84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5701 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  226  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  73.87 
 
 		 137 aa  174  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  72.97 
 
 		 133 aa  174  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  73.58 
 
 		 138 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  56.88 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  42 
 
 		 127 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  37.7 
 
 		 123 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  39.32 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  36.89 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  38.78 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  37 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  34.78 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  34.19 
 
 		 147 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  34.95 
 
 		 300 aa  72  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  36.13 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  39.45 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  35.09 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  35.83 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  37.72 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  33.04 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  32.26 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  37.7 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1598  hypothetical protein  30.17 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4794  hypothetical protein  33.94 
 
 		 150 aa  67  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0246667  normal  0.215514 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  33.04 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1124  hypothetical protein  35.35 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  31.09 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  34.51 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  32 
 
 		 272 aa  61.6  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  34.69 
 
 		 262 aa  61.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  35.35 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  34.51 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  33.61 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  36.28 
 
 		 146 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  33.9 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  29.6 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2654  hypothetical protein  34.31 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  32.79 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  32.79 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  34.38 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  30.97 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2244  hypothetical protein  37.27 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  29.6 
 
 		 199 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  29.75 
 
 		 204 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  33.61 
 
 		 165 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  32.23 
 
 		 213 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  29.01 
 
 		 204 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  31.15 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0663  hypothetical protein  36.27 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0919  hypothetical protein  36.36 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539754  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6954  hypothetical protein  34.55 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0627  hypothetical protein  31.37 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3056  hypothetical protein  30.09 
 
 		 143 aa  50.8  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  30.83 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2579  hypothetical protein  36.96 
 
 		 134 aa  50.1  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164818  hitchhiker  0.0000131473 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1874  hypothetical protein  25.76 
 
 		 225 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1419  hypothetical protein  32.35 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.874564  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  33.05 
 
 		 207 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0625  hypothetical protein  30.39 
 
 		 100 aa  49.7  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  31.93 
 
 		 231 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0965  hypothetical protein  35.45 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.996069  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4317  hypothetical protein  28.95 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  30.77 
 
 		 202 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  27.64 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  28.12 
 
 		 228 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4104  hypothetical protein  30.25 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1885  hypothetical protein  28.32 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2798  putative signal peptide protein  40 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00624822  normal  0.61981 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  27.87 
 
 		 230 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1118  hypothetical protein  34.55 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  25.41 
 
 		 228 aa  47  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5099  hypothetical protein  31.68 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0959389  normal  0.741523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  27.64 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  27.97 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2925  hypothetical protein  39.71 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  28.23 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  28.23 
 
 		 154 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  44.44 
 
 		 168 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  27.78 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  27.5 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2874  putative signal peptide protein  34.78 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000419101  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5549  hypothetical protein  40.32 
 
 		 202 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.355042 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>