41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0663 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0663  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  226  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0965  hypothetical protein  61.95 
 
 		 112 aa  153  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.996069  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1118  hypothetical protein  61.95 
 
 		 112 aa  151  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1419  hypothetical protein  65.18 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.874564  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6954  hypothetical protein  54.05 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5099  hypothetical protein  50 
 
 		 111 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0959389  normal  0.741523 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2654  hypothetical protein  44.74 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0627  hypothetical protein  42.11 
 
 		 115 aa  84  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  39.84 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0625  hypothetical protein  36.84 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  38.32 
 
 		 136 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  34.43 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  35.29 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  35.29 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  37.4 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  37.4 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  37.25 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  30.28 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  36.11 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  35.29 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1885  hypothetical protein  36.36 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  31.93 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1124  hypothetical protein  31.87 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  34.29 
 
 		 272 aa  50.4  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  30.53 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4317  hypothetical protein  33.58 
 
 		 146 aa  47  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  27.74 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  32.52 
 
 		 128 aa  44.3  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  27.74 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2293  hypothetical protein  33.06 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.401413  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  33.68 
 
 		 280 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2045  hypothetical protein  34.15 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000649119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  28.79 
 
 		 136 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  32.14 
 
 		 300 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  32.98 
 
 		 119 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0919  hypothetical protein  28.97 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539754  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2244  hypothetical protein  28.97 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  30.33 
 
 		 283 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4104  hypothetical protein  26.67 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2348  hypothetical protein  40.58 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0044587  normal  0.12672 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>