272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_31080 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_31080  flagellar motor switch protein FliN  100 
 
 
247 aa  466  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.713514  normal  0.558701 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2013  flagellar motor switch protein FliN  41 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2978  flagellar motor switch protein FliN  45.53 
 
 
238 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563329 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1664  flagellar motor switch protein FliN  42.5 
 
 
249 aa  125  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0745  flagellar motor switch protein FliN  46.7 
 
 
246 aa  123  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.898519  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0964  flagellar motor switch protein FliN  43.43 
 
 
249 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2333  flagellar motor switch protein FliN  69.86 
 
 
250 aa  105  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0940353  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  48.94 
 
 
346 aa  103  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  48.94 
 
 
346 aa  103  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  52.04 
 
 
139 aa  102  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  49.45 
 
 
422 aa  102  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0855  flagellar motor switch protein FliN  54.17 
 
 
123 aa  101  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.172432  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  47.42 
 
 
357 aa  98.6  9e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  55.7 
 
 
417 aa  97.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1680  flagellar motor switch protein  50.6 
 
 
375 aa  97.4  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  46.6 
 
 
175 aa  95.9  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1938  flagellar motor switch protein FliN  53.33 
 
 
359 aa  95.1  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0114  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  57.14 
 
 
372 aa  94.7  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00175388  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1403  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  56.76 
 
 
381 aa  94.7  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  54.05 
 
 
393 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  50.57 
 
 
226 aa  94.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0862  CheC, inhibitor of MCP methylation  56.76 
 
 
398 aa  94  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  49.43 
 
 
370 aa  92.8  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0573  flagellar motor switch protein  42 
 
 
142 aa  92.4  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  49.43 
 
 
203 aa  92  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 
154 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2160  flagellar motor switch protein  50 
 
 
378 aa  91.3  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000995507  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  52.7 
 
 
401 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  41.12 
 
 
153 aa  90.9  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  48.31 
 
 
174 aa  91.7  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  46.15 
 
 
155 aa  90.5  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  46.46 
 
 
375 aa  90.9  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0151  flagellar motor switch protein FliN  56.76 
 
 
95 aa  89.4  5e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1872  flagellar motor switch protein FliN  48.94 
 
 
111 aa  89  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267191  normal  0.473896 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  47.19 
 
 
97 aa  89  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  39.78 
 
 
375 aa  88.6  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2164  surface presentation of antigens (SPOA) protein  47.44 
 
 
143 aa  88.2  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1431  Type III secretion system outer membrane O protein  54.05 
 
 
153 aa  88.6  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3883  flagellar motor switch protein  43.88 
 
 
157 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.444092  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2814  flagellar motor switch protein  42.42 
 
 
155 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535531  normal  0.0823858 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  41.82 
 
 
161 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0040  flagellar motor switch protein FliN  41.82 
 
 
163 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  46.07 
 
 
97 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  46.07 
 
 
97 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2038  flagellar motor switch protein  45.1 
 
 
402 aa  87.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0278595  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45790  flagellar motor switch protein  47.5 
 
 
157 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2702  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  38.95 
 
 
401 aa  86.7  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0537803  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0283  flagellar switch protein FliY  50 
 
 
113 aa  86.7  3e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0055  flagellar motor switch protein FliN  51.81 
 
 
130 aa  86.3  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3223  Type III secretion system outer membrane O protein  41.82 
 
 
163 aa  86.3  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3436  flagellar motor switch protein FliN  46.91 
 
 
153 aa  86.3  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0478  flagellar motor switch protein  44.21 
 
 
406 aa  86.3  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000894996  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4387  flagellar motor switch protein FliN  44.83 
 
 
148 aa  85.9  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  40.17 
 
 
152 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2380  flagellar motor switch protein  48.65 
 
 
411 aa  85.9  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  40.17 
 
 
152 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06193  flagellar protein  51.28 
 
 
112 aa  85.9  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0058  flagellar motor switch protein FliN  41.82 
 
 
162 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00973  flagellar protein  51.28 
 
 
112 aa  85.9  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0380826  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0031  flagellar motor switch FliN  41.82 
 
 
162 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0039  flagellar motor switch protein FliN  41.82 
 
 
162 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  41.41 
 
 
166 aa  85.5  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0042  flagellar motor switch protein FliN  40.91 
 
 
159 aa  85.5  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  48.05 
 
 
127 aa  85.5  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  44.3 
 
 
156 aa  85.1  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3220  flagellar motor switch protein  48.05 
 
 
124 aa  85.1  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  48.05 
 
 
124 aa  85.5  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  48.05 
 
 
124 aa  85.5  8e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  48.05 
 
 
124 aa  85.1  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  46.25 
 
 
161 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  48.05 
 
 
126 aa  85.1  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1374  flagellar motor switch protein  47.44 
 
 
127 aa  85.1  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  46.25 
 
 
154 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0558  flagellar motor switch FliN  43.16 
 
 
139 aa  85.1  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139719  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  48.05 
 
 
126 aa  85.1  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  48.05 
 
 
126 aa  85.1  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  48.05 
 
 
126 aa  85.1  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4755  flagellar motor switch protein FliN  42.86 
 
 
150 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.853225 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3678  flagellar motor switch protein FliN  42.86 
 
 
150 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  46.25 
 
 
152 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1369  flagellar motor switch protein  48.65 
 
 
126 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3058  flagellar motor switch protein  48.65 
 
 
127 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.173815  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  45.35 
 
 
135 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  46.25 
 
 
154 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1626  flagellar motor switch protein  48.65 
 
 
129 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  48.65 
 
 
124 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1121  flagellar motor switch protein FliN  44.05 
 
 
163 aa  84.3  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.5679 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2762  flagellar motor switch protein FliY  48.72 
 
 
393 aa  84.3  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02879  flagellar motor switch protein  47.95 
 
 
135 aa  84.3  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1334  flagellar motor switch protein  48.65 
 
 
127 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  46.25 
 
 
154 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1190  flagellar motor switch protein  48.65 
 
 
127 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0646  flagellar motor switch protein FliN  44.3 
 
 
143 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3073  flagellar motor switch protein FliN  44.87 
 
 
149 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154609  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3799  flagellar motor switch protein FliN  44.87 
 
 
149 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  38.38 
 
 
147 aa  83.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5883  Type III secretion system outer membrane O protein  43.04 
 
 
142 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.6073  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5299  flagellar motor switch FliN  39.58 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.934631  normal  0.10372 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1168  putative flagellar motor switch protein FliN  41.24 
 
 
103 aa  82.8  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1353  surface presentation of antigens (SPOA) protein  36.61 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>