39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3056 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3056  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  295  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4317  hypothetical protein  50.77 
 
 
146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  43.55 
 
 
136 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1598  hypothetical protein  37.14 
 
 
144 aa  97.8  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4794  hypothetical protein  38.32 
 
 
150 aa  87.4  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0246667  normal  0.215514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  31.58 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  31.09 
 
 
137 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  28.17 
 
 
129 aa  63.5  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  31.03 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  34.27 
 
 
128 aa  58.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  27.41 
 
 
283 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  26.13 
 
 
300 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  29.73 
 
 
272 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  31.82 
 
 
136 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  29.66 
 
 
129 aa  53.5  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  30.83 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  29.79 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  32.56 
 
 
127 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  34.48 
 
 
146 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  33.81 
 
 
147 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  28.33 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  30.09 
 
 
111 aa  50.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  30 
 
 
119 aa  50.4  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  27.01 
 
 
135 aa  50.4  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  23.21 
 
 
280 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  25.64 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  27.14 
 
 
139 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  26.43 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  26.28 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  26.28 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  25.44 
 
 
147 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  26.67 
 
 
202 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  21.55 
 
 
123 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  24.58 
 
 
146 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  26.23 
 
 
167 aa  44.7  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  25.17 
 
 
204 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  24.56 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1124  hypothetical protein  25.69 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>