127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5996 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1715  hypothetical protein  60.16 
 
 		 1382 aa  1627    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5996  IcmF-like protein  100 
 
 		 1392 aa  2811    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34130  hypothetical protein  24.27 
 
 		 1271 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124359  normal  0.295938 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3402  hypothetical protein  24.79 
 
 		 1273 aa  122  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3090  OmpA domain-containing protein  24.48 
 
 		 831 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2633  OmpA/MotB domain-containing protein  24.22 
 
 		 831 aa  112  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2775  OmpA/MotB domain-containing protein  24.6 
 
 		 831 aa  111  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414663  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4964  OmpA/MotB  26.48 
 
 		 830 aa  108  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2901  hypothetical protein  24.43 
 
 		 1271 aa  108  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.839011  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2499  OmpA/MotB domain-containing protein  25.52 
 
 		 831 aa  106  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  21.83 
 
 		 1172 aa  105  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50760  hypothetical protein  26.33 
 
 		 1272 aa  103  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  24.65 
 
 		 1212 aa  93.2  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  24.75 
 
 		 1218 aa  89  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  24.63 
 
 		 1230 aa  88.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  25 
 
 		 1207 aa  87.8  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  25.65 
 
 		 1157 aa  87.4  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2260  OmpA/MotB  24.77 
 
 		 830 aa  87.4  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  24.73 
 
 		 1176 aa  87  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  24.44 
 
 		 1209 aa  87  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0274  hypothetical protein  24.65 
 
 		 1154 aa  86.7  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  24.91 
 
 		 1164 aa  85.9  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  23.12 
 
 		 1173 aa  85.1  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3045  hypothetical protein  23.92 
 
 		 1133 aa  84.7  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3166  hypothetical protein  23.05 
 
 		 1150 aa  84.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  24.67 
 
 		 1268 aa  84  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  22.11 
 
 		 1195 aa  84.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  21.66 
 
 		 1182 aa  84  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  22.85 
 
 		 1173 aa  83.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1208 aa  82.8  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  22.94 
 
 		 1209 aa  82  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  29.12 
 
 		 1302 aa  81.6  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  29.12 
 
 		 1302 aa  82  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  29.12 
 
 		 1302 aa  81.6  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3575  hypothetical protein  23.78 
 
 		 1315 aa  81.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2907  type VI secretion protein IcmF  23.78 
 
 		 1315 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1205  hypothetical protein  23.78 
 
 		 1134 aa  81.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2620  ImcF-related  23.77 
 
 		 1314 aa  80.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0485  ImcF domain-containing protein  23.77 
 
 		 1314 aa  80.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752194  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0459  type VI secretion protein IcmF  23.77 
 
 		 1314 aa  80.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821669  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  24.28 
 
 		 1209 aa  79  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  24.28 
 
 		 1209 aa  79  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  22.56 
 
 		 1199 aa  79  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  24.28 
 
 		 1209 aa  79  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  24.28 
 
 		 1209 aa  79  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  24.28 
 
 		 1209 aa  79  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  24.28 
 
 		 1209 aa  79  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  24.28 
 
 		 1209 aa  79  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  23.02 
 
 		 1220 aa  78.6  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  22.29 
 
 		 1205 aa  77.8  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0393  ImcF domain-containing protein  23.35 
 
 		 1313 aa  77  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0420  type VI secretion protein IcmF  23.35 
 
 		 1313 aa  77  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.419198  normal  0.652814 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  22.03 
 
 		 1171 aa  75.5  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_003296  RS01945  hypothetical protein  22.74 
 
 		 1313 aa  75.5  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.206649 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  22.02 
 
 		 1270 aa  75.1  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  22.42 
 
 		 1288 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3720  Fis family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 1194 aa  73.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  23.36 
 
 		 1211 aa  72.8  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  23.1 
 
 		 1176 aa  72.8  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  23.05 
 
 		 1102 aa  72  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  22.79 
 
 		 1181 aa  72  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  23.13 
 
 		 1152 aa  71.6  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  25 
 
 		 1175 aa  71.6  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0311  type VI secretion protein IcmF  24.89 
 
 		 1289 aa  71.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685526 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  24.89 
 
 		 1289 aa  71.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277614 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  25 
 
 		 1175 aa  71.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  24.89 
 
 		 1289 aa  71.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  23.08 
 
 		 1179 aa  71.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  24.89 
 
 		 1289 aa  70.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  25.27 
 
 		 1302 aa  70.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0729.1  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1525 aa  69.3  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2954  ImcF-like family protein  22.94 
 
 		 1301 aa  69.3  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.858657  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  22.19 
 
 		 1192 aa  68.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0619  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1355 aa  68.9  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.104026  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0730  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1322 aa  68.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224461  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1688  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1319 aa  68.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  22.59 
 
 		 1329 aa  68.6  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2826  hypothetical protein  21.83 
 
 		 1297 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0549  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1299 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553275  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0050  hypothetical protein  21.83 
 
 		 1297 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1717  hypothetical protein  21.83 
 
 		 1297 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624106  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3151  hypothetical protein  21.83 
 
 		 1297 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3632  hypothetical protein  21.83 
 
 		 1297 aa  67.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3625  hypothetical protein  21.83 
 
 		 1297 aa  67.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3650  hypothetical protein  21.83 
 
 		 1297 aa  67.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2040  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1334 aa  67.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  27.03 
 
 		 1302 aa  67.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  23.03 
 
 		 1206 aa  66.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  23.01 
 
 		 1179 aa  65.9  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2501  type VI secretion protein IcmF  21.63 
 
 		 1268 aa  65.9  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.761474 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2138  hypothetical protein  23.72 
 
 		 1328 aa  65.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  20.62 
 
 		 1204 aa  65.9  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  21.69 
 
 		 1206 aa  65.1  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2631  ImcF domain-containing protein  22.94 
 
 		 1267 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.390277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  18.69 
 
 		 1182 aa  64.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  24.6 
 
 		 1302 aa  64.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0855  putative lipoprotein  23.62 
 
 		 1296 aa  63.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0883646  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3091  hypothetical protein  22.58 
 
 		 1267 aa  63.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  19.8 
 
 		 1181 aa  63.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2085  putative membrane protein, SciS/IcmF-like  27.61 
 
 		 1365 aa  63.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.842355 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>