More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0715 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0715  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 278 aa  570  1e-161  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0698  tRNA pseudouridine synthase B  62.22 
 
 		 273 aa  349  2e-95  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0063  tRNA pseudouridine synthase B  56.67 
 
 		 273 aa  340  1e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1632  pseudouridylate synthase TruB domain protein  55.19 
 
 		 275 aa  323  1e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1109  tRNA pseudouridine synthase B  57.41 
 
 		 272 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0438  tRNA pseudouridine synthase B  53.87 
 
 		 273 aa  288  7e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1057  tRNA pseudouridine synthase B  53.16 
 
 		 272 aa  279  4e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1245  tRNA pseudouridine synthase B  50.74 
 
 		 272 aa  278  6e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.478326  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1120  tRNA pseudouridine synthase B  50.37 
 
 		 272 aa  276  2e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.855137  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0620  tRNA pseudouridine synthase B  50.37 
 
 		 272 aa  275  4e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.468931  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0908  tRNA pseudouridine synthase B  37.62 
 
 		 301 aa  142  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12806  tRNA pseudouridine synthase B  34.91 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3048  tRNA pseudouridine synthase B  33.73 
 
 		 318 aa  139  6e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1351  pseudouridine synthase  36.7 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.779318  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3931  tRNA pseudouridine synthase B  35.41 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.486039  normal  0.358321 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1559  tRNA pseudouridine synthase B  32.86 
 
 		 306 aa  135  7.000000000000001e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0966  tRNA pseudouridine synthase B  36.71 
 
 		 304 aa  135  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000895381  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_853  tRNA pseudouridine synthase B  37.38 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000359434  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  35.53 
 
 		 304 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3808  tRNA pseudouridine synthase B  35.56 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0201981 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1973  tRNA pseudouridine synthase B  36.77 
 
 		 558 aa  133  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  35.92 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2329  tRNA pseudouridine synthase B  32.38 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208892 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2158  tRNA pseudouridine synthase B  36.36 
 
 		 299 aa  132  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  32.64 
 
 		 297 aa  132  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3755  tRNA pseudouridine synthase B  31.98 
 
 		 300 aa  132  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1742  tRNA pseudouridine synthase B  36.84 
 
 		 302 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00438072  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1125  tRNA pseudouridine synthase B  34.68 
 
 		 303 aa  132  6.999999999999999e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2818  tRNA pseudouridine synthase B  33.98 
 
 		 311 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0872  tRNA pseudouridine synthase B  36.87 
 
 		 300 aa  131  9e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000436908  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2227  tRNA pseudouridine synthase B  33 
 
 		 313 aa  132  9e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00164056  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  35.84 
 
 		 310 aa  132  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2817  tRNA pseudouridine synthase B  33.49 
 
 		 241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  hitchhiker  0.00223059 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3569  tRNA pseudouridine synthase B  32.74 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.687406 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3042  tRNA pseudouridine synthase B  35.32 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.877322 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1059  tRNA pseudouridine synthase B  36.36 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00436099  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1764  tRNA pseudouridine synthase B  36.36 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1634  tRNA pseudouridine synthase B  33.59 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.767781  hitchhiker  0.000962415 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1917  tRNA pseudouridine synthase B  36.36 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.274314  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0993  tRNA pseudouridine synthase B  36.36 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2562  tRNA pseudouridine synthase B  36.84 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0616361  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0173  tRNA pseudouridine synthase B  36.36 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.016553  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1505  tRNA pseudouridine synthase B  36.36 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3188  tRNA pseudouridine synthase B  33.49 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0863622  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2293  tRNA pseudouridine synthase B  38.97 
 
 		 299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  31.25 
 
 		 302 aa  129  6e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2095  tRNA pseudouridine synthase B  35.41 
 
 		 297 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2078  tRNA pseudouridine synthase B  35.41 
 
 		 297 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0804076  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2141  tRNA pseudouridine synthase B  35.41 
 
 		 297 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.024046 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1054  tRNA pseudouridine synthase B  34.62 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156302  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  34.38 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2118  tRNA pseudouridine synthase B  36.04 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206379  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0033  tRNA pseudouridine synthase B  34.96 
 
 		 412 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  35.4 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  35.4 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2167  tRNA pseudouridine synthase B  37.25 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1747  tRNA pseudouridine synthase B  35.23 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108245  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1065  tRNA pseudouridine synthase B  32.23 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.0143868 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2833  tRNA pseudouridine synthase B  35.94 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3327  tRNA pseudouridine synthase B  34.6 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212932  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0084  tRNA pseudouridine synthase B  35.55 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  36.1 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  34 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2079  tRNA pseudouridine synthase B  37.25 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0054544  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3031  tRNA pseudouridine synthase B  33.19 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1424  tRNA pseudouridine synthase B  31.72 
 
 		 306 aa  126  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1591  tRNA pseudouridine synthase B  36.92 
 
 		 304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00165016  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1727  tRNA pseudouridine synthase B  34.6 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3630  tRNA pseudouridine synthase B  37.44 
 
 		 307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.326344  normal  0.032374 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4028  tRNA pseudouridine synthase B  34.23 
 
 		 294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  36.02 
 
 		 299 aa  125  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0291  tRNA pseudouridine synthase B  38.54 
 
 		 363 aa  125  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0204129 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0903  pseudouridylate synthase  36.54 
 
 		 299 aa  125  7e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0039  tRNA pseudouridine synthase B  34.13 
 
 		 310 aa  125  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651075  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1213  tRNA pseudouridine synthase B  33.18 
 
 		 325 aa  124  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1046  tRNA pseudouridine synthase B  33.66 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3849  tRNA pseudouridine synthase B  36.19 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0712752  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14640  tRNA pseudouridine synthase B  33.96 
 
 		 295 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282471  normal  0.813553 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3346  tRNA pseudouridine synthase B  33.02 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1432  tRNA pseudouridine synthase B  32.59 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000149867 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2131  tRNA pseudouridine synthase B  34.25 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.222918  normal  0.419239 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3783  tRNA pseudouridine synthase B  36.54 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0711171  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0441  tRNA pseudouridine synthase B  37.56 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1514  tRNA pseudouridine synthase B  33.02 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1384  tRNA pseudouridine synthase B  34.51 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0745  tRNA pseudouridine synthase B  36.27 
 
 		 324 aa  123  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.555354  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42800  tRNA pseudouridine synthase B  33.18 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1424  tRNA pseudouridine synthase B  34.96 
 
 		 310 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0157045 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0557  tRNA pseudouridine synthase B  35.1 
 
 		 293 aa  123  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0069  tRNA pseudouridine synthase B  31.45 
 
 		 302 aa  123  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00601892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2203  tRNA pseudouridine synthase B  31.16 
 
 		 302 aa  123  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.147231  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0393  tRNA pseudouridine synthase B  35.1 
 
 		 293 aa  123  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1478  tRNA pseudouridine synthase B  34.51 
 
 		 310 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2450  tRNA pseudouridine synthase B  33.49 
 
 		 299 aa  122  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.226071  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0026  tRNA pseudouridine synthase B  33.77 
 
 		 358 aa  122  6e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.148493 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0101  tRNA pseudouridine synthase B  39.58 
 
 		 235 aa  122  6e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.374766  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1727  tRNA pseudouridine synthase B  36.54 
 
 		 309 aa  122  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.577271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4643  tRNA pseudouridine synthase B  36.54 
 
 		 322 aa  122  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1438  tRNA pseudouridine synthase B  31.43 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1029  tRNA pseudouridine synthase B  32.26 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>