More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0843 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0843  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 294 aa  578  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0824  LysR family transcriptional regulator  82.19 
 
 		 294 aa  438  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2765  transcriptional regulator, LysR family  58.7 
 
 		 294 aa  322  7e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2361  transcriptional regulator, LysR family  57.68 
 
 		 294 aa  318  5e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.369632 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1448  LysR family transcriptional regulator  48.47 
 
 		 300 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0273001  normal  0.589236 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6654  LysR family transcriptional regulator  50.18 
 
 		 293 aa  239  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5953  transcriptional regulator, LysR family  47.92 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4562  LysR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 294 aa  212  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0821586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4722  LysR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.422329  normal  0.859213 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4506  LysR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 290 aa  169  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.964558  normal  0.619285 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4065  LysR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6838  transcriptional regulator, LysR family  36.95 
 
 		 294 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1899  LysR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 286 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.690335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0288  transcriptional regulator, LysR family  35.56 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4146  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1341  LysR family transcriptional regulator  42.8 
 
 		 296 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.545162  normal  0.0460764 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0881  LysR family transcriptional regulator  42.8 
 
 		 296 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0140129  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1363  LysR family transcriptional regulator  42.8 
 
 		 296 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450515  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3560  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 287 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0307  transcriptional regulator, LysR family  34.86 
 
 		 293 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0158849  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2214  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 287 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.598338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5878  transcriptional regulator, LysR family  35.92 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3964  transcriptional regulator, LysR family  34.26 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00150668  normal  0.033592 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2074  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3850  transcriptional regulator, LysR family  34.26 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0588074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2361  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.709154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2240  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 292 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3619  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 292 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8674  transcriptional regulator, LysR family  36.73 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441291  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3231  transcriptional regulator, LysR family  39.83 
 
 		 291 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.421625  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3893  LysR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.199081  normal  0.0200217 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6165  LysR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0309424  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8676  transcriptional regulator, LysR family  38.75 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241599  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2929  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.17 
 
 		 290 aa  152  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000376093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0817  transcriptional regulator, LysR family  41.54 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1094  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  37.83 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.827537 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5027  transcriptional regulator, LysR family  37.73 
 
 		 288 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4905  putative LysR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 301 aa  149  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00441942  hitchhiker  0.00167298 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4682  transcriptional regulator, LysR family  38.4 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.16132  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2014  LysR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 289 aa  147  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0382671  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2061  LysR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 289 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  0.159895 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3081  LysR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 293 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.294093  normal  0.575157 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3436  LysR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 293 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223747  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3973  LysR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 296 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.981589 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4048  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 318 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4318  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 318 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.485382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3733  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3415  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 386 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4207  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.165273 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2277  transcriptional regulator, LysR family  36.43 
 
 		 301 aa  135  6.0000000000000005e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4703  transcriptional regulator  36.24 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1693  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3423  LysR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53720  transcriptional regulator  36.24 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0163638  hitchhiker  0.00327626 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6172  transcriptional regulator, LysR family  33.57 
 
 		 290 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.442907  normal  0.0562293 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5611  transcriptional regulator, LysR family  33.92 
 
 		 300 aa  125  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1639  LysR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3812  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3047  LysR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.229406 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6263  transcriptional regulator, LysR family  35.74 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4198  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.982202 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06369  transcriptional regulator  32.77 
 
 		 313 aa  115  8.999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2508  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000736174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0630  LysR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 292 aa  112  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.977268 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3899  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 305 aa  112  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531376  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3484  LysR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.719553  normal  0.357365 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2540  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 296 aa  106  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2309  putative transcriptional regulator  35.52 
 
 		 284 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27280  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 284 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2404  LysR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 291 aa  105  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.229553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3510  LysR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499049 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0468  LysR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3156  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30 
 
 		 325 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.46065  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2067  LysR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 291 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0408016  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3322  transcriptional regulator, LysR family  31.97 
 
 		 296 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151906  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3299  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 291 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2414  LysR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 297 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0912  LysR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 303 aa  97.1  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5637  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 284 aa  91.3  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214014 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3624  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.23 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00214713  normal  0.293437 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1151  transcriptional regulator, LysR family  34.02 
 
 		 307 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.88835 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1838  LysR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 296 aa  90.1  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4825  transcriptional regulator, LysR family  38.24 
 
 		 293 aa  89.7  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0864247  normal  0.0253512 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1141  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 297 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387698 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2077  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 296 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6793  transcriptional regulator, LysR family  32.23 
 
 		 319 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5919  LysR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0217311  normal  0.163471 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0765  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 322 aa  86.3  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0748  LysR family transcriptional regulator  32.36 
 
 		 310 aa  86.3  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0425  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 281 aa  86.3  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4357  transcriptional regulator, LysR family  33.19 
 
 		 283 aa  85.9  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1438  LysR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 283 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  0.234333 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0683  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 283 aa  85.5  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5774  transcriptional regulator LysR family  33.13 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1045  transcriptional regulator, LysR family  30.17 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17090  Transcriptional regulator, LysR family  27.4 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3993  LysR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3056  LysR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4653  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.519057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>