138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3402 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3402  hypothetical protein  100 
 
 		 1273 aa  2560    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34130  hypothetical protein  49.8 
 
 		 1271 aa  1121    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124359  normal  0.295938 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2901  hypothetical protein  49.64 
 
 		 1271 aa  1117    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.839011  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50760  hypothetical protein  53.5 
 
 		 1272 aa  1231    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1715  hypothetical protein  24.03 
 
 		 1382 aa  206  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5996  IcmF-like protein  23.96 
 
 		 1392 aa  128  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1102 aa  102  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1176 aa  102  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  26.14 
 
 		 1182 aa  93.2  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  26.19 
 
 		 1171 aa  92.4  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0459  type VI secretion protein IcmF  24.05 
 
 		 1314 aa  92  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2620  ImcF-related  24.05 
 
 		 1314 aa  92  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0485  ImcF domain-containing protein  24.05 
 
 		 1314 aa  92  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752194  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2907  type VI secretion protein IcmF  25.19 
 
 		 1315 aa  91.7  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531051  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  27.82 
 
 		 1206 aa  90.9  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3575  hypothetical protein  23.81 
 
 		 1315 aa  90.5  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  27.58 
 
 		 1206 aa  90.5  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0420  type VI secretion protein IcmF  23.81 
 
 		 1313 aa  90.5  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.419198  normal  0.652814 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  23.64 
 
 		 1270 aa  89.4  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0393  ImcF domain-containing protein  24.44 
 
 		 1313 aa  89  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3221  type VI secretion protein IcmF  26.49 
 
 		 1194 aa  87.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  24.16 
 
 		 1288 aa  87.8  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2954  ImcF-like family protein  23.52 
 
 		 1301 aa  87  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.858657  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  27.43 
 
 		 1199 aa  86.7  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  25.08 
 
 		 1209 aa  86.3  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3625  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1297 aa  85.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2826  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1297 aa  85.5  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3632  hypothetical protein  22.79 
 
 		 1297 aa  85.5  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20293  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0050  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1297 aa  85.5  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1717  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1297 aa  85.5  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624106  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3650  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1297 aa  85.5  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3151  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1297 aa  85.5  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3166  hypothetical protein  25.27 
 
 		 1150 aa  83.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01945  hypothetical protein  27.37 
 
 		 1313 aa  83.6  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.206649 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  29.43 
 
 		 1302 aa  82.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  29.43 
 
 		 1302 aa  82  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  29.43 
 
 		 1302 aa  81.6  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  25 
 
 		 1218 aa  81.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  24.58 
 
 		 1208 aa  80.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000209226 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3045  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1133 aa  80.5  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  29.6 
 
 		 1302 aa  80.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1205  hypothetical protein  24.03 
 
 		 1134 aa  80.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  24.07 
 
 		 1209 aa  79.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  24.26 
 
 		 1268 aa  77.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  28.08 
 
 		 1179 aa  77.8  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0992  hypothetical protein  27.46 
 
 		 1369 aa  77.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.894672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1181 aa  76.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3485  ImcF domain-containing protein  27.4 
 
 		 1365 aa  76.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3720  Fis family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 1194 aa  76.6  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  24.5 
 
 		 1209 aa  76.3  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  24.33 
 
 		 1207 aa  76.3  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  24.5 
 
 		 1209 aa  76.3  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  24.5 
 
 		 1209 aa  76.3  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  24.5 
 
 		 1209 aa  76.3  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  24.91 
 
 		 1211 aa  75.5  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  25.21 
 
 		 1208 aa  75.5  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0274  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1154 aa  75.1  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0855  putative lipoprotein  24.49 
 
 		 1296 aa  75.1  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0883646  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  26.25 
 
 		 1205 aa  75.1  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2085  putative membrane protein, SciS/IcmF-like  29.17 
 
 		 1365 aa  75.1  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  24.22 
 
 		 1209 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  23.18 
 
 		 1157 aa  74.7  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  24.86 
 
 		 1172 aa  74.7  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  27.76 
 
 		 1302 aa  74.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  25.66 
 
 		 1173 aa  74.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  24.22 
 
 		 1209 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  24.22 
 
 		 1209 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0729.1  hypothetical protein  26.51 
 
 		 1525 aa  74.3  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  28.72 
 
 		 1302 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0619  hypothetical protein  26.51 
 
 		 1355 aa  73.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.104026  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0730  hypothetical protein  26.51 
 
 		 1322 aa  73.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224461  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1688  hypothetical protein  26.51 
 
 		 1319 aa  73.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2499  OmpA/MotB domain-containing protein  24.65 
 
 		 831 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0549  hypothetical protein  26.17 
 
 		 1299 aa  72.4  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553275  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  26.82 
 
 		 1173 aa  72.4  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2138  hypothetical protein  26.17 
 
 		 1328 aa  72.4  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2040  hypothetical protein  26.17 
 
 		 1334 aa  72.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  22.22 
 
 		 1182 aa  72  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  23.2 
 
 		 1181 aa  71.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  23.48 
 
 		 1212 aa  71.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3922  type VI secretion protein IcmF  28.97 
 
 		 1366 aa  69.3  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298439  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3090  OmpA domain-containing protein  23.63 
 
 		 831 aa  69.3  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  23.29 
 
 		 1230 aa  68.9  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  28.51 
 
 		 1176 aa  68.6  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2775  OmpA/MotB domain-containing protein  23.21 
 
 		 831 aa  68.6  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414663  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2633  OmpA/MotB domain-containing protein  23.35 
 
 		 831 aa  68.6  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  24.92 
 
 		 1164 aa  67.8  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4964  OmpA/MotB  25.21 
 
 		 830 aa  66.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0016  hypothetical protein  22.11 
 
 		 1008 aa  65.9  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  25.94 
 
 		 1152 aa  65.9  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  21.79 
 
 		 1187 aa  65.5  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0553  hypothetical protein  28.47 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0226  hypothetical protein  27.75 
 
 		 1174 aa  65.1  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1937  type VI secretion protein IcmF  25.09 
 
 		 1150 aa  65.1  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.502152  normal  0.887242 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1373  hypothetical protein  25.46 
 
 		 1275 aa  65.1  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1485  type VI secretion protein IcmF  25.46 
 
 		 1275 aa  65.1  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  24.49 
 
 		 1168 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  23.25 
 
 		 1195 aa  64.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0228  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1174 aa  63.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.164141  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  21.8 
 
 		 1204 aa  63.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>