75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3426 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  363  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  57.23 
 
 		 203 aa  192  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  51.7 
 
 		 204 aa  189  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  52.29 
 
 		 204 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  51.2 
 
 		 199 aa  176  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  46.51 
 
 		 202 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  52.08 
 
 		 228 aa  169  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  49.35 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  50.69 
 
 		 230 aa  164  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  56.2 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  53.28 
 
 		 165 aa  144  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  53.17 
 
 		 179 aa  134  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  53.17 
 
 		 170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  53.17 
 
 		 170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  52.42 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  46.09 
 
 		 147 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  46.34 
 
 		 147 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  47.06 
 
 		 147 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  42.75 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1874  hypothetical protein  32.96 
 
 		 225 aa  104  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  40.67 
 
 		 145 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  38.67 
 
 		 145 aa  102  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  39.72 
 
 		 156 aa  101  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  41.46 
 
 		 123 aa  99.8  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  37.34 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  44.54 
 
 		 136 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  36.3 
 
 		 167 aa  90.9  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  32.98 
 
 		 213 aa  89.7  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  34.36 
 
 		 231 aa  89.7  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  38.93 
 
 		 147 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  39.73 
 
 		 147 aa  84.3  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  36.62 
 
 		 135 aa  84.7  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  36.42 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  38.24 
 
 		 168 aa  80.9  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  38.3 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  34.68 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  42.5 
 
 		 134 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  34.53 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  38.33 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  28.19 
 
 		 143 aa  67.4  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  35.25 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  31.13 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  35.71 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  31.09 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  29.58 
 
 		 142 aa  63.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  30.77 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  26.45 
 
 		 138 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  26.17 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  31.2 
 
 		 300 aa  58.2  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  27.73 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4104  hypothetical protein  32.23 
 
 		 141 aa  57.4  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  31.25 
 
 		 143 aa  57.4  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  33.07 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  30.56 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  26.95 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  30.2 
 
 		 151 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  26.4 
 
 		 283 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4317  hypothetical protein  28.67 
 
 		 146 aa  51.2  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  31.82 
 
 		 148 aa  51.2  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  29.01 
 
 		 272 aa  50.8  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1124  hypothetical protein  23.36 
 
 		 137 aa  48.1  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  30.17 
 
 		 145 aa  48.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2874  putative signal peptide protein  33.07 
 
 		 157 aa  48.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000419101  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3722  Protein of unknown function DUF2147  27.12 
 
 		 143 aa  47.8  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861772  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  29.37 
 
 		 140 aa  47.8  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4794  hypothetical protein  26.23 
 
 		 150 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0246667  normal  0.215514 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  31.06 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  30.71 
 
 		 136 aa  45.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2807  putative signal peptide protein  25.16 
 
 		 161 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1419  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  43.5  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.874564  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0663  hypothetical protein  35.29 
 
 		 113 aa  42.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6954  hypothetical protein  25 
 
 		 112 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  26.12 
 
 		 127 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  27.1 
 
 		 161 aa  42  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.399726 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0038  putative signal peptide protein  25 
 
 		 154 aa  41.2  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274459  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>