68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6942 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  407  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  59.39 
 
 		 204 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  60.39 
 
 		 228 aa  208  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  56.1 
 
 		 203 aa  205  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  60.67 
 
 		 230 aa  205  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  56.44 
 
 		 199 aa  205  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  60.69 
 
 		 228 aa  202  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  53.7 
 
 		 204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  46.51 
 
 		 178 aa  171  5e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  51.41 
 
 		 169 aa  160  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  50 
 
 		 165 aa  155  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  54.84 
 
 		 170 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  54.84 
 
 		 170 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  51.18 
 
 		 154 aa  142  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  53.23 
 
 		 179 aa  140  9e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  43.44 
 
 		 147 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  45.76 
 
 		 147 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  41.13 
 
 		 123 aa  107  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  42.28 
 
 		 146 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1874  hypothetical protein  34.62 
 
 		 225 aa  104  8e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  41.27 
 
 		 147 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  40.58 
 
 		 145 aa  99  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  40.65 
 
 		 156 aa  98.2  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  39.31 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  35.42 
 
 		 213 aa  95.1  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  39.52 
 
 		 167 aa  92.8  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  36.62 
 
 		 145 aa  93.2  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  38.89 
 
 		 207 aa  91.7  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  40.14 
 
 		 168 aa  89.4  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  38.24 
 
 		 135 aa  86.3  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  36.55 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  33.58 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  35.81 
 
 		 147 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  39.5 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  35.21 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  35.92 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  33.08 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  32.23 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  29.08 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  35.77 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  31.62 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  30.28 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  34.46 
 
 		 143 aa  67.4  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  30.4 
 
 		 300 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4794  hypothetical protein  32.79 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0246667  normal  0.215514 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  31.45 
 
 		 272 aa  61.6  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  31.51 
 
 		 162 aa  60.8  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  29.51 
 
 		 149 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  30.5 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  28.29 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  30.46 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3722  Protein of unknown function DUF2147  28 
 
 		 143 aa  57.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861772  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  27.97 
 
 		 148 aa  57  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  31.01 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  28.69 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  30.83 
 
 		 134 aa  53.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4317  hypothetical protein  28.85 
 
 		 146 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  28 
 
 		 119 aa  51.6  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  28.67 
 
 		 138 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1598  hypothetical protein  26.11 
 
 		 144 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  24.31 
 
 		 145 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  30.77 
 
 		 111 aa  48.5  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  28.46 
 
 		 133 aa  48.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  26.15 
 
 		 137 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4104  hypothetical protein  29.6 
 
 		 141 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  26.32 
 
 		 127 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  29.71 
 
 		 168 aa  42.7  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  28.26 
 
 		 129 aa  42  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>