More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4146 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4146  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 291 aa  565  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3964  transcriptional regulator, LysR family  66.78 
 
 		 290 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00150668  normal  0.033592 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3850  transcriptional regulator, LysR family  66.78 
 
 		 290 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0588074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5878  transcriptional regulator, LysR family  64.97 
 
 		 294 aa  368  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2074  LysR family transcriptional regulator  64.73 
 
 		 316 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5027  transcriptional regulator, LysR family  54.51 
 
 		 288 aa  306  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3231  transcriptional regulator, LysR family  55.72 
 
 		 291 aa  299  4e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.421625  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4065  LysR family transcriptional regulator  55.07 
 
 		 299 aa  296  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0881  LysR family transcriptional regulator  52.43 
 
 		 296 aa  295  6e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0140129  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1363  LysR family transcriptional regulator  52.43 
 
 		 296 aa  295  6e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450515  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4506  LysR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 290 aa  295  8e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.964558  normal  0.619285 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1341  LysR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 296 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.545162  normal  0.0460764 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2240  LysR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 292 aa  292  5e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2929  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  51.57 
 
 		 290 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000376093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2014  LysR family transcriptional regulator  50.57 
 
 		 289 aa  246  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0382671  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2277  transcriptional regulator, LysR family  47.55 
 
 		 301 aa  240  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4682  transcriptional regulator, LysR family  45.62 
 
 		 291 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.16132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53720  transcriptional regulator  47.94 
 
 		 294 aa  225  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0163638  hitchhiker  0.00327626 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4703  transcriptional regulator  47.94 
 
 		 294 aa  225  8e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4905  putative LysR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 301 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00441942  hitchhiker  0.00167298 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2765  transcriptional regulator, LysR family  40.71 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6165  LysR family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 298 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0309424  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3893  LysR family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 298 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.199081  normal  0.0200217 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8674  transcriptional regulator, LysR family  38.14 
 
 		 306 aa  176  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441291  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1094  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  40.07 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.827537 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6838  transcriptional regulator, LysR family  38.19 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2361  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 294 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.369632 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0307  transcriptional regulator, LysR family  33.92 
 
 		 293 aa  169  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0158849  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0288  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 293 aa  169  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3733  LysR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 316 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4207  LysR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 316 aa  168  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.165273 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1693  LysR family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 294 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1899  LysR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.690335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8676  transcriptional regulator, LysR family  39.31 
 
 		 303 aa  165  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241599  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4318  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 318 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.485382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4048  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 318 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3560  LysR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2214  LysR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.598338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2361  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 287 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.709154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3619  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 292 aa  157  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3436  LysR family transcriptional regulator  40.42 
 
 		 293 aa  155  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223747  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3081  LysR family transcriptional regulator  40.42 
 
 		 293 aa  155  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.294093  normal  0.575157 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2061  LysR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  0.159895 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3899  transcriptional regulator, LysR family  38.87 
 
 		 305 aa  153  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531376  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3812  LysR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 321 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0817  transcriptional regulator, LysR family  38.58 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3510  LysR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 305 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499049 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0843  LysR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 294 aa  148  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3423  LysR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 295 aa  147  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3415  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 386 aa  146  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4562  LysR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0821586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2404  LysR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.229553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3973  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.981589 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6263  transcriptional regulator, LysR family  34.6 
 
 		 304 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3047  LysR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.229406 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0630  LysR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 292 aa  135  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.977268 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0824  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 294 aa  135  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1448  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 300 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0273001  normal  0.589236 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6172  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.442907  normal  0.0562293 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5637  LysR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 284 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214014 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4198  LysR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.982202 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2540  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 296 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2508  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 295 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000736174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5953  transcriptional regulator, LysR family  32.36 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1639  LysR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 291 aa  122  9e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3299  LysR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11085 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5611  transcriptional regulator, LysR family  28.18 
 
 		 300 aa  119  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06369  transcriptional regulator  29.45 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6654  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3484  LysR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.719553  normal  0.357365 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0912  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2414  LysR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 297 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2067  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 291 aa  109  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0408016  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3406  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3441  LysR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.985803  hitchhiker  0.000545962 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1477  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2710  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1477  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490418  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  34 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0640  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404969  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0468  LysR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 281 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1733  LysR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 321 aa  106  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192173  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 300 aa  105  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  34.65 
 
 		 308 aa  104  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6486  LysR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.898531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3955  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.61 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2803  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4722  LysR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.422329  normal  0.859213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6402  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 306 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  35.29 
 
 		 295 aa  102  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0835  LysR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 364 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.643048  normal  0.134814 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1236  transcriptional regulator, LysR family  34.89 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.387856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3296  putative transcriptional regulator  29.97 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1323  transcriptional regulator, LysR family  35.51 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.672802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0634  transcriptional regulator, LysR family  31.67 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  26.6 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4639  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5341  transcriptional regulator, LysR family  27.37 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  34.49 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>