62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4468 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4468  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3837  hypothetical protein  82.03 
 
 		 217 aa  325  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1651  hypothetical protein  76.96 
 
 		 218 aa  299  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1465  hypothetical protein  65.93 
 
 		 214 aa  218  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0300883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5549  hypothetical protein  50 
 
 		 202 aa  182  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.355042 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2807  putative signal peptide protein  36.84 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4654  hypothetical protein  36.36 
 
 		 153 aa  99  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388163  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1435  hypothetical protein  35.06 
 
 		 153 aa  98.2  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152926  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  34.78 
 
 		 161 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.399726 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1716  putative signal peptide protein  37.66 
 
 		 161 aa  95.5  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1046  hypothetical protein  36.05 
 
 		 153 aa  92.4  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.29497  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1493  hypothetical protein  36.05 
 
 		 153 aa  92.4  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0322  hypothetical protein  32.47 
 
 		 155 aa  92  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1005  hypothetical protein  36.05 
 
 		 153 aa  92.4  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.660844  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0161  hypothetical protein  36.05 
 
 		 153 aa  92.4  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29440  hypothetical protein  32.9 
 
 		 149 aa  91.7  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809204  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1513  hypothetical protein  35.56 
 
 		 153 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.715574  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1489  hypothetical protein  35.56 
 
 		 153 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  hitchhiker  0.000316489 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1033  hypothetical protein  35.56 
 
 		 153 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1742  hypothetical protein  35.61 
 
 		 153 aa  87.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00050816 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2798  putative signal peptide protein  36.51 
 
 		 152 aa  87.4  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00624822  normal  0.61981 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6081  hypothetical protein  33.85 
 
 		 168 aa  86.7  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2874  putative signal peptide protein  35.66 
 
 		 157 aa  85.9  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000419101  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1395  hypothetical protein  34.09 
 
 		 153 aa  85.9  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1929  hypothetical protein  36.05 
 
 		 153 aa  85.9  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.612499  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1779  putative lipoprotein  36.05 
 
 		 153 aa  85.9  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1757  putative lipoprotein  36.05 
 
 		 160 aa  85.9  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.980329  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0103  hypothetical protein  31.08 
 
 		 174 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3075  putative signal peptide protein  34.11 
 
 		 153 aa  83.6  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2551  putative lipoprotein  34.69 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846128  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2631  putative signal peptide protein  40.48 
 
 		 151 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  0.77547 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3041  conserved hypothetical signal peptide protein  39.68 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1175  putative signal peptide protein  34 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0811  hypothetical protein  36.43 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0418  hypothetical protein  34.11 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130226  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0773  hypothetical protein  31.51 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0802  hypothetical protein  31.51 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0944  hypothetical protein  30.56 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.502231  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2649  hypothetical protein  28.95 
 
 		 166 aa  70.9  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799269 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4088  hypothetical protein  40.22 
 
 		 144 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1617  hypothetical protein  28.19 
 
 		 154 aa  67.4  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000464775  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09958  hypothetical protein  27.1 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150312  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0566  hypothetical protein  30.23 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406238  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3518  hypothetical protein  41.25 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.446687  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1338  hypothetical protein  34.44 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01791  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  64.3  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0572  hypothetical protein  35.14 
 
 		 144 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0593  hypothetical protein  35.14 
 
 		 144 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.438813 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3486  hypothetical protein  27.7 
 
 		 142 aa  63.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0966  hypothetical protein  37.5 
 
 		 85 aa  61.2  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2647  hypothetical protein  32.84 
 
 		 143 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.694263  normal  0.835053 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0550  hypothetical protein  26.23 
 
 		 148 aa  53.1  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000170844 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2925  hypothetical protein  27.91 
 
 		 147 aa  49.7  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2543  hypothetical protein  36.71 
 
 		 126 aa  49.3  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2648  hypothetical protein  27.27 
 
 		 147 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812094 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2045  hypothetical protein  27.14 
 
 		 127 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000649119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2348  hypothetical protein  27.14 
 
 		 127 aa  47  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0044587  normal  0.12672 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  24.5 
 
 		 148 aa  46.2  0.0004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  24.83 
 
 		 143 aa  45.4  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  27.45 
 
 		 139 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  28.95 
 
 		 168 aa  42.7  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  28.74 
 
 		 149 aa  42.4  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>