122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3794 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  274  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  55.56 
 
 		 139 aa  140  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  50.39 
 
 		 143 aa  138  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  41.74 
 
 		 147 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  40.35 
 
 		 146 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  41.23 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  36.55 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  40.65 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  39.47 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  40.32 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4104  hypothetical protein  37.39 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  37.4 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  33.09 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  36.07 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  38.17 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  35.16 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  40.52 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  32.35 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  37.01 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  31.16 
 
 		 145 aa  72  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  39.13 
 
 		 162 aa  72  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  36.96 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  30.66 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  35.34 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  33.58 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  39.66 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  30.6 
 
 		 207 aa  70.5  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  35.34 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3722  Protein of unknown function DUF2147  32.81 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861772  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  34.04 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  35.25 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  35.04 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  33.57 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1090  hypothetical protein  30.82 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177825  normal  0.714021 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  35.77 
 
 		 170 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  35.77 
 
 		 170 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4322  putative signal peptide protein  30.71 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338595  normal  0.0273369 
 
 
-
 
NC_003296  RS03893  putative signal peptide protein  28.26 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.536357 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  29.79 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  34.96 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  31.62 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  33.9 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  33.61 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0576  Protein of unknown function DUF2147  32.26 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  30.83 
 
 		 204 aa  62  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0038  putative signal peptide protein  29.17 
 
 		 154 aa  62  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  30.66 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  32.79 
 
 		 230 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  29.71 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1874  hypothetical protein  28.38 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0129  hypothetical protein  34.45 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.374028  normal  0.0265018 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  30.43 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1338  hypothetical protein  41.18 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  30.94 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  29.58 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0572  hypothetical protein  34.96 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0593  hypothetical protein  34.96 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.438813 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2807  putative signal peptide protein  31.39 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  30.65 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4654  hypothetical protein  32.12 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388163  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  31.97 
 
 		 300 aa  54.7  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1435  hypothetical protein  31.16 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152926  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  29.93 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.399726 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0811  hypothetical protein  31.97 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01791  hypothetical protein  36.22 
 
 		 149 aa  52.8  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0663  hypothetical protein  32.48 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  31.54 
 
 		 283 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  30.14 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3486  hypothetical protein  27.86 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1742  hypothetical protein  32.28 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00050816 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1033  hypothetical protein  31.06 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1513  hypothetical protein  31.06 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.715574  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1489  hypothetical protein  31.06 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  hitchhiker  0.000316489 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  35.06 
 
 		 231 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1395  hypothetical protein  31.01 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1598  hypothetical protein  25.53 
 
 		 144 aa  50.1  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  28.67 
 
 		 136 aa  50.4  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1046  hypothetical protein  30.15 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.29497  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1493  hypothetical protein  30.15 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0161  hypothetical protein  30.15 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1005  hypothetical protein  30.15 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.660844  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  29.55 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2551  putative lipoprotein  31.88 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846128  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  27.82 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4088  hypothetical protein  31.3 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0418  hypothetical protein  32 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29440  hypothetical protein  31.39 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809204  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1124  hypothetical protein  28.91 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  30.4 
 
 		 280 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  28.23 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0550  hypothetical protein  29.82 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000170844 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3518  hypothetical protein  39.73 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.446687  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  26.87 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2649  hypothetical protein  27.82 
 
 		 166 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799269 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4317  hypothetical protein  28.46 
 
 		 146 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1716  putative signal peptide protein  29.93 
 
 		 161 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2244  hypothetical protein  30.58 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0965  hypothetical protein  31.06 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.996069  normal  0.580537 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>