60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1651 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1651  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3837  hypothetical protein  80.18 
 
 		 217 aa  330  1e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4468  hypothetical protein  83.15 
 
 		 218 aa  286  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1465  hypothetical protein  75 
 
 		 214 aa  221  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0300883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5549  hypothetical protein  51.1 
 
 		 202 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.355042 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1435  hypothetical protein  37.01 
 
 		 153 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152926  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1716  putative signal peptide protein  39.58 
 
 		 161 aa  102  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2807  putative signal peptide protein  36.36 
 
 		 161 aa  101  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4654  hypothetical protein  36.36 
 
 		 153 aa  101  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388163  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  35.44 
 
 		 161 aa  98.6  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.399726 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1046  hypothetical protein  37.01 
 
 		 153 aa  98.2  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.29497  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1005  hypothetical protein  37.01 
 
 		 153 aa  98.2  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.660844  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0161  hypothetical protein  37.01 
 
 		 153 aa  98.2  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1493  hypothetical protein  37.01 
 
 		 153 aa  98.2  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0322  hypothetical protein  33.12 
 
 		 155 aa  96.7  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29440  hypothetical protein  33.99 
 
 		 149 aa  95.1  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809204  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1929  hypothetical protein  36.36 
 
 		 153 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.612499  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1757  putative lipoprotein  36.36 
 
 		 160 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.980329  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1779  putative lipoprotein  36.36 
 
 		 153 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1033  hypothetical protein  37.04 
 
 		 153 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1513  hypothetical protein  37.04 
 
 		 153 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.715574  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1489  hypothetical protein  37.04 
 
 		 153 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  hitchhiker  0.000316489 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2874  putative signal peptide protein  38.71 
 
 		 157 aa  92  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000419101  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1395  hypothetical protein  37.12 
 
 		 153 aa  91.7  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2551  putative lipoprotein  35.06 
 
 		 153 aa  91.7  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846128  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1742  hypothetical protein  37.88 
 
 		 153 aa  91.3  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00050816 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6081  hypothetical protein  33.86 
 
 		 168 aa  89.4  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2798  putative signal peptide protein  38.21 
 
 		 152 aa  89.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00624822  normal  0.61981 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0811  hypothetical protein  34.69 
 
 		 144 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2631  putative signal peptide protein  42.28 
 
 		 151 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  0.77547 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0103  hypothetical protein  31.82 
 
 		 174 aa  85.9  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3041  conserved hypothetical signal peptide protein  41.46 
 
 		 151 aa  85.5  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3075  putative signal peptide protein  34.38 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0944  hypothetical protein  32.61 
 
 		 148 aa  80.9  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.502231  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2649  hypothetical protein  29.19 
 
 		 166 aa  81.3  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799269 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1175  putative signal peptide protein  32.67 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0418  hypothetical protein  36.43 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4088  hypothetical protein  37.4 
 
 		 144 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0572  hypothetical protein  36.51 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0593  hypothetical protein  36.51 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.438813 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01791  hypothetical protein  36.29 
 
 		 149 aa  74.3  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1617  hypothetical protein  29.33 
 
 		 154 aa  73.9  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000464775  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0802  hypothetical protein  30.72 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0773  hypothetical protein  30.72 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0566  hypothetical protein  30.08 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406238  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3518  hypothetical protein  35.66 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.446687  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1338  hypothetical protein  34.9 
 
 		 146 aa  71.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3486  hypothetical protein  28.91 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09958  hypothetical protein  27.74 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150312  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0966  hypothetical protein  38.89 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2647  hypothetical protein  33.07 
 
 		 143 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.694263  normal  0.835053 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0550  hypothetical protein  27.34 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000170844 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2045  hypothetical protein  30.07 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000649119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2348  hypothetical protein  29.41 
 
 		 127 aa  54.3  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0044587  normal  0.12672 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2543  hypothetical protein  37.08 
 
 		 126 aa  51.6  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2925  hypothetical protein  28.68 
 
 		 147 aa  51.6  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  29.73 
 
 		 143 aa  46.2  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  27.92 
 
 		 139 aa  46.2  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2293  hypothetical protein  27.14 
 
 		 127 aa  43.5  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.401413  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  20.98 
 
 		 168 aa  42  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>