96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4736 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4214  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  97.64 
 
 		 381 aa  654    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4736  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  100 
 
 		 381 aa  739    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal  0.482732 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3755  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  82.34 
 
 		 443 aa  597  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00143257 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3527  Type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  86.98 
 
 		 384 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.20838  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4839  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  86.98 
 
 		 384 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0073947  decreased coverage  0.0012825 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5445  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  86.98 
 
 		 384 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322534  normal  0.0784231 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5643  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  27.59 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.82857  normal  0.117856 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5860  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  28.14 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003363  type III secretion inner membrane protein YscQ  27.57 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5929  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  39.78 
 
 		 364 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0597281 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0429  SctQ  37.33 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193635  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1999  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  36.36 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1907  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  36.36 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0878707  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2080  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  31.1 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.355086  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2168  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  31.1 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.712652  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01727  type III secretion system protein  23.55 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0835  type III secretion system protein BsaV  31.37 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0264948  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0578  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  30.73 
 
 		 319 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.194369  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1537  type III secretion system protein BsaV  30.52 
 
 		 327 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.402706  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03405  type III secretion apparatus protein, YscQ/HrcQ family  38.46 
 
 		 273 aa  55.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0861  Hrp conserved protein HRCQ  37.5 
 
 		 354 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2067  type III secretion system protein BsaV  29.55 
 
 		 335 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0878838  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0747  type III secretion system protein BsaV  29.55 
 
 		 335 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0174  flagellar motor switch protein FliN  34.83 
 
 		 149 aa  52.4  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2279  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  40 
 
 		 424 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1629  type III secretion inner membrane protein SctQ  40 
 
 		 645 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1956  type III secretion inner membrane protein SctQ  40 
 
 		 645 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0677  type III secretion inner membrane protein SctQ  40 
 
 		 428 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.129749  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0636  type III secretion inner membrane protein SctQ  40 
 
 		 645 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0753  surface presentation of antigens domain-containing protein  40 
 
 		 423 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67104  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2196  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  40 
 
 		 436 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.583372  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42610  type III secretion system protein  35.23 
 
 		 309 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  35.37 
 
 		 175 aa  49.7  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0558  flagellar motor switch FliN  33.33 
 
 		 139 aa  49.3  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139719  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1708  flagellar motor switch protein  27.97 
 
 		 138 aa  49.3  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1459  flagellar motor switch protein FliN  34.21 
 
 		 107 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.717183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0862  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.33 
 
 		 398 aa  46.6  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1970  flagellar motor switch FliN  32 
 
 		 142 aa  46.6  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0450  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  32.84 
 
 		 352 aa  46.2  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.180414  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4387  flagellar motor switch protein FliN  30.69 
 
 		 148 aa  46.2  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03153  flagellar motor switch protein  29.66 
 
 		 136 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  33.68 
 
 		 136 aa  46.2  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  30.63 
 
 		 138 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5883  Type III secretion system outer membrane O protein  34.25 
 
 		 142 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.6073  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  30.63 
 
 		 138 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0044  type III secretion system protein  36.11 
 
 		 307 aa  45.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5213  surface presentation of antigens (SPOA) protein  26.04 
 
 		 327 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.200341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00973  flagellar protein  31.52 
 
 		 112 aa  45.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0380826  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  28.45 
 
 		 152 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06193  flagellar protein  31.52 
 
 		 112 aa  45.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  28.04 
 
 		 166 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  32.97 
 
 		 156 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  33.33 
 
 		 375 aa  45.1  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5299  flagellar motor switch FliN  32.89 
 
 		 156 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.934631  normal  0.10372 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1872  flagellar motor switch protein FliN  31.51 
 
 		 111 aa  44.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267191  normal  0.473896 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  33.33 
 
 		 155 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  32.88 
 
 		 203 aa  44.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  30.25 
 
 		 152 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3436  flagellar motor switch protein FliN  31.86 
 
 		 153 aa  43.9  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2928  flagellar motor switch FliN  37.18 
 
 		 111 aa  43.9  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  34.25 
 
 		 137 aa  44.3  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1608  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein FliN  36.47 
 
 		 132 aa  43.9  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429927  normal  0.0945773 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002823  flagellar motor switch protein FliN  28.81 
 
 		 136 aa  43.9  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3019  surface presentation of antigens protein SpaO  23.7 
 
 		 315 aa  43.5  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000335444  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0845  surface presentation of antigens protein SpaO  23.7 
 
 		 315 aa  43.9  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.176147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3678  flagellar motor switch protein FliN  32.18 
 
 		 150 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4176  flagellar motor switch protein FliN  34.57 
 
 		 155 aa  43.5  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  32.14 
 
 		 97 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  32.14 
 
 		 97 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4755  flagellar motor switch protein FliN  32.18 
 
 		 150 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.853225 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0646  flagellar motor switch protein FliN  30.69 
 
 		 143 aa  43.5  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1883  flagellar motor switch protein FliN  28.79 
 
 		 137 aa  43.5  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2583  flagellar motor switch protein FliN  28.79 
 
 		 137 aa  43.5  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3073  flagellar motor switch protein FliN  28.57 
 
 		 149 aa  43.5  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154609  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3799  flagellar motor switch protein FliN  28.57 
 
 		 149 aa  43.5  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1121  flagellar motor switch protein FliN  29.31 
 
 		 163 aa  43.5  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.5679 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2686  flagellar motor switch protein FliN  31.18 
 
 		 162 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  34.25 
 
 		 138 aa  43.1  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  27.59 
 
 		 152 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  32.14 
 
 		 97 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3223  Type III secretion system outer membrane O protein  32.18 
 
 		 163 aa  43.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3496  flagellar motor switch protein FliN  31.18 
 
 		 162 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1866  flagellar motor switch protein FliN  31.18 
 
 		 162 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996713  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2300  flagellar motor switch protein  28.85 
 
 		 127 aa  43.1  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0040  flagellar motor switch protein FliN  32.18 
 
 		 163 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0030  flagellar motor switch protein FliN  31.18 
 
 		 165 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0030  flagellar motor switch protein FliN  31.18 
 
 		 165 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2438  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  26.07 
 
 		 409 aa  43.1  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2763  flagellar motor switch protein FliN  31.18 
 
 		 124 aa  42.7  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  30.53 
 
 		 153 aa  43.1  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0039  flagellar motor switch protein FliN  32.18 
 
 		 162 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0058  flagellar motor switch protein FliN  32.18 
 
 		 162 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  32.18 
 
 		 161 aa  42.7  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0031  flagellar motor switch FliN  32.18 
 
 		 162 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  31.18 
 
 		 143 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2985  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  28.41 
 
 		 475 aa  42.7  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>