74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5160 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  413  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  52.54 
 
 		 202 aa  197  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  58.94 
 
 		 203 aa  191  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  51.7 
 
 		 178 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  51.14 
 
 		 204 aa  188  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  55.63 
 
 		 199 aa  184  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  50.94 
 
 		 228 aa  176  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  51.3 
 
 		 230 aa  174  8e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  52.41 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  53.08 
 
 		 169 aa  145  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  50 
 
 		 165 aa  136  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  48 
 
 		 154 aa  126  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  49.19 
 
 		 179 aa  123  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  48.39 
 
 		 170 aa  121  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  48.39 
 
 		 170 aa  121  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  44.53 
 
 		 147 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  46.72 
 
 		 147 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  41.86 
 
 		 146 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  39.5 
 
 		 123 aa  101  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  43.59 
 
 		 147 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  37.16 
 
 		 145 aa  99  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  37.24 
 
 		 156 aa  98.6  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  35.81 
 
 		 145 aa  96.7  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  33.52 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1874  hypothetical protein  34.18 
 
 		 225 aa  92.8  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  38.3 
 
 		 134 aa  92.8  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  36.62 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  35.84 
 
 		 231 aa  92  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  38.21 
 
 		 135 aa  90.9  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  43.33 
 
 		 168 aa  89.7  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  38.41 
 
 		 147 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  37.68 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  36.67 
 
 		 167 aa  80.9  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  40.52 
 
 		 136 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  30.07 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  35 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  36.59 
 
 		 139 aa  77  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  38.4 
 
 		 134 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  32.31 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  28.57 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  38.89 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  29.77 
 
 		 283 aa  71.6  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  32.14 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  35.25 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  33.86 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3722  Protein of unknown function DUF2147  31.15 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861772  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  32.48 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  31.97 
 
 		 119 aa  60.8  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  28.23 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  29.05 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  32.84 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  32.77 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  29.66 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  27.34 
 
 		 145 aa  57.4  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  32.76 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  29.37 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  26.83 
 
 		 137 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  29.01 
 
 		 111 aa  51.6  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4794  hypothetical protein  29.31 
 
 		 150 aa  51.6  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0246667  normal  0.215514 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  31.2 
 
 		 136 aa  51.6  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  29.17 
 
 		 262 aa  51.6  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0038  putative signal peptide protein  28.71 
 
 		 154 aa  49.7  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274459  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  28.99 
 
 		 168 aa  48.9  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4104  hypothetical protein  33.06 
 
 		 141 aa  48.9  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  26.23 
 
 		 148 aa  48.9  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  24.46 
 
 		 138 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  26.24 
 
 		 127 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03893  putative signal peptide protein  24.59 
 
 		 156 aa  46.2  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.536357 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29440  hypothetical protein  33.05 
 
 		 149 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809204  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2807  putative signal peptide protein  26.99 
 
 		 161 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4317  hypothetical protein  28.45 
 
 		 146 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4322  putative signal peptide protein  30.28 
 
 		 144 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338595  normal  0.0273369 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  26.9 
 
 		 161 aa  42.4  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.399726 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0129  hypothetical protein  26.98 
 
 		 188 aa  42  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.374028  normal  0.0265018 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>