More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2074 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2074  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 316 aa  627  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5878  transcriptional regulator, LysR family  96.59 
 
 		 294 aa  558  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3850  transcriptional regulator, LysR family  65.07 
 
 		 290 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0588074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3964  transcriptional regulator, LysR family  65.07 
 
 		 290 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00150668  normal  0.033592 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4146  LysR family transcriptional regulator  64.73 
 
 		 291 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5027  transcriptional regulator, LysR family  54.45 
 
 		 288 aa  311  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4506  LysR family transcriptional regulator  53.77 
 
 		 290 aa  305  7e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.964558  normal  0.619285 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3231  transcriptional regulator, LysR family  54.17 
 
 		 291 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.421625  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4065  LysR family transcriptional regulator  55.44 
 
 		 299 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2240  LysR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 292 aa  301  9e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0881  LysR family transcriptional regulator  53.08 
 
 		 296 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0140129  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1363  LysR family transcriptional regulator  53.08 
 
 		 296 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450515  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1341  LysR family transcriptional regulator  52.74 
 
 		 296 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.545162  normal  0.0460764 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2929  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  51.03 
 
 		 290 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000376093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2014  LysR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 289 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0382671  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2277  transcriptional regulator, LysR family  43.34 
 
 		 301 aa  240  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4682  transcriptional regulator, LysR family  46.83 
 
 		 291 aa  235  7e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.16132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53720  transcriptional regulator  45.59 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0163638  hitchhiker  0.00327626 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4703  transcriptional regulator  45.22 
 
 		 294 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4905  putative LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00441942  hitchhiker  0.00167298 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8674  transcriptional regulator, LysR family  36.49 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441291  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2765  transcriptional regulator, LysR family  37.54 
 
 		 294 aa  176  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2361  transcriptional regulator, LysR family  36.99 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.369632 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1094  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  37.7 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.827537 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1899  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.690335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6838  transcriptional regulator, LysR family  39.42 
 
 		 294 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3812  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8676  transcriptional regulator, LysR family  37.16 
 
 		 303 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241599  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0307  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0158849  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3733  LysR family transcriptional regulator  37.94 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0288  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4207  LysR family transcriptional regulator  37.94 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.165273 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3081  LysR family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 293 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.294093  normal  0.575157 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3436  LysR family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 293 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223747  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2061  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 289 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  0.159895 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0817  transcriptional regulator, LysR family  39.64 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1693  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 294 aa  155  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3619  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 292 aa  155  8e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0843  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6263  transcriptional regulator, LysR family  33.78 
 
 		 304 aa  152  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4048  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4318  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.485382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3047  LysR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.229406 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3893  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 298 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.199081  normal  0.0200217 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6165  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 298 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0309424  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3899  transcriptional regulator, LysR family  38.33 
 
 		 305 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531376  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4562  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 294 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0821586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0630  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.977268 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6172  transcriptional regulator, LysR family  33.68 
 
 		 290 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.442907  normal  0.0562293 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2404  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.229553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5637  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 284 aa  145  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214014 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2540  LysR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 296 aa  144  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3423  LysR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2361  LysR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.709154  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3560  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 287 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2214  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 287 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.598338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3510  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 305 aa  139  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499049 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3415  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 386 aa  138  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3973  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.981589 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0824  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1448  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0273001  normal  0.589236 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1639  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 291 aa  133  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06369  transcriptional regulator  29.9 
 
 		 313 aa  133  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6654  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5611  transcriptional regulator, LysR family  29.17 
 
 		 300 aa  129  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3299  LysR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2508  LysR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 295 aa  125  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000736174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2414  LysR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 297 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0912  LysR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 303 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4198  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.982202 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5953  transcriptional regulator, LysR family  32.37 
 
 		 297 aa  116  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2504  transcriptional regulator, LysR family  29.93 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3484  LysR family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.719553  normal  0.357365 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2067  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0408016  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0468  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 281 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6486  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.898531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2156  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 300 aa  106  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3178  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 305 aa  105  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.0310919 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0640  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404969  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5523  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.553864 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4722  LysR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 292 aa  104  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.422329  normal  0.859213 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4958  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.468232 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1053  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 310 aa  103  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262564  normal  0.905939 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4438  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 295 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948245 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3338  LysR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 295 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.714315  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5029  LysR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 295 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.534863  normal  0.59636 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5310  transcriptional regulator, LysR family  30.51 
 
 		 294 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1453799999999997e-20 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5255  LysR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 295 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.294771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3181  LysR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3296  putative transcriptional regulator  29.59 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2411  transcription regulator protein  32.62 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3334  transcriptional regulator, LysR family  29.56 
 
 		 302 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1478  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 309 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0854082  hitchhiker  0.000187974 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1265  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5341  transcriptional regulator, LysR family  30.15 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1781  transcriptional regulator, LysR family  30.68 
 
 		 297 aa  99.8  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0545  transcriptional regulator, LysR family  28.21 
 
 		 305 aa  99.4  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  32.51 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3955  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  34.78 
 
 		 308 aa  99  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>