More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1265 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1265  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 294 aa  581  1.0000000000000001e-165  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6838  transcriptional regulator, LysR family  35.95 
 
 		 294 aa  123  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8674  transcriptional regulator, LysR family  35.98 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441291  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5611  transcriptional regulator, LysR family  34.62 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6165  LysR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0309424  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3973  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.981589 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3893  LysR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.199081  normal  0.0200217 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4207  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.165273 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3733  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1094  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  34.71 
 
 		 311 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.827537 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1693  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 294 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2508  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 295 aa  113  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000736174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8676  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241599  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1899  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 286 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.690335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4318  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.485382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4048  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3415  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 386 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53720  transcriptional regulator  34.87 
 
 		 294 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0163638  hitchhiker  0.00327626 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3560  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 287 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4703  transcriptional regulator  34.45 
 
 		 294 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2214  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 287 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.598338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2361  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.709154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5878  transcriptional regulator, LysR family  33.05 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4506  LysR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.964558  normal  0.619285 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0817  transcriptional regulator, LysR family  33.88 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4682  transcriptional regulator, LysR family  32.07 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.16132  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2074  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 316 aa  99.8  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0307  transcriptional regulator, LysR family  32.78 
 
 		 293 aa  99  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0158849  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2404  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 291 aa  97.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.229553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0288  transcriptional regulator, LysR family  32.78 
 
 		 293 aa  96.3  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1341  LysR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 296 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.545162  normal  0.0460764 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0881  LysR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 296 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0140129  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1363  LysR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 296 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450515  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4146  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 291 aa  92.8  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0020  LysR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 330 aa  92.4  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3423  LysR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 295 aa  92.4  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3231  transcriptional regulator, LysR family  30.67 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.421625  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5027  transcriptional regulator, LysR family  29.3 
 
 		 288 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3812  LysR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 321 aa  90.9  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4198  LysR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 303 aa  90.9  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.982202 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2765  transcriptional regulator, LysR family  33.05 
 
 		 294 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2361  transcriptional regulator, LysR family  32.63 
 
 		 294 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.369632 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0066  oxidative stress regulatory protein OxyR, putative  28.46 
 
 		 307 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2240  LysR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3619  LysR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06369  transcriptional regulator  30.42 
 
 		 313 aa  88.2  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0202  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.09 
 
 		 307 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2929  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.25 
 
 		 290 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000376093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4396  LysR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 309 aa  87  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.20014 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2277  transcriptional regulator, LysR family  28.06 
 
 		 301 aa  86.3  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6172  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 290 aa  86.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.442907  normal  0.0562293 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48440  Transcriptional regulator, LysR family protein  28.53 
 
 		 311 aa  86.3  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0556278  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0164  LysR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 308 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.474897  normal  0.112541 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4905  putative LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 301 aa  85.9  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00441942  hitchhiker  0.00167298 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5558  LysR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 309 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4065  LysR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 299 aa  85.5  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2540  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1892  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0154443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2061  LysR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  0.159895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5637  LysR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214014 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3436  LysR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223747  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5357  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.164156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3081  LysR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.294093  normal  0.575157 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5309  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3964  transcriptional regulator, LysR family  29.24 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00150668  normal  0.033592 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3739  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.717698  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3850  transcriptional regulator, LysR family  29.24 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0588074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5218  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4332  LysR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.192569 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2184  LysR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.529425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2240  LysR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 290 aa  82  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.074644  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2953  transcriptional regulator, LysR family  28.99 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6121  putative transcriptional regulator  27.09 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0880  LysR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000302502 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2364  regulatory protein, LysR  27.2 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70560  LysR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2690  hydrogen peroxide-inducible genes activator transcription regulator protein  29.57 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196884  normal  0.211159 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1908  LysR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.605315  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1146  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.720199 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1639  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4028  LysR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4155  LysR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532001  normal  0.288769 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3047  LysR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.229406 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5605  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5969  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0037011 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2542  transcriptional regulator, LysR family  28.83 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.42186  normal  0.238303 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2522  LysR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0196222  normal  0.718346 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2529  transcriptional regulator, LysR family  26.25 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1668  transcriptional regulator, LysR family  26.64 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6263  transcriptional regulator, LysR family  28.29 
 
 		 304 aa  79  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0236  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0640  LysR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0324  LysR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0489134 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0693  LysR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0589363  normal  0.107501 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4595  LysR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0472  LysR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3244  LysR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5674  transcriptional regulator, LysR family  26.72 
 
 		 294 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0241  LysR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0594299  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0725  LysR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>