49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0109 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0109  surface presentation of antigens (SPOA) protein  100 
 
 		 354 aa  707    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01727  type III secretion system protein  30.56 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003363  type III secretion inner membrane protein YscQ  31.06 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0578  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  37.27 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.194369  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3201  surface presentation of antigens protein SpaO  37.33 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3013  surface presentation of antigens protein SpaO  37.33 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3096  surface presentation of antigens protein SpaO  37.33 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.614249  hitchhiker  0.00000334679 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3081  surface presentation of antigens protein SpaO  37.33 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.892748 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2080  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  34.51 
 
 		 323 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.355086  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2168  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  34.51 
 
 		 323 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.712652  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3019  surface presentation of antigens protein SpaO  25.93 
 
 		 315 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000335444  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0845  surface presentation of antigens protein SpaO  25.93 
 
 		 315 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.176147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3185  type III secretion apparatus protein EpaO2  29.2 
 
 		 190 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3044  surface presentation of antigens protein SpaO  36 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.118327 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0835  type III secretion system protein BsaV  33.94 
 
 		 320 aa  53.9  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0264948  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0186  Spa33  29.79 
 
 		 293 aa  51.6  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1537  type III secretion system protein BsaV  32.48 
 
 		 327 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.402706  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0747  type III secretion system protein BsaV  39.51 
 
 		 335 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2067  type III secretion system protein BsaV  39.51 
 
 		 335 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0878838  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03405  type III secretion apparatus protein, YscQ/HrcQ family  25.43 
 
 		 273 aa  47.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  34.29 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0805  flagellar motor switch protein  30 
 
 		 395 aa  47.8  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0443911 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4570  flagellar motor switch protein FliN  26.67 
 
 		 115 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4089  flagellar motor switch protein FliN  26.67 
 
 		 115 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00242044  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4457  flagellar motor switch protein FliN  26.67 
 
 		 115 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  32.84 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  30.34 
 
 		 137 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3930  type III secretion system protein  27.18 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2179  flagellar motor switch protein FliN  30.34 
 
 		 137 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000312484  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  30.34 
 
 		 137 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1238  flagellar motor switch protein FliN  30.34 
 
 		 137 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  30.34 
 
 		 137 aa  45.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  30.34 
 
 		 137 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0450  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  28.11 
 
 		 352 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.180414  normal  0.188335 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1702  flagellar motor switch protein FliN  30.23 
 
 		 137 aa  44.3  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000907552  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42610  type III secretion system protein  33.72 
 
 		 309 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0248  flagellar motor switch protein FliN  32.91 
 
 		 215 aa  43.5  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00193923  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.56 
 
 		 346 aa  43.5  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  30.56 
 
 		 346 aa  43.5  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0784  flagellar motor switch FliN  30.67 
 
 		 124 aa  43.1  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0020352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2193  flagellar motor switch protein FliN  29.21 
 
 		 137 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1999  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  32.71 
 
 		 359 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2135  flagellar motor switch protein FliN  29.21 
 
 		 137 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.120788 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1142  flagellar motor switch protein FliN  29.21 
 
 		 137 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0539046  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1265  flagellar motor switch protein FliN  29.21 
 
 		 137 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2140  flagellar motor switch protein FliN  29.21 
 
 		 137 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280572 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0174  flagellar motor switch protein FliN  28.79 
 
 		 149 aa  42.7  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3843  flagellar motor switch protein  28.77 
 
 		 116 aa  42.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0103448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2537  flagellar motor switch protein FliN  29.21 
 
 		 137 aa  42.7  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.964599 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>