76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0593 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0593  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  288  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.438813 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0572  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  288  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0811  hypothetical protein  75 
 
 
144 aa  222  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4088  hypothetical protein  78.47 
 
 
144 aa  219  8e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1338  hypothetical protein  71.13 
 
 
146 aa  200  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3518  hypothetical protein  62.9 
 
 
144 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.446687  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0418  hypothetical protein  47.29 
 
 
147 aa  123  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130226  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2798  putative signal peptide protein  51.2 
 
 
152 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00624822  normal  0.61981 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1435  hypothetical protein  43.24 
 
 
153 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152926  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0161  hypothetical protein  43.92 
 
 
153 aa  119  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1046  hypothetical protein  43.92 
 
 
153 aa  119  9e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.29497  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1493  hypothetical protein  43.92 
 
 
153 aa  119  9e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1005  hypothetical protein  43.92 
 
 
153 aa  119  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.660844  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4654  hypothetical protein  44.14 
 
 
153 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388163  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1513  hypothetical protein  45.93 
 
 
153 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.715574  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1033  hypothetical protein  45.93 
 
 
153 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1489  hypothetical protein  45.93 
 
 
153 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  hitchhiker  0.000316489 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0322  hypothetical protein  45.52 
 
 
155 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3041  conserved hypothetical signal peptide protein  47.24 
 
 
151 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434971  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2631  putative signal peptide protein  46.46 
 
 
151 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  0.77547 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1395  hypothetical protein  44.36 
 
 
153 aa  114  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1779  putative lipoprotein  46.03 
 
 
153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1757  putative lipoprotein  46.03 
 
 
160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.980329  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1742  hypothetical protein  45.86 
 
 
153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00050816 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1929  hypothetical protein  46.03 
 
 
153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.612499  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2807  putative signal peptide protein  44.14 
 
 
161 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3075  putative signal peptide protein  44 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1716  putative signal peptide protein  42.47 
 
 
161 aa  111  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  42.76 
 
 
161 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.399726 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2551  putative lipoprotein  45.24 
 
 
153 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846128  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6081  hypothetical protein  43.65 
 
 
168 aa  107  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0103  hypothetical protein  42.36 
 
 
174 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2874  putative signal peptide protein  41.46 
 
 
157 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000419101  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01791  hypothetical protein  41.94 
 
 
149 aa  104  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0944  hypothetical protein  39.33 
 
 
148 aa  104  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.502231  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2649  hypothetical protein  38 
 
 
166 aa  101  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.799269 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09958  hypothetical protein  37.93 
 
 
141 aa  96.7  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150312  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0550  hypothetical protein  43.8 
 
 
148 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000170844 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29440  hypothetical protein  39.86 
 
 
149 aa  94.4  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809204  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1175  putative signal peptide protein  41.13 
 
 
148 aa  93.6  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3486  hypothetical protein  35.62 
 
 
142 aa  89.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0802  hypothetical protein  37.5 
 
 
144 aa  89.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2925  hypothetical protein  37.7 
 
 
147 aa  89.4  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771304  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0773  hypothetical protein  37.5 
 
 
144 aa  89.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2647  hypothetical protein  39.84 
 
 
143 aa  87.8  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.694263  normal  0.835053 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1651  hypothetical protein  36.51 
 
 
218 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5549  hypothetical protein  33.78 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.355042 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1617  hypothetical protein  30.71 
 
 
154 aa  73.9  0.0000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000464775  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2045  hypothetical protein  35.46 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000649119  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0566  hypothetical protein  30.71 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406238  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2348  hypothetical protein  37.07 
 
 
127 aa  72  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0044587  normal  0.12672 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0966  hypothetical protein  44.05 
 
 
85 aa  71.2  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2293  hypothetical protein  34.75 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.401413  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4468  hypothetical protein  34.19 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3837  hypothetical protein  33.93 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216849  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1465  hypothetical protein  34.96 
 
 
214 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0300883  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2648  hypothetical protein  30.43 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.812094 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  34.96 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1857  hypothetical protein  31.58 
 
 
173 aa  57.8  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000332835  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  31.25 
 
 
139 aa  57.4  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  30.92 
 
 
168 aa  57  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3110  hypothetical protein  39.06 
 
 
78 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  22.3 
 
 
148 aa  51.6  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  28.95 
 
 
143 aa  50.4  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0805  hypothetical protein  27.64 
 
 
186 aa  50.4  0.000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  30.47 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  30.52 
 
 
142 aa  47.4  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  24.34 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2244  hypothetical protein  30 
 
 
126 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0919  hypothetical protein  30 
 
 
126 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539754  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  27.7 
 
 
213 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0129  hypothetical protein  30.16 
 
 
188 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.374028  normal  0.0265018 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  28.57 
 
 
168 aa  41.6  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  26.8 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  27.7 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0576  Protein of unknown function DUF2147  22.52 
 
 
166 aa  40  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>