54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0523 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0523  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  300  6.000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372875  hitchhiker  0.00154725 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0550  hypothetical protein  43.1 
 
 
148 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000170844 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0802  hypothetical protein  40.3 
 
 
144 aa  83.6  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0773  hypothetical protein  40.3 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2045  hypothetical protein  36.57 
 
 
127 aa  78.6  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000649119  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2293  hypothetical protein  38.81 
 
 
127 aa  77.8  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.401413  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0944  hypothetical protein  35.37 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.502231  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2348  hypothetical protein  35.82 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0044587  normal  0.12672 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01791  hypothetical protein  36.89 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0322  hypothetical protein  31.72 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3075  putative signal peptide protein  36.97 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2647  hypothetical protein  36.7 
 
 
143 aa  72  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.694263  normal  0.835053 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3486  hypothetical protein  32.87 
 
 
142 aa  72  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2649  hypothetical protein  31.67 
 
 
166 aa  71.2  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.799269 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1716  putative signal peptide protein  31.69 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2925  hypothetical protein  35.25 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771304  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0418  hypothetical protein  35.54 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130226  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2874  putative signal peptide protein  35.29 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000419101  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1493  hypothetical protein  31.76 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0161  hypothetical protein  31.76 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0103  hypothetical protein  31.54 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1005  hypothetical protein  31.76 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.660844  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1046  hypothetical protein  31.76 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.29497  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  30.67 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.399726 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2798  putative signal peptide protein  33.61 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00624822  normal  0.61981 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2807  putative signal peptide protein  29.58 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2631  putative signal peptide protein  35.83 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  0.77547 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3041  conserved hypothetical signal peptide protein  35 
 
 
151 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434971  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09958  hypothetical protein  32.88 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150312  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1779  putative lipoprotein  32.5 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1757  putative lipoprotein  32.5 
 
 
160 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.980329  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1929  hypothetical protein  32.5 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.612499  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2551  putative lipoprotein  33.33 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846128  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4654  hypothetical protein  29.66 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388163  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6081  hypothetical protein  28.1 
 
 
168 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1435  hypothetical protein  29.93 
 
 
153 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152926  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1617  hypothetical protein  27.27 
 
 
154 aa  57  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000464775  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1742  hypothetical protein  30.58 
 
 
153 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00050816 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0566  hypothetical protein  29.17 
 
 
133 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406238  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1395  hypothetical protein  31.67 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1033  hypothetical protein  30.58 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1489  hypothetical protein  30.58 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  hitchhiker  0.000316489 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1513  hypothetical protein  30.58 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.715574  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29440  hypothetical protein  28.57 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809204  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2648  hypothetical protein  29.27 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.812094 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5549  hypothetical protein  28.86 
 
 
202 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.355042 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  28.67 
 
 
145 aa  50.1  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0038  putative signal peptide protein  47.83 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274459  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0966  hypothetical protein  31.33 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3518  hypothetical protein  27.73 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.446687  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  34.57 
 
 
148 aa  44.3  0.0005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1175  putative signal peptide protein  25 
 
 
148 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  27.97 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  39.13 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>