59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1874 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1874  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  462  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  58.96 
 
 		 167 aa  159  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  35.91 
 
 		 203 aa  111  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  34.62 
 
 		 202 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  32.96 
 
 		 178 aa  104  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  36.17 
 
 		 169 aa  102  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  35 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  35.92 
 
 		 165 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  33.54 
 
 		 199 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  31.75 
 
 		 213 aa  92.8  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  35.47 
 
 		 228 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  35.12 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  37.59 
 
 		 123 aa  89.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  34.07 
 
 		 204 aa  89.4  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  32.67 
 
 		 228 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  35.07 
 
 		 147 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  31.16 
 
 		 170 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  31.16 
 
 		 170 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  32.85 
 
 		 154 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  85.1  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  32.85 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  34.85 
 
 		 156 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  37.29 
 
 		 168 aa  77  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  32.06 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  31.37 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  31.62 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  31.25 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  33.86 
 
 		 136 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  34.72 
 
 		 134 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  32.56 
 
 		 162 aa  67.8  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  26.25 
 
 		 147 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  29.69 
 
 		 147 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  27.81 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  31.85 
 
 		 143 aa  64.7  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  30.43 
 
 		 138 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  33.65 
 
 		 143 aa  62  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  34.68 
 
 		 151 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  34.26 
 
 		 149 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  30.87 
 
 		 139 aa  60.5  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  31.97 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  32.99 
 
 		 142 aa  58.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  28.97 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  28.36 
 
 		 134 aa  54.7  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  32.39 
 
 		 133 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  31.78 
 
 		 134 aa  54.7  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  27.04 
 
 		 145 aa  52  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  34.07 
 
 		 168 aa  51.6  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4104  hypothetical protein  32.82 
 
 		 141 aa  52  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  31.82 
 
 		 137 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3722  Protein of unknown function DUF2147  34.74 
 
 		 143 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861772  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  25.76 
 
 		 111 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  28.12 
 
 		 136 aa  46.6  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0576  Protein of unknown function DUF2147  31.19 
 
 		 166 aa  46.2  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4794  hypothetical protein  26.87 
 
 		 150 aa  45.1  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0246667  normal  0.215514 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  30.69 
 
 		 140 aa  42.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>