132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2901 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3402  hypothetical protein  49.17 
 
 		 1273 aa  1129    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50760  hypothetical protein  48.03 
 
 		 1272 aa  1048    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34130  hypothetical protein  97.48 
 
 		 1271 aa  2340    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124359  normal  0.295938 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2901  hypothetical protein  100 
 
 		 1271 aa  2520    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.839011  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1715  hypothetical protein  25.27 
 
 		 1382 aa  180  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5996  IcmF-like protein  23.89 
 
 		 1392 aa  180  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1176 aa  95.9  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1102 aa  95.5  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  27.19 
 
 		 1209 aa  91.3  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  30.49 
 
 		 1173 aa  88.2  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  29.24 
 
 		 1173 aa  87.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  26.11 
 
 		 1171 aa  85.1  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  24.79 
 
 		 1288 aa  85.1  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0393  ImcF domain-containing protein  24.93 
 
 		 1313 aa  84.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2907  type VI secretion protein IcmF  24.93 
 
 		 1315 aa  84.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0420  type VI secretion protein IcmF  24.93 
 
 		 1313 aa  84  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.419198  normal  0.652814 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2954  ImcF-like family protein  24.13 
 
 		 1301 aa  82.8  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.858657  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  26.67 
 
 		 1179 aa  82.8  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  25.91 
 
 		 1218 aa  82.8  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0855  putative lipoprotein  31 
 
 		 1296 aa  82  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0883646  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2826  hypothetical protein  24.13 
 
 		 1297 aa  82  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3632  hypothetical protein  24.13 
 
 		 1297 aa  82  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20293  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0050  hypothetical protein  24.13 
 
 		 1297 aa  82  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1717  hypothetical protein  24.13 
 
 		 1297 aa  82  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624106  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3625  hypothetical protein  24.13 
 
 		 1297 aa  82  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3650  hypothetical protein  24.13 
 
 		 1297 aa  82  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3151  hypothetical protein  24.13 
 
 		 1297 aa  82  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  27.64 
 
 		 1211 aa  82  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01945  hypothetical protein  26.77 
 
 		 1313 aa  81.6  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.206649 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  25.81 
 
 		 1207 aa  81.3  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2620  ImcF-related  24.66 
 
 		 1314 aa  81.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0485  ImcF domain-containing protein  24.66 
 
 		 1314 aa  81.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752194  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0459  type VI secretion protein IcmF  24.66 
 
 		 1314 aa  81.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821669  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3166  hypothetical protein  25.97 
 
 		 1150 aa  80.5  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3575  hypothetical protein  24.66 
 
 		 1315 aa  80.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  24.03 
 
 		 1172 aa  80.5  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3485  ImcF domain-containing protein  34.05 
 
 		 1365 aa  79.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  26.36 
 
 		 1206 aa  79  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0549  hypothetical protein  30.88 
 
 		 1299 aa  78.6  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553275  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2138  hypothetical protein  30.88 
 
 		 1328 aa  78.6  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  26.07 
 
 		 1206 aa  78.6  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2040  hypothetical protein  30.88 
 
 		 1334 aa  78.2  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  26.13 
 
 		 1204 aa  78.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3720  Fis family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 1194 aa  77.8  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  25.37 
 
 		 1199 aa  78.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0729.1  hypothetical protein  30.88 
 
 		 1525 aa  77  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  29.07 
 
 		 1176 aa  76.6  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0619  hypothetical protein  30.88 
 
 		 1355 aa  77.4  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.104026  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0730  hypothetical protein  30.88 
 
 		 1322 aa  77.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224461  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1688  hypothetical protein  30.88 
 
 		 1319 aa  77.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  22.61 
 
 		 1182 aa  76.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3045  hypothetical protein  24.87 
 
 		 1133 aa  75.9  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  26.3 
 
 		 1205 aa  75.5  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1205  hypothetical protein  24.54 
 
 		 1134 aa  75.1  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3221  type VI secretion protein IcmF  25.07 
 
 		 1194 aa  75.1  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  23.76 
 
 		 1270 aa  74.7  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  25.91 
 
 		 1230 aa  74.3  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  26.51 
 
 		 1268 aa  73.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  25.99 
 
 		 1212 aa  73.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  23.08 
 
 		 1181 aa  73.2  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2085  putative membrane protein, SciS/IcmF-like  29.04 
 
 		 1365 aa  72  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1195 aa  71.6  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  25.99 
 
 		 1157 aa  71.6  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  20.83 
 
 		 1182 aa  71.6  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  27.37 
 
 		 1302 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  27.37 
 
 		 1302 aa  71.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  27.37 
 
 		 1302 aa  71.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2775  OmpA/MotB domain-containing protein  25.07 
 
 		 831 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414663  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3090  OmpA domain-containing protein  24.5 
 
 		 831 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  28.11 
 
 		 1152 aa  70.5  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2499  OmpA/MotB domain-containing protein  24.78 
 
 		 831 aa  70.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  22.39 
 
 		 1181 aa  69.7  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  24.87 
 
 		 1209 aa  69.3  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  24.87 
 
 		 1209 aa  69.3  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  24.87 
 
 		 1209 aa  69.3  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  24.87 
 
 		 1209 aa  69.3  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  24.87 
 
 		 1209 aa  69.3  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  24.87 
 
 		 1209 aa  69.3  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  24.87 
 
 		 1209 aa  69.3  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2633  OmpA/MotB domain-containing protein  24.21 
 
 		 831 aa  69.3  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0992  hypothetical protein  33.53 
 
 		 1369 aa  68.2  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.894672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  24.66 
 
 		 1209 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1208 aa  67.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000209226 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4964  OmpA/MotB  25 
 
 		 830 aa  67.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  25.46 
 
 		 1220 aa  67.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  27.51 
 
 		 1175 aa  66.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  27.51 
 
 		 1175 aa  66.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  24.44 
 
 		 1208 aa  65.9  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  25.96 
 
 		 1168 aa  65.5  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  31.55 
 
 		 1302 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0016  hypothetical protein  23.86 
 
 		 1008 aa  63.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0326  putative lipoprotein  24.43 
 
 		 1177 aa  62.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0399  type VI secretion protein IcmF  24.43 
 
 		 1177 aa  62.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0553  hypothetical protein  29.39 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  25.97 
 
 		 1289 aa  62  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  25.97 
 
 		 1289 aa  62  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277614 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0311  type VI secretion protein IcmF  25.97 
 
 		 1289 aa  62  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685526 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  24.42 
 
 		 1164 aa  61.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  25.29 
 
 		 1289 aa  61.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  21.91 
 
 		 1187 aa  61.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>