26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3110 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3110  hypothetical protein  100 
 
 
78 aa  158  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4654  hypothetical protein  34.78 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388163  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1435  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152926  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0103  hypothetical protein  46.15 
 
 
174 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1338  hypothetical protein  42.31 
 
 
146 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1005  hypothetical protein  34.72 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.660844  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1046  hypothetical protein  34.72 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.29497  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0161  hypothetical protein  34.72 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1493  hypothetical protein  34.72 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0322  hypothetical protein  39.62 
 
 
155 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2649  hypothetical protein  41.67 
 
 
166 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.799269 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1395  hypothetical protein  36.84 
 
 
153 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4088  hypothetical protein  34.69 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01791  hypothetical protein  45.45 
 
 
149 aa  40.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1033  hypothetical protein  35 
 
 
153 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3486  hypothetical protein  29.69 
 
 
142 aa  40.4  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1513  hypothetical protein  35 
 
 
153 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.715574  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1489  hypothetical protein  35 
 
 
153 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  hitchhiker  0.000316489 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0593  hypothetical protein  40 
 
 
144 aa  40.8  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.438813 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0572  hypothetical protein  40 
 
 
144 aa  40.8  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2647  hypothetical protein  42.5 
 
 
143 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.694263  normal  0.835053 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3518  hypothetical protein  54.29 
 
 
144 aa  40.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.446687  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  32.84 
 
 
161 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.399726 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2925  hypothetical protein  43.14 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771304  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0944  hypothetical protein  37.93 
 
 
148 aa  40  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.502231  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0811  hypothetical protein  32.81 
 
 
144 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>