63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1885 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1885  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  261  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2579  hypothetical protein  59.81 
 
 		 134 aa  130  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164818  hitchhiker  0.0000131473 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0919  hypothetical protein  43.93 
 
 		 126 aa  94  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539754  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2244  hypothetical protein  44.53 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  35.71 
 
 		 129 aa  84  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  35.71 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2045  hypothetical protein  36.08 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000649119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2348  hypothetical protein  36.08 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0044587  normal  0.12672 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2925  hypothetical protein  50.79 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09958  hypothetical protein  30.28 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150312  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1124  hypothetical protein  40.91 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2293  hypothetical protein  34.02 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.401413  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  33.1 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0965  hypothetical protein  35.66 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.996069  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  33.78 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2874  putative signal peptide protein  34.43 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000419101  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6954  hypothetical protein  36.07 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  39.39 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  29.58 
 
 		 148 aa  57  0.00000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5099  hypothetical protein  32.26 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0959389  normal  0.741523 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1118  hypothetical protein  34.11 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1419  hypothetical protein  35 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.874564  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  32.62 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0663  hypothetical protein  36.36 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0322  hypothetical protein  29.25 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3486  hypothetical protein  28.87 
 
 		 142 aa  52  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  29.6 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3075  putative signal peptide protein  33.06 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  30.88 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  30.16 
 
 		 168 aa  50.4  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  30 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  27.73 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  24.41 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0802  hypothetical protein  43.33 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0773  hypothetical protein  43.33 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  29.91 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  29.91 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2631  putative signal peptide protein  32.38 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  0.77547 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  29.93 
 
 		 162 aa  47  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3041  conserved hypothetical signal peptide protein  32.38 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  28.12 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  26.9 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  28.78 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01791  hypothetical protein  41.54 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2798  putative signal peptide protein  31.73 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00624822  normal  0.61981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  32.32 
 
 		 140 aa  43.5  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3518  hypothetical protein  33.61 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.446687  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  29.5 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  30 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1046  hypothetical protein  29.79 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.29497  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0550  hypothetical protein  29.52 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000170844 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1005  hypothetical protein  29.79 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.660844  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0161  hypothetical protein  29.79 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1493  hypothetical protein  29.79 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0103  hypothetical protein  29.29 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  29.77 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  26.98 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2649  hypothetical protein  24.64 
 
 		 166 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799269 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  31.13 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6081  hypothetical protein  33.8 
 
 		 168 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  30.28 
 
 		 300 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0418  hypothetical protein  27.87 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  30.56 
 
 		 280 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>