More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4332 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4332  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 322 aa  634    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.192569 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4258  LysR family transcriptional regulator  90.6 
 
 		 324 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000322275  normal  0.291144 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4108  LysR family transcriptional regulator  90.6 
 
 		 324 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.147641  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1753  LysR family transcriptional regulator  91.04 
 
 		 305 aa  509  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0990804  normal  0.117746 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3259  LysR family transcriptional regulator  91.04 
 
 		 307 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3682  LysR family transcriptional regulator  89.8 
 
 		 326 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4155  LysR family transcriptional regulator  88.73 
 
 		 307 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532001  normal  0.288769 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1794  transcriptional regulator, LysR family  49.32 
 
 		 301 aa  296  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3600  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  48.67 
 
 		 322 aa  292  5e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0326456  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3227  LysR family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 296 aa  292  6e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2539  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 296 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00516112 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30980  Transcriptional regulator LysR family protein  50.74 
 
 		 303 aa  264  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1550  transcriptional regulator, LysR family  45.87 
 
 		 303 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.93213 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30450  LysR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 298 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21680  Transcriptional regulator, LysR family  49.22 
 
 		 273 aa  248  7e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291756  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5230  LysR family transcriptional regulator  51.89 
 
 		 212 aa  223  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.957267  normal  0.114688 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1243  LysR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1913  LysR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 281 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3859  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000387155  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0027  transcriptional regulatory protein  40.34 
 
 		 312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000739069  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3798  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000255369  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3119  transcriptional regulatory protein  40.34 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234841  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0290  LysR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000353581  unclonable  0.0000000000404999 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0237  LysR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000618389  unclonable  0.0000000000250683 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2796  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000015017  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0213  LysR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 309 aa  176  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000718825  unclonable  0.0000000000104245 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0229  LysR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 306 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.00000000369009  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3409  LysR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000205674  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0310  LysR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418472  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3677  transcriptional regulator, LysR family  30.77 
 
 		 292 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1148  transcriptional regulator, LysR family  25.09 
 
 		 303 aa  98.2  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000219344  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0666  LysR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 295 aa  94.7  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6547  LysR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94219  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2156  LysR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 300 aa  89  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6063  LysR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5699  LysR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1713  transcriptional regulator, LysR family  24.32 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6793  transcriptional regulator, LysR family  30.58 
 
 		 319 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2915  transcriptional regulator, LysR family  26.9 
 
 		 305 aa  87  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  27.38 
 
 		 302 aa  86.3  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08961  transcriptional regulator, LysR family protein  26.21 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5310  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2421  LysR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.324279 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1027  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1679  transcriptional regulator, LysR family  23.94 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0002  transcriptional regulator, LysR family  28.93 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1312  LysR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0843658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6156  LysR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1450  LysR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0188  LysR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4165  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1398  LysR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0713  LysR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730012  normal  0.411699 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1265  LysR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5516  LysR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0587498  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0230  transcriptional regulator, LysR family  22.83 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5880  LysR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311857  normal  0.281069 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0205  LysR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0191  LysR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0208  LysR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6389  LysR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0907959  normal  0.0995777 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0186  LysR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000312054  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0226  LysR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 288 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0195  LysR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 288 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0223  transcriptional regulator, LysR family  22.46 
 
 		 288 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2000  transcriptional regulator, LysR family  28.12 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40236  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1108  LysR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 337 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.102258 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1313  LysR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000621922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6251  LysR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1695  putative LysR substrate binding domain  23.91 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1196  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1647  putative LysR substrate binding domain  23.91 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0636291  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4767  LysR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1636  putative LysR substrate binding domain  23.91 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1812  putative LysR substrate binding domain-containing protein  23.91 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5097  transcriptional regulator, LysR family  22.1 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0520  hydrogen peroxide-inducible genes activator  29.63 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.454545  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0247  transcriptional regulator, LysR family  23.24 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6511  transcriptional regulator, LysR family  25.25 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000105391  normal  0.0531961 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1628  putative LysR substrate binding domain  23.91 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4969  LysR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5263  transcriptional regulator, LysR family  25 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2503  LysR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1654  hydrogen peroxide-inducible genes activator  29.63 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00724333  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  25.91 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6072  transcriptional regulator, LysR family  30.82 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0650  transcriptional regulator, LysR family  29.45 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.344002 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0020  LysR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0687  LysR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591422  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5687  LysR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145424 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2608  LysR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  28.28 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2180  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  25.52 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0532  transcriptional regulator, LysR family  27.31 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5523  transcriptional regulator, LysR family  25.6 
 
 		 322 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.553864 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4195  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  25.57 
 
 		 305 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6469  LysR family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 305 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113472  normal  0.0944873 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>