241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003363 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003363  type III secretion inner membrane protein YscQ  100 
 
 		 322 aa  653    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01727  type III secretion system protein  68.63 
 
 		 322 aa  461  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0044  type III secretion system protein  30.38 
 
 		 307 aa  112  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42610  type III secretion system protein  29.15 
 
 		 309 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0741  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  32 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.1614  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0740  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  31.33 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0705  surface presentation of antigens (SPOA) protein  30.67 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148267  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2985  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  30.95 
 
 		 475 aa  72.8  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5929  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  31.32 
 
 		 364 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0597281 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3755  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  25.18 
 
 		 443 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00143257 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4736  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  30.72 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal  0.482732 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0747  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  30.94 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.12595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4214  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  28.31 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5860  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  31.63 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0109  surface presentation of antigens (SPOA) protein  31.06 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0429  SctQ  27.84 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193635  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3480  flagellar motor switch protein FliN  32.95 
 
 		 124 aa  58.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3527  Type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  30.77 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.20838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0845  surface presentation of antigens protein SpaO  22.11 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.176147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4839  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  30.77 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0073947  decreased coverage  0.0012825 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3019  surface presentation of antigens protein SpaO  22.11 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000335444  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5445  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  30.77 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322534  normal  0.0784231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3983  surface presentation of antigens (SPOA) protein  38.24 
 
 		 118 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  37.31 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0174  flagellar motor switch protein FliN  38.81 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1999  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  27.84 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1907  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  27.84 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0878707  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  32.84 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0855  flagellar motor switch protein FliN  35.71 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.172432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  31.34 
 
 		 422 aa  56.2  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0088  flagellar motor switch protein FliN  36.76 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  33.78 
 
 		 346 aa  55.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0745  flagellar motor switch protein FliN  35.38 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.898519  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0082  flagellar motor switch protein FliN  36.76 
 
 		 118 aa  55.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4649  flagellar motor switch protein FliN  35.29 
 
 		 113 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.519755  normal  0.588244 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5643  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  28.73 
 
 		 374 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.82857  normal  0.117856 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.78 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0964  flagellar motor switch protein FliN  36.23 
 
 		 249 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3185  type III secretion apparatus protein EpaO2  21.39 
 
 		 190 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  32.58 
 
 		 97 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3778  flagellar motor switch protein FliN  32.26 
 
 		 154 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  32.58 
 
 		 97 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2939  flagellar motor switch protein FliN  32.26 
 
 		 154 aa  52.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5213  surface presentation of antigens (SPOA) protein  25.95 
 
 		 327 aa  52.8  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.200341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  32.91 
 
 		 147 aa  52.8  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  33.33 
 
 		 156 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3201  surface presentation of antigens protein SpaO  25.27 
 
 		 303 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3081  surface presentation of antigens protein SpaO  25.27 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.892748 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3044  surface presentation of antigens protein SpaO  25.27 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.118327 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0168  flagellar motor switch protein FliN  31.34 
 
 		 115 aa  52.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0055  flagellar motor switch protein FliN  35.29 
 
 		 130 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  33.33 
 
 		 97 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  32.39 
 
 		 135 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3096  surface presentation of antigens protein SpaO  25.27 
 
 		 303 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.614249  hitchhiker  0.00000334679 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3883  flagellar motor switch protein  34.33 
 
 		 157 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.444092  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  24.19 
 
 		 124 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  24.19 
 
 		 124 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45790  flagellar motor switch protein  34.33 
 
 		 157 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0114  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  31.65 
 
 		 372 aa  52  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00175388  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3013  surface presentation of antigens protein SpaO  25.56 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.78 
 
 		 375 aa  52.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  30.99 
 
 		 126 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1658  flagellar motor switch protein FliN  23.88 
 
 		 194 aa  51.2  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3220  flagellar motor switch protein  25 
 
 		 124 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  30.99 
 
 		 126 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  30.99 
 
 		 126 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0157  flagellar motor switch protein FliN  31.18 
 
 		 154 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.491458 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  34.33 
 
 		 175 aa  51.2  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  30.99 
 
 		 124 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.33 
 
 		 370 aa  51.2  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  30.99 
 
 		 126 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0217  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein  31.34 
 
 		 115 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4176  flagellar motor switch protein FliN  37.31 
 
 		 155 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3058  flagellar motor switch protein  30.99 
 
 		 127 aa  50.8  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.173815  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  34.33 
 
 		 155 aa  51.2  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0040  flagellar motor switch protein FliN  33.33 
 
 		 163 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2814  flagellar motor switch protein  34.33 
 
 		 155 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535531  normal  0.0823858 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2702  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  28.36 
 
 		 401 aa  50.8  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0537803  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  30.99 
 
 		 127 aa  51.2  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  35.82 
 
 		 226 aa  50.8  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  30.99 
 
 		 124 aa  50.8  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  35.82 
 
 		 174 aa  50.8  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2164  surface presentation of antigens (SPOA) protein  33.8 
 
 		 143 aa  50.4  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3223  Type III secretion system outer membrane O protein  33.33 
 
 		 163 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0767  flagellar motor switch protein FliN  31.25 
 
 		 293 aa  50.4  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0246  lateral flagellar export/assembly protein LfiN  33.78 
 
 		 123 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1334  flagellar motor switch protein  30.99 
 
 		 127 aa  50.4  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0031  flagellar motor switch FliN  33.33 
 
 		 162 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  33.33 
 
 		 161 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0039  flagellar motor switch protein FliN  33.33 
 
 		 162 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0058  flagellar motor switch protein FliN  33.33 
 
 		 162 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1664  flagellar motor switch protein FliN  30.77 
 
 		 249 aa  50.1  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  32.35 
 
 		 152 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06193  flagellar protein  29.35 
 
 		 112 aa  50.1  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  32.35 
 
 		 152 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5883  Type III secretion system outer membrane O protein  33.33 
 
 		 142 aa  50.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.6073  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1190  flagellar motor switch protein  30.99 
 
 		 127 aa  50.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1369  flagellar motor switch protein  30.99 
 
 		 126 aa  50.1  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4755  flagellar motor switch protein FliN  33.33 
 
 		 150 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.853225 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03405  type III secretion apparatus protein, YscQ/HrcQ family  27.91 
 
 		 273 aa  50.1  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>