73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3413 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  98.99 
 
 		 228 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  92.02 
 
 		 228 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  63.11 
 
 		 203 aa  249  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  68.45 
 
 		 199 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  66.11 
 
 		 204 aa  242  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  55.56 
 
 		 202 aa  215  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  48.55 
 
 		 204 aa  179  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  46.59 
 
 		 178 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  53.9 
 
 		 169 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  51.95 
 
 		 165 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  53.17 
 
 		 154 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  50.79 
 
 		 170 aa  138  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  50.79 
 
 		 170 aa  138  7e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  49.21 
 
 		 179 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  36.74 
 
 		 231 aa  109  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  43.8 
 
 		 123 aa  105  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  40.31 
 
 		 146 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  33.82 
 
 		 213 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  40.68 
 
 		 147 aa  98.6  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  42.37 
 
 		 147 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1874  hypothetical protein  32.43 
 
 		 225 aa  97.4  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  34.9 
 
 		 207 aa  96.3  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  42.06 
 
 		 156 aa  95.9  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  37.91 
 
 		 145 aa  93.6  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  42.74 
 
 		 167 aa  92.4  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  39.83 
 
 		 147 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  35 
 
 		 135 aa  87.4  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  35.29 
 
 		 145 aa  86.7  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  36.43 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  33.82 
 
 		 142 aa  78.2  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  34.43 
 
 		 134 aa  77.4  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  34.07 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  35.17 
 
 		 139 aa  74.7  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  33.57 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  34.75 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  31.54 
 
 		 280 aa  71.6  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  37.19 
 
 		 149 aa  71.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  31.72 
 
 		 143 aa  71.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  30.58 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  28.46 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  31.4 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  29.41 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  29.41 
 
 		 143 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  33.12 
 
 		 162 aa  62  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  30.41 
 
 		 151 aa  62  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  32.79 
 
 		 134 aa  62  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  27.56 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  31.85 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  27.42 
 
 		 272 aa  58.5  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  29.17 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  27.45 
 
 		 128 aa  54.7  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3722  Protein of unknown function DUF2147  27.56 
 
 		 143 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861772  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  30.95 
 
 		 133 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  26.53 
 
 		 145 aa  52.4  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4104  hypothetical protein  30.33 
 
 		 141 aa  52.4  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  26.61 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  28.26 
 
 		 148 aa  50.4  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4794  hypothetical protein  26.67 
 
 		 150 aa  49.3  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0246667  normal  0.215514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  27.52 
 
 		 138 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  28.8 
 
 		 137 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2874  putative signal peptide protein  33.6 
 
 		 157 aa  49.3  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000419101  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  27.91 
 
 		 111 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  28.1 
 
 		 119 aa  48.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4317  hypothetical protein  28.67 
 
 		 146 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  33.13 
 
 		 161 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.399726 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  26.62 
 
 		 127 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2807  putative signal peptide protein  32.93 
 
 		 161 aa  45.1  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29440  hypothetical protein  26.53 
 
 		 149 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809204  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  29.2 
 
 		 168 aa  44.7  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  28.86 
 
 		 129 aa  42.7  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09958  hypothetical protein  26.57 
 
 		 141 aa  42.7  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150312  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4322  putative signal peptide protein  26.24 
 
 		 144 aa  42  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338595  normal  0.0273369 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>