86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0912 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  291  2e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  86.21 
 
 		 145 aa  260  6e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  65.29 
 
 		 123 aa  179  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  61.22 
 
 		 146 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  62.1 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  61.9 
 
 		 147 aa  168  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  61.34 
 
 		 147 aa  157  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  56.67 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  38.85 
 
 		 203 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  39.31 
 
 		 169 aa  108  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  38.76 
 
 		 204 aa  103  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  37.86 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  35.97 
 
 		 199 aa  101  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  38.67 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  43.07 
 
 		 134 aa  101  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  36.55 
 
 		 165 aa  100  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  40.58 
 
 		 202 aa  99  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  37.76 
 
 		 213 aa  99.4  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  38.89 
 
 		 207 aa  98.6  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  35.81 
 
 		 204 aa  97.1  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  42.98 
 
 		 179 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  39.29 
 
 		 147 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  38.69 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  41.13 
 
 		 154 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  40.15 
 
 		 134 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  42.15 
 
 		 170 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  38.57 
 
 		 147 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  42.15 
 
 		 170 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  33.09 
 
 		 135 aa  92  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  41.32 
 
 		 231 aa  91.3  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  38.46 
 
 		 138 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  41.03 
 
 		 136 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  39.39 
 
 		 228 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  38.02 
 
 		 228 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  35.48 
 
 		 167 aa  87.8  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  41.13 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  38.02 
 
 		 230 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  36.97 
 
 		 149 aa  87  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  35.97 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  35.38 
 
 		 137 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  35.25 
 
 		 133 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  33.33 
 
 		 283 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  36.89 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  29.86 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1874  hypothetical protein  31.37 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  31.11 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  32.81 
 
 		 280 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  35.48 
 
 		 272 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  34.92 
 
 		 168 aa  73.6  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1598  hypothetical protein  31.51 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  33.9 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  33.33 
 
 		 300 aa  70.5  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  29.6 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  34.75 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  29.29 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  33.06 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4794  hypothetical protein  30.25 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0246667  normal  0.215514 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3722  Protein of unknown function DUF2147  27.64 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861772  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1124  hypothetical protein  35.24 
 
 		 137 aa  62  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  27.54 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  30.88 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  27.08 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  28.81 
 
 		 262 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4104  hypothetical protein  31.75 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  28.67 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  25.34 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0129  hypothetical protein  28.81 
 
 		 188 aa  50.4  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.374028  normal  0.0265018 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4322  putative signal peptide protein  22.79 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338595  normal  0.0273369 
 
 
-
 
NC_003296  RS03893  putative signal peptide protein  23.57 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.536357 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4317  hypothetical protein  27.27 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0550  hypothetical protein  27.34 
 
 		 148 aa  47.4  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000170844 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2874  putative signal peptide protein  34.52 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000419101  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0322  hypothetical protein  26.75 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0944  hypothetical protein  28.77 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.502231  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2925  hypothetical protein  31.71 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  27.61 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3075  putative signal peptide protein  30.47 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0576  Protein of unknown function DUF2147  30.89 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2244  hypothetical protein  28.23 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1885  hypothetical protein  28.1 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3041  conserved hypothetical signal peptide protein  28.24 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5099  hypothetical protein  27.27 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0959389  normal  0.741523 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2631  putative signal peptide protein  28.24 
 
 		 151 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  0.77547 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  26.43 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  27.48 
 
 		 168 aa  40.4  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>