69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2639 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  69.45 
 
 		 280 aa  332  5e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  44.74 
 
 		 272 aa  204  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  73.27 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  64.95 
 
 		 262 aa  135  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  44.9 
 
 		 119 aa  87  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  34.75 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  33.58 
 
 		 135 aa  81.3  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  31.82 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  34.4 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  32.28 
 
 		 134 aa  77.4  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  36.75 
 
 		 147 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  30.99 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  33.08 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  37 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  35.04 
 
 		 147 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  37 
 
 		 138 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  30.77 
 
 		 203 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  29.63 
 
 		 134 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  32.84 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  37.27 
 
 		 133 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  37 
 
 		 137 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  33.05 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  36.73 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  30.25 
 
 		 204 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  31.15 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4794  hypothetical protein  32.08 
 
 		 150 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0246667  normal  0.215514 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  28.46 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  34.71 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  31.4 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  30.89 
 
 		 127 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  36.7 
 
 		 136 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  30 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  28.93 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  28.1 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  36 
 
 		 139 aa  63.9  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  30.47 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0919  hypothetical protein  42.45 
 
 		 126 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539754  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2244  hypothetical protein  41.12 
 
 		 126 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1598  hypothetical protein  29.25 
 
 		 144 aa  60.8  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  33.04 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  33.8 
 
 		 147 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  30.99 
 
 		 143 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  29.46 
 
 		 129 aa  57.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  34.59 
 
 		 146 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0129  hypothetical protein  31.62 
 
 		 188 aa  57  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.374028  normal  0.0265018 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3056  hypothetical protein  27.78 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  27.5 
 
 		 165 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  30 
 
 		 136 aa  53.1  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1124  hypothetical protein  27.21 
 
 		 137 aa  53.1  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  29.41 
 
 		 179 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  28.7 
 
 		 162 aa  52  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  26.4 
 
 		 178 aa  52  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  32.48 
 
 		 168 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  29.41 
 
 		 170 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  29.41 
 
 		 170 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  27.73 
 
 		 149 aa  49.7  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  28.57 
 
 		 145 aa  49.3  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  27.27 
 
 		 154 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  32.17 
 
 		 134 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  30 
 
 		 151 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5099  hypothetical protein  32.2 
 
 		 111 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0959389  normal  0.741523 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2925  hypothetical protein  47.62 
 
 		 147 aa  46.6  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6954  hypothetical protein  30.25 
 
 		 112 aa  45.8  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  26.55 
 
 		 140 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  24.79 
 
 		 167 aa  43.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>