91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_29440 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_29440  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  298  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809204  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0322  hypothetical protein  43.54 
 
 
155 aa  124  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0103  hypothetical protein  41.96 
 
 
174 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2807  putative signal peptide protein  38.78 
 
 
161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0161  hypothetical protein  39.46 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1493  hypothetical protein  39.46 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1005  hypothetical protein  39.46 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.660844  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  37.41 
 
 
161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.399726 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1046  hypothetical protein  39.46 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.29497  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1435  hypothetical protein  39.04 
 
 
153 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152926  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6081  hypothetical protein  44.54 
 
 
168 aa  113  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0418  hypothetical protein  45.97 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130226  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4654  hypothetical protein  37.76 
 
 
153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388163  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0944  hypothetical protein  40.56 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.502231  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3075  putative signal peptide protein  41.8 
 
 
153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1929  hypothetical protein  38.78 
 
 
153 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.612499  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1757  putative lipoprotein  38.78 
 
 
160 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.980329  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1779  putative lipoprotein  38.78 
 
 
153 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1716  putative signal peptide protein  37.93 
 
 
161 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1489  hypothetical protein  39.39 
 
 
153 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  hitchhiker  0.000316489 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1033  hypothetical protein  39.39 
 
 
153 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1395  hypothetical protein  40 
 
 
153 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1513  hypothetical protein  39.39 
 
 
153 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.715574  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1742  hypothetical protein  40 
 
 
153 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00050816 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2551  putative lipoprotein  37.41 
 
 
153 aa  103  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846128  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2874  putative signal peptide protein  42.86 
 
 
157 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000419101  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1175  putative signal peptide protein  39.6 
 
 
148 aa  101  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01791  hypothetical protein  38.71 
 
 
149 aa  99.4  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1617  hypothetical protein  35.66 
 
 
154 aa  100  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000464775  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0566  hypothetical protein  39.53 
 
 
133 aa  98.2  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406238  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3486  hypothetical protein  36.17 
 
 
142 aa  98.2  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2649  hypothetical protein  31.76 
 
 
166 aa  97.1  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.799269 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3518  hypothetical protein  46.28 
 
 
144 aa  97.1  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.446687  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3041  conserved hypothetical signal peptide protein  40.83 
 
 
151 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434971  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2631  putative signal peptide protein  40 
 
 
151 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  0.77547 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0811  hypothetical protein  37.59 
 
 
144 aa  92.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2798  putative signal peptide protein  38.33 
 
 
152 aa  91.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00624822  normal  0.61981 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0773  hypothetical protein  37.24 
 
 
144 aa  90.5  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0802  hypothetical protein  37.24 
 
 
144 aa  90.5  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0593  hypothetical protein  41.8 
 
 
144 aa  90.5  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.438813 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0572  hypothetical protein  41.8 
 
 
144 aa  90.5  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1651  hypothetical protein  37.4 
 
 
218 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3837  hypothetical protein  36.59 
 
 
217 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216849  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4468  hypothetical protein  34.56 
 
 
218 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1338  hypothetical protein  40.16 
 
 
146 aa  87.8  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5549  hypothetical protein  32.62 
 
 
202 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.355042 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09958  hypothetical protein  30.5 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150312  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1465  hypothetical protein  33.88 
 
 
214 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0300883  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2925  hypothetical protein  34.92 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771304  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0550  hypothetical protein  31.82 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000170844 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4088  hypothetical protein  35.25 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  32 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  30.2 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2647  hypothetical protein  34.17 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.694263  normal  0.835053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  31.01 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  26.53 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  27.7 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2648  hypothetical protein  31.65 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.812094 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0966  hypothetical protein  39.02 
 
 
85 aa  59.3  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0576  Protein of unknown function DUF2147  25.87 
 
 
166 aa  58.2  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  31.07 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  31.58 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  35.43 
 
 
170 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  35.43 
 
 
170 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  34.65 
 
 
179 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2293  hypothetical protein  32.03 
 
 
127 aa  52  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.401413  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  29.77 
 
 
168 aa  50.1  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1090  hypothetical protein  26.9 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177825  normal  0.714021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4322  putative signal peptide protein  24.16 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338595  normal  0.0273369 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2543  hypothetical protein  37.14 
 
 
126 aa  48.9  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0129  hypothetical protein  29.81 
 
 
188 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.374028  normal  0.0265018 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1857  hypothetical protein  26.75 
 
 
173 aa  48.5  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000332835  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  32.39 
 
 
203 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  30.94 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2045  hypothetical protein  30 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000649119  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03893  putative signal peptide protein  22.37 
 
 
156 aa  47.8  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.536357 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  32.84 
 
 
168 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  27.86 
 
 
228 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0523  hypothetical protein  26.85 
 
 
147 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372875  hitchhiker  0.00154725 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2348  hypothetical protein  29.29 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0044587  normal  0.12672 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  31.82 
 
 
154 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  33.05 
 
 
204 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  31.48 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0038  putative signal peptide protein  26.47 
 
 
154 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274459  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  30.71 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3722  Protein of unknown function DUF2147  28.18 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861772  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  25.71 
 
 
134 aa  41.2  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  29.85 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  25.55 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  28.87 
 
 
199 aa  40.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>