107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3041 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3041  conserved hypothetical signal peptide protein  100 
 
 		 151 aa  308  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2631  putative signal peptide protein  99.34 
 
 		 151 aa  307  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  0.77547 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2798  putative signal peptide protein  75 
 
 		 152 aa  197  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00624822  normal  0.61981 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2874  putative signal peptide protein  64.52 
 
 		 157 aa  169  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000419101  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3075  putative signal peptide protein  58.11 
 
 		 153 aa  165  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1046  hypothetical protein  55.19 
 
 		 153 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.29497  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1493  hypothetical protein  55.19 
 
 		 153 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0161  hypothetical protein  55.19 
 
 		 153 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1005  hypothetical protein  55.19 
 
 		 153 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.660844  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4654  hypothetical protein  56 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388163  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1716  putative signal peptide protein  54.67 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1435  hypothetical protein  55.1 
 
 		 153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152926  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2807  putative signal peptide protein  57.53 
 
 		 161 aa  151  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  56.85 
 
 		 161 aa  150  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.399726 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1033  hypothetical protein  57.78 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1513  hypothetical protein  57.78 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.715574  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1489  hypothetical protein  57.78 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  hitchhiker  0.000316489 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1742  hypothetical protein  58.78 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00050816 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1395  hypothetical protein  58.46 
 
 		 153 aa  146  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2551  putative lipoprotein  57.34 
 
 		 153 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846128  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1757  putative lipoprotein  56.64 
 
 		 160 aa  143  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.980329  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1929  hypothetical protein  56.64 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.612499  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0418  hypothetical protein  54.47 
 
 		 147 aa  143  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1779  putative lipoprotein  56.64 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0322  hypothetical protein  45.75 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1338  hypothetical protein  49.29 
 
 		 146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0103  hypothetical protein  46.1 
 
 		 174 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01791  hypothetical protein  53.23 
 
 		 149 aa  126  8.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0802  hypothetical protein  51.47 
 
 		 144 aa  125  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0773  hypothetical protein  51.47 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6081  hypothetical protein  43.65 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3518  hypothetical protein  45.6 
 
 		 144 aa  120  8e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.446687  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2649  hypothetical protein  45.38 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799269 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4088  hypothetical protein  47.69 
 
 		 144 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5549  hypothetical protein  43.92 
 
 		 202 aa  116  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.355042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0811  hypothetical protein  45 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1175  putative signal peptide protein  43.26 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0593  hypothetical protein  47.24 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.438813 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0572  hypothetical protein  47.24 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3486  hypothetical protein  44.53 
 
 		 142 aa  110  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0550  hypothetical protein  40.16 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000170844 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2925  hypothetical protein  50.39 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09958  hypothetical protein  41.43 
 
 		 141 aa  107  7.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150312  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0944  hypothetical protein  41.78 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.502231  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29440  hypothetical protein  39.01 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809204  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2647  hypothetical protein  43.9 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.694263  normal  0.835053 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1651  hypothetical protein  37.82 
 
 		 218 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1617  hypothetical protein  35.83 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000464775  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0566  hypothetical protein  35.83 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406238  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1465  hypothetical protein  38.84 
 
 		 214 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0300883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3837  hypothetical protein  38.71 
 
 		 217 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4468  hypothetical protein  38.81 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  39.52 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  31.79 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  34.01 
 
 		 168 aa  73.9  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  32.17 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  30.56 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  32.33 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  34.25 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2045  hypothetical protein  35.86 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000649119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2348  hypothetical protein  35.97 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0044587  normal  0.12672 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0523  hypothetical protein  35 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372875  hitchhiker  0.00154725 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2293  hypothetical protein  32.59 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.401413  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  35.66 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1857  hypothetical protein  27.33 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000332835  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  39.76 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0966  hypothetical protein  40.48 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0129  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.374028  normal  0.0265018 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2648  hypothetical protein  27.46 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812094 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  32.19 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  30.5 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  30.67 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  29.58 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0576  Protein of unknown function DUF2147  37.31 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0038  putative signal peptide protein  32.1 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  34.68 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  29.1 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0805  hypothetical protein  25.81 
 
 		 186 aa  48.5  0.00003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  32.61 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1885  hypothetical protein  32.38 
 
 		 128 aa  47.8  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0919  hypothetical protein  28.81 
 
 		 126 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539754  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  30.34 
 
 		 199 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03893  putative signal peptide protein  35.29 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.536357 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2244  hypothetical protein  28.81 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  27.74 
 
 		 129 aa  47  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3722  Protein of unknown function DUF2147  29.63 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861772  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  32.61 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  28.67 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1090  hypothetical protein  40.43 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177825  normal  0.714021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  31.11 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  35.29 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  28.67 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  28.33 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  32 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  34.78 
 
 		 204 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  28.47 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2543  hypothetical protein  38.64 
 
 		 126 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  31.4 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  38.24 
 
 		 133 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  28.26 
 
 		 135 aa  41.2  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>