 188 aa  50.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.374028  normal  0.0265018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  28.44 
 
 		 147 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  28.8 
 
 		 149 aa  50.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1124  hypothetical protein  30.23 
 
 		 137 aa  50.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  27.05 
 
 		 167 aa  50.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  27.94 
 
 		 146 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3056  hypothetical protein  23.21 
 
 		 143 aa  49.3  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  31.09 
 
 		 170 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  31.09 
 
 		 170 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  30.83 
 
 		 154 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  30.83 
 
 		 145 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2925  hypothetical protein  47.62 
 
 		 147 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6954  hypothetical protein  38.27 
 
 		 112 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  30.43 
 
 		 134 aa  46.2  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5099  hypothetical protein  32.63 
 
 		 111 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0959389  normal  0.741523 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  32 
 
 		 2449 aa  44.3  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  28.15 
 
 		 143 aa  43.9  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  27.93 
 
 		 140 aa  43.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>