More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0881 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_1363  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450515  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0881  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0140129  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1341  LysR family transcriptional regulator  99.32 
 
 		 296 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.545162  normal  0.0460764 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4506  LysR family transcriptional regulator  94.44 
 
 		 290 aa  550  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.964558  normal  0.619285 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4065  LysR family transcriptional regulator  74.14 
 
 		 299 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2240  LysR family transcriptional regulator  71.02 
 
 		 292 aa  424  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3231  transcriptional regulator, LysR family  71.23 
 
 		 291 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.421625  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2929  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  70.42 
 
 		 290 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000376093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3964  transcriptional regulator, LysR family  57.64 
 
 		 290 aa  322  4e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00150668  normal  0.033592 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3850  transcriptional regulator, LysR family  57.64 
 
 		 290 aa  322  4e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0588074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5878  transcriptional regulator, LysR family  53.42 
 
 		 294 aa  299  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2074  LysR family transcriptional regulator  53.08 
 
 		 316 aa  298  9e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4146  LysR family transcriptional regulator  52.43 
 
 		 291 aa  295  6e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5027  transcriptional regulator, LysR family  51.56 
 
 		 288 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2014  LysR family transcriptional regulator  50.38 
 
 		 289 aa  258  6e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0382671  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4682  transcriptional regulator, LysR family  44.33 
 
 		 291 aa  247  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.16132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53720  transcriptional regulator  44.78 
 
 		 294 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0163638  hitchhiker  0.00327626 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4703  transcriptional regulator  44.78 
 
 		 294 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2277  transcriptional regulator, LysR family  41.78 
 
 		 301 aa  226  4e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4905  putative LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00441942  hitchhiker  0.00167298 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3081  LysR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 293 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.294093  normal  0.575157 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3436  LysR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 293 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223747  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6838  transcriptional regulator, LysR family  38.33 
 
 		 294 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0288  transcriptional regulator, LysR family  35.06 
 
 		 293 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0307  transcriptional regulator, LysR family  36.86 
 
 		 293 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0158849  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8674  transcriptional regulator, LysR family  36.4 
 
 		 306 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441291  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2361  transcriptional regulator, LysR family  38.81 
 
 		 294 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.369632 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1094  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  39.04 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.827537 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2765  transcriptional regulator, LysR family  39.16 
 
 		 294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2061  LysR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 289 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  0.159895 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4318  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 318 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.485382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4048  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 318 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3423  LysR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1693  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0630  LysR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 292 aa  155  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.977268 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0843  LysR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 294 aa  155  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5637  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 284 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214014 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8676  transcriptional regulator, LysR family  35.54 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241599  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3733  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 316 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3619  LysR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4207  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.165273 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6172  transcriptional regulator, LysR family  36.6 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.442907  normal  0.0562293 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3893  LysR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.199081  normal  0.0200217 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6165  LysR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0309424  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3812  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 321 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3415  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 386 aa  149  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3973  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 296 aa  148  9e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.981589 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4562  LysR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0821586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3047  LysR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 296 aa  146  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.229406 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6263  transcriptional regulator, LysR family  33.09 
 
 		 304 aa  145  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0824  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 294 aa  145  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0817  transcriptional regulator, LysR family  35.96 
 
 		 297 aa  145  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5611  transcriptional regulator, LysR family  31.12 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2361  LysR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 287 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.709154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1899  LysR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 286 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.690335  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3560  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2214  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.598338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2404  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.229553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3899  transcriptional regulator, LysR family  33.05 
 
 		 305 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531376  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3484  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 304 aa  139  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.719553  normal  0.357365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2508  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000736174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1639  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6654  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1448  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 300 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0273001  normal  0.589236 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3510  LysR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499049 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4198  LysR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 303 aa  133  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.982202 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3299  LysR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11085 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5953  transcriptional regulator, LysR family  31.27 
 
 		 297 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2067  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 291 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0408016  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0912  LysR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2540  LysR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 296 aa  119  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4722  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 292 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.422329  normal  0.859213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2414  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 297 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0468  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06369  transcriptional regulator  29.66 
 
 		 313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3955  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.03 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2156  LysR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 300 aa  106  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 300 aa  105  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  31.42 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  23.76 
 
 		 300 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  23.67 
 
 		 300 aa  99  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2830  LysR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 303 aa  99  9e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1817  LysR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1477  LysR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 302 aa  98.2  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  33.85 
 
 		 343 aa  97.1  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0883  transcriptional regulator, LysR family  26.95 
 
 		 291 aa  97.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000429967 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  23.51 
 
 		 300 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4648  LysR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 305 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3720  LysR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 305 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101076  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2504  transcriptional regulator, LysR family  26.8 
 
 		 298 aa  96.7  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1352  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 305 aa  95.9  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1265  LysR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 294 aa  96.3  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  23.16 
 
 		 300 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 300 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01942  probable transcriptional regulator  26.55 
 
 		 287 aa  95.1  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.22412  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5656  LysR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5504  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>