63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1598 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1598  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  295  2e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4794  hypothetical protein  50 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0246667  normal  0.215514 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  44.53 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3056  hypothetical protein  40.57 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4317  hypothetical protein  37.88 
 
 		 146 aa  94  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  31.51 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  30.08 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  30 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  28.33 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  30.17 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  30.28 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  28.19 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  29.25 
 
 		 280 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  31.16 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  29.36 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  29.75 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  32.86 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  28.24 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  28.17 
 
 		 156 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  26.05 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  29.92 
 
 		 283 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  26.39 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  26.89 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  28.68 
 
 		 272 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  26.36 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  27.59 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  26.32 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  31.97 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  31.97 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  26.05 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  30.5 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  25.47 
 
 		 300 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  29.14 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  28.19 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  27.81 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  28.93 
 
 		 179 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  25.58 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  28.26 
 
 		 204 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  26.11 
 
 		 202 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  28.69 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  26.89 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  22.31 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  29.1 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  29.41 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  26.05 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  26.89 
 
 		 119 aa  47  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0129  hypothetical protein  27.68 
 
 		 188 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.374028  normal  0.0265018 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  25.86 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  26.53 
 
 		 207 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  22.95 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  25.35 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  26.02 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1124  hypothetical protein  22.64 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  23.68 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  26.35 
 
 		 168 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  24.44 
 
 		 203 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  39.13 
 
 		 262 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  24.43 
 
 		 228 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  21.43 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2654  hypothetical protein  26.36 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  23.53 
 
 		 199 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0627  hypothetical protein  26.36 
 
 		 115 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  22.82 
 
 		 145 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>