113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1033 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  301  2.0000000000000002e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  41.22 
 
 
143 aa  101  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  35.1 
 
 
145 aa  98.6  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3486  hypothetical protein  34.97 
 
 
142 aa  86.3  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  35.07 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  35.16 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  36.67 
 
 
142 aa  80.1  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  28.57 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03893  putative signal peptide protein  29.45 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.536357 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4322  putative signal peptide protein  30.92 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338595  normal  0.0273369 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2874  putative signal peptide protein  39.84 
 
 
157 aa  73.9  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000419101  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0322  hypothetical protein  31.79 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3722  Protein of unknown function DUF2147  33.59 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861772  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0576  Protein of unknown function DUF2147  30.56 
 
 
166 aa  71.2  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  27.27 
 
 
168 aa  71.2  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2649  hypothetical protein  31.43 
 
 
166 aa  70.5  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.799269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  32.87 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0802  hypothetical protein  32.17 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0773  hypothetical protein  32.17 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1090  hypothetical protein  30 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177825  normal  0.714021 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  32.54 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3075  putative signal peptide protein  35.2 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0038  putative signal peptide protein  31.21 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274459  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09958  hypothetical protein  31.33 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150312  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0103  hypothetical protein  31.03 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1617  hypothetical protein  28.95 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000464775  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2631  putative signal peptide protein  32.8 
 
 
151 aa  67  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  0.77547 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1046  hypothetical protein  29.14 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.29497  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4654  hypothetical protein  29.8 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388163  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1493  hypothetical protein  29.14 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0161  hypothetical protein  29.14 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1005  hypothetical protein  29.14 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.660844  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2798  putative signal peptide protein  33.6 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00624822  normal  0.61981 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3041  conserved hypothetical signal peptide protein  32 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434971  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29440  hypothetical protein  26.53 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809204  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0944  hypothetical protein  32.47 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.502231  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0418  hypothetical protein  30.67 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130226  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1742  hypothetical protein  31.43 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00050816 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1435  hypothetical protein  28.48 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152926  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1033  hypothetical protein  29.86 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1513  hypothetical protein  29.86 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.715574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0566  hypothetical protein  32.5 
 
 
133 aa  62.8  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406238  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1489  hypothetical protein  29.86 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  hitchhiker  0.000316489 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  25.34 
 
 
161 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.399726 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0805  hypothetical protein  33.85 
 
 
186 aa  62  0.000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6081  hypothetical protein  29.46 
 
 
168 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  28.97 
 
 
203 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  33.61 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2807  putative signal peptide protein  24.66 
 
 
161 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1175  putative signal peptide protein  25.83 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1395  hypothetical protein  29.29 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0129  hypothetical protein  37.5 
 
 
188 aa  58.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.374028  normal  0.0265018 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1857  hypothetical protein  33.13 
 
 
173 aa  58.2  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000332835  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2551  putative lipoprotein  37.04 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846128  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1757  putative lipoprotein  31.06 
 
 
160 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.980329  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1716  putative signal peptide protein  27.89 
 
 
161 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1929  hypothetical protein  37 
 
 
153 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.612499  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1779  putative lipoprotein  37 
 
 
153 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  27.4 
 
 
199 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5549  hypothetical protein  28.06 
 
 
202 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.355042 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01791  hypothetical protein  26.98 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2925  hypothetical protein  34.13 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771304  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  27.97 
 
 
202 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2841  Protein of unknown function DUF2147  28.57 
 
 
170 aa  55.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  27.89 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0811  hypothetical protein  26.92 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1338  hypothetical protein  28.57 
 
 
146 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1885  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  54.3  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  28.35 
 
 
167 aa  54.7  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  27.01 
 
 
143 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  26.95 
 
 
178 aa  53.9  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  28.15 
 
 
228 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4088  hypothetical protein  28.44 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2647  hypothetical protein  29.41 
 
 
143 aa  51.2  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.694263  normal  0.835053 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  30.3 
 
 
204 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  25.34 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  26.83 
 
 
136 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  27.34 
 
 
156 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  28.69 
 
 
228 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3518  hypothetical protein  31.06 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.446687  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  28.69 
 
 
230 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  23.13 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  28.35 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  22.76 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  26.23 
 
 
204 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  28.1 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  28.1 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0593  hypothetical protein  24.6 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.438813 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0572  hypothetical protein  24.6 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4104  hypothetical protein  27.64 
 
 
141 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  24.41 
 
 
123 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  22.76 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2543  hypothetical protein  37.25 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  26.19 
 
 
179 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  29.49 
 
 
134 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  25.2 
 
 
154 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  31.3 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  29.87 
 
 
231 aa  42.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0523  hypothetical protein  34.57 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372875  hitchhiker  0.00154725 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>