46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2579 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2579  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  276  8e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164818  hitchhiker  0.0000131473 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1885  hypothetical protein  58.93 
 
 		 128 aa  145  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0919  hypothetical protein  56.07 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539754  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2244  hypothetical protein  55.14 
 
 		 126 aa  120  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  41.41 
 
 		 129 aa  98.2  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  36.03 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1124  hypothetical protein  41.11 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  31.29 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2293  hypothetical protein  35.42 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.401413  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2925  hypothetical protein  35.48 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2045  hypothetical protein  30.58 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000649119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2348  hypothetical protein  29.75 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0044587  normal  0.12672 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0322  hypothetical protein  35.71 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  35.34 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  28.79 
 
 		 127 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  32.06 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  31.11 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  35.71 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  30.94 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0773  hypothetical protein  41.67 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  37.63 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0802  hypothetical protein  41.67 
 
 		 144 aa  51.2  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09958  hypothetical protein  26.81 
 
 		 141 aa  50.4  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150312  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  32.11 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0965  hypothetical protein  30.77 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.996069  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2874  putative signal peptide protein  33.64 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000419101  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5099  hypothetical protein  42.86 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0959389  normal  0.741523 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1118  hypothetical protein  30 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  36.17 
 
 		 280 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2807  putative signal peptide protein  33.33 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4104  hypothetical protein  29.51 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  28.37 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  27.27 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  26.24 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  27.63 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  35.11 
 
 		 283 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  28.57 
 
 		 161 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.399726 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  38.67 
 
 		 143 aa  42  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5549  hypothetical protein  31.51 
 
 		 202 aa  41.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.355042 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01791  hypothetical protein  35.38 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  31.13 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  29.41 
 
 		 213 aa  40.8  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  32.99 
 
 		 272 aa  40  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1338  hypothetical protein  27.5 
 
 		 146 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0663  hypothetical protein  28.83 
 
 		 113 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3075  putative signal peptide protein  28.93 
 
 		 153 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>