69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_2045 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_2045  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  255  2e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000649119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2348  hypothetical protein  98.43 
 
 		 127 aa  252  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0044587  normal  0.12672 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2293  hypothetical protein  68.5 
 
 		 127 aa  184  3e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.401413  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0550  hypothetical protein  43.41 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000170844 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2874  putative signal peptide protein  39.5 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000419101  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0322  hypothetical protein  36.42 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3075  putative signal peptide protein  37.29 
 
 		 153 aa  76.6  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0802  hypothetical protein  33.8 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0773  hypothetical protein  33.8 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  38.89 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.399726 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1716  putative signal peptide protein  38.73 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2807  putative signal peptide protein  37.25 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4088  hypothetical protein  36.75 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1338  hypothetical protein  34.03 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0161  hypothetical protein  38.3 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1005  hypothetical protein  38.3 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.660844  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1493  hypothetical protein  38.3 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1046  hypothetical protein  38.3 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.29497  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2798  putative signal peptide protein  36.44 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00624822  normal  0.61981 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0811  hypothetical protein  35.17 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0572  hypothetical protein  37.07 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2925  hypothetical protein  40.48 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6081  hypothetical protein  37.82 
 
 		 168 aa  70.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0593  hypothetical protein  37.07 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.438813 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0523  hypothetical protein  36.57 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372875  hitchhiker  0.00154725 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01791  hypothetical protein  37.82 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2551  putative lipoprotein  40.34 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846128  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1757  putative lipoprotein  39.83 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.980329  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1779  putative lipoprotein  39.83 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1929  hypothetical protein  39.83 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.612499  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4654  hypothetical protein  35.17 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388163  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1885  hypothetical protein  36.08 
 
 		 128 aa  67  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2631  putative signal peptide protein  36.44 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  0.77547 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2647  hypothetical protein  38.39 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.694263  normal  0.835053 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3041  conserved hypothetical signal peptide protein  36.44 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0103  hypothetical protein  31.21 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0944  hypothetical protein  32.62 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.502231  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1435  hypothetical protein  34.04 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152926  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5549  hypothetical protein  32.14 
 
 		 202 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.355042 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1033  hypothetical protein  35.61 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1513  hypothetical protein  35.61 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.715574  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1489  hypothetical protein  35.61 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  hitchhiker  0.000316489 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1742  hypothetical protein  36.36 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00050816 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1395  hypothetical protein  35.11 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09958  hypothetical protein  31.94 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150312  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3486  hypothetical protein  35.65 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2649  hypothetical protein  28.57 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  31.94 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3518  hypothetical protein  31.62 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.446687  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1124  hypothetical protein  37.21 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0418  hypothetical protein  33.05 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  29.01 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2244  hypothetical protein  29.91 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1617  hypothetical protein  26.52 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000464775  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0919  hypothetical protein  30.19 
 
 		 126 aa  50.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539754  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0566  hypothetical protein  27.12 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406238  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29440  hypothetical protein  30 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809204  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  27.86 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1651  hypothetical protein  28.1 
 
 		 218 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2579  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164818  hitchhiker  0.0000131473 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5099  hypothetical protein  27.87 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0959389  normal  0.741523 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1419  hypothetical protein  42.19 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.874564  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  35.71 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4468  hypothetical protein  27.73 
 
 		 218 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  26.72 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0966  hypothetical protein  35.62 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6954  hypothetical protein  35.71 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3837  hypothetical protein  27.78 
 
 		 217 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0663  hypothetical protein  40.58 
 
 		 113 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>