293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0745 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0745  flagellar motor switch protein FliN  100 
 
 
246 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.898519  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1664  flagellar motor switch protein FliN  48.71 
 
 
249 aa  156  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2333  flagellar motor switch protein FliN  49.2 
 
 
250 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0940353  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0964  flagellar motor switch protein FliN  55.37 
 
 
249 aa  145  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2013  flagellar motor switch protein FliN  36.5 
 
 
259 aa  122  5e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31080  flagellar motor switch protein FliN  48.17 
 
 
247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.713514  normal  0.558701 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0855  flagellar motor switch protein FliN  58.93 
 
 
123 aa  113  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.172432  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  49.48 
 
 
422 aa  105  8e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  59.46 
 
 
346 aa  100  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  59.46 
 
 
346 aa  100  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2978  flagellar motor switch protein FliN  37.44 
 
 
238 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563329 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  58.11 
 
 
375 aa  99.4  5e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  60.53 
 
 
97 aa  99  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  60.53 
 
 
97 aa  99  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  49.47 
 
 
393 aa  98.6  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  52.63 
 
 
375 aa  98.6  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1938  flagellar motor switch protein FliN  54.76 
 
 
359 aa  98.2  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2702  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  45.79 
 
 
401 aa  97.8  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0537803  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2160  flagellar motor switch protein  52.38 
 
 
378 aa  97.1  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000995507  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  48.42 
 
 
417 aa  97.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  59.21 
 
 
97 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  51.28 
 
 
401 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5883  Type III secretion system outer membrane O protein  48.35 
 
 
142 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.6073  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1680  flagellar motor switch protein  44.44 
 
 
375 aa  94  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  43.62 
 
 
357 aa  94  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3778  flagellar motor switch protein FliN  45.37 
 
 
154 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0114  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  50 
 
 
372 aa  93.6  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00175388  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  52.56 
 
 
155 aa  93.2  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1403  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  50 
 
 
381 aa  93.6  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  50.53 
 
 
156 aa  93.2  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0157  flagellar motor switch protein FliN  50.57 
 
 
154 aa  93.2  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.491458 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2939  flagellar motor switch protein FliN  50.57 
 
 
154 aa  92.4  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0478  flagellar motor switch protein  50.65 
 
 
406 aa  92  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000894996  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  43.69 
 
 
175 aa  92  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0862  CheC, inhibitor of MCP methylation  50 
 
 
398 aa  91.7  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2038  flagellar motor switch protein  48.05 
 
 
402 aa  91.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0278595  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0040  flagellar motor switch protein FliN  50.59 
 
 
163 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0058  flagellar motor switch protein FliN  50.59 
 
 
162 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3223  Type III secretion system outer membrane O protein  50.59 
 
 
163 aa  89.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0042  flagellar motor switch protein FliN  50.57 
 
 
159 aa  90.1  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0031  flagellar motor switch FliN  50.59 
 
 
162 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  50.59 
 
 
161 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0039  flagellar motor switch protein FliN  50.59 
 
 
162 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  51.35 
 
 
370 aa  90.1  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0151  flagellar motor switch protein FliN  50.55 
 
 
95 aa  89.4  4e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5299  flagellar motor switch FliN  47.25 
 
 
156 aa  89.7  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.934631  normal  0.10372 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4755  flagellar motor switch protein FliN  47.78 
 
 
150 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.853225 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0028  flagellar motor switch protein FliN  49.43 
 
 
143 aa  88.2  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182038  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3678  flagellar motor switch protein FliN  47.78 
 
 
150 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0055  flagellar motor switch protein FliN  55.17 
 
 
130 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0283  flagellar switch protein FliY  45.56 
 
 
113 aa  86.7  3e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  46.34 
 
 
135 aa  86.3  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  47.19 
 
 
153 aa  85.9  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  52 
 
 
139 aa  85.9  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1970  flagellar motor switch FliN  41.18 
 
 
142 aa  85.9  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0573  flagellar motor switch protein  52.63 
 
 
142 aa  85.5  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2762  flagellar motor switch protein FliY  48.72 
 
 
393 aa  85.5  7e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2686  flagellar motor switch protein FliN  47.13 
 
 
162 aa  85.1  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1866  flagellar motor switch protein FliN  47.13 
 
 
162 aa  85.1  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0030  flagellar motor switch protein FliN  47.13 
 
 
165 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  46.99 
 
 
147 aa  85.1  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4176  flagellar motor switch protein FliN  51.32 
 
 
155 aa  85.5  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0030  flagellar motor switch protein FliN  47.13 
 
 
165 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  51.28 
 
 
360 aa  85.5  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3496  flagellar motor switch protein FliN  47.13 
 
 
162 aa  85.1  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2763  flagellar motor switch protein FliN  47.13 
 
 
124 aa  85.1  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1755  flagellar motor switch protein FliN  49.38 
 
 
111 aa  85.1  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  47.13 
 
 
143 aa  85.1  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  43.82 
 
 
180 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  44.44 
 
 
154 aa  84.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2908  flagellar motor switch protein FliN  51.35 
 
 
155 aa  85.1  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002823  flagellar motor switch protein FliN  40.66 
 
 
136 aa  84  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1755  flagellar motor switch protein FliN  44.68 
 
 
109 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2537  flagellar motor switch protein FliN  48.78 
 
 
137 aa  83.6  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.964599 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4387  flagellar motor switch protein FliN  46.07 
 
 
148 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2583  flagellar motor switch protein FliN  48.19 
 
 
137 aa  83.6  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1702  flagellar motor switch protein FliN  48.75 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000907552  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  47.56 
 
 
137 aa  83.6  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  48.75 
 
 
137 aa  83.6  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0061  flagellar motor switch FliN protein  50 
 
 
98 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.517527  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  42.7 
 
 
175 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1353  surface presentation of antigens (SPOA) protein  50 
 
 
151 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  48.75 
 
 
137 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03153  flagellar motor switch protein  40.66 
 
 
136 aa  83.6  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  41.86 
 
 
170 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  48.75 
 
 
137 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1883  flagellar motor switch protein FliN  48.19 
 
 
137 aa  82.8  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1265  flagellar motor switch protein FliN  48.75 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  41.57 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  46.91 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2140  flagellar motor switch protein FliN  48.75 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280572 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1142  flagellar motor switch protein FliN  48.75 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0539046  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2135  flagellar motor switch protein FliN  48.75 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.120788 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  48.75 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2193  flagellar motor switch protein FliN  48.75 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  46.84 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  46.91 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1238  flagellar motor switch protein FliN  48.75 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2179  flagellar motor switch protein FliN  48.75 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000312484  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1608  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein FliN  46.51 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429927  normal  0.0945773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>