162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01727 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01727  type III secretion system protein  100 
 
 		 322 aa  654    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003363  type III secretion inner membrane protein YscQ  68.63 
 
 		 322 aa  461  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0044  type III secretion system protein  30.06 
 
 		 307 aa  112  9e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42610  type III secretion system protein  31.25 
 
 		 309 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2985  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  28.48 
 
 		 475 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0741  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  26.11 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.1614  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0740  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  25.48 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0705  surface presentation of antigens (SPOA) protein  26.11 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148267  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5929  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  29.21 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0597281 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0109  surface presentation of antigens (SPOA) protein  30.56 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3755  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  24.26 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00143257 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0747  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  25.61 
 
 		 334 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.12595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4736  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  26.19 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal  0.482732 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4214  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  26.79 
 
 		 381 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  34.33 
 
 		 417 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0855  flagellar motor switch protein FliN  33.78 
 
 		 123 aa  54.7  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.172432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3983  surface presentation of antigens (SPOA) protein  33.82 
 
 		 118 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0174  flagellar motor switch protein FliN  35.82 
 
 		 149 aa  54.3  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3480  flagellar motor switch protein FliN  33.82 
 
 		 124 aa  53.9  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5445  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  27.81 
 
 		 384 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322534  normal  0.0784231 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  34.21 
 
 		 375 aa  53.5  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3527  Type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  27.81 
 
 		 384 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.20838  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4839  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  27.81 
 
 		 384 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0073947  decreased coverage  0.0012825 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0088  flagellar motor switch protein FliN  25 
 
 		 118 aa  53.9  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  34.33 
 
 		 422 aa  53.9  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4649  flagellar motor switch protein FliN  35.29 
 
 		 113 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.519755  normal  0.588244 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0835  type III secretion system protein BsaV  25.77 
 
 		 320 aa  52.8  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0264948  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0082  flagellar motor switch protein FliN  32.35 
 
 		 118 aa  52.8  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  34.85 
 
 		 346 aa  51.2  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0845  surface presentation of antigens protein SpaO  19.15 
 
 		 315 aa  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.176147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3019  surface presentation of antigens protein SpaO  19.15 
 
 		 315 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000335444  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.85 
 
 		 346 aa  50.8  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0745  flagellar motor switch protein FliN  32.31 
 
 		 246 aa  50.4  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.898519  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2438  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  34.29 
 
 		 409 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3185  type III secretion apparatus protein EpaO2  18.42 
 
 		 190 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3096  surface presentation of antigens protein SpaO  25.32 
 
 		 303 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.614249  hitchhiker  0.00000334679 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3013  surface presentation of antigens protein SpaO  25.32 
 
 		 303 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3201  surface presentation of antigens protein SpaO  25.32 
 
 		 303 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3081  surface presentation of antigens protein SpaO  25 
 
 		 303 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.892748 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0578  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  24.07 
 
 		 319 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.194369  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03405  type III secretion apparatus protein, YscQ/HrcQ family  26.09 
 
 		 273 aa  49.7  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5860  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  26.01 
 
 		 326 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1999  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  22.22 
 
 		 359 aa  49.7  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0305  flagellar motor switch protein FliN  34.69 
 
 		 121 aa  49.7  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0964  flagellar motor switch protein FliN  30.43 
 
 		 249 aa  49.3  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0429  SctQ  22.22 
 
 		 435 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193635  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2168  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  23.49 
 
 		 323 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.712652  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2080  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  23.49 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.355086  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.78 
 
 		 375 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0168  flagellar motor switch protein FliN  29.85 
 
 		 115 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  29.58 
 
 		 135 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3044  surface presentation of antigens protein SpaO  25.77 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.118327 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0246  lateral flagellar export/assembly protein LfiN  31.08 
 
 		 123 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0217  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein  29.85 
 
 		 115 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1907  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  22.73 
 
 		 359 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0878707  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.85 
 
 		 370 aa  48.1  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  28.79 
 
 		 97 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3386  surface presentation of antigens (SPOA) protein  31.08 
 
 		 123 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  28.79 
 
 		 97 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1658  flagellar motor switch protein FliN  22.39 
 
 		 194 aa  47.8  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  28.79 
 
 		 97 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2702  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  29.85 
 
 		 401 aa  47.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0537803  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0114  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  32.91 
 
 		 372 aa  47.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00175388  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0055  flagellar motor switch protein FliN  31.76 
 
 		 130 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0045  surface presentation of antigens (SPOA) protein  27.84 
 
 		 133 aa  47  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2333  flagellar motor switch protein FliN  32.31 
 
 		 250 aa  46.6  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0940353  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0767  flagellar motor switch protein FliN  32.86 
 
 		 293 aa  47  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1537  type III secretion system protein BsaV  23.53 
 
 		 327 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.402706  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  29.58 
 
 		 175 aa  46.6  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  29.58 
 
 		 155 aa  46.6  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1938  flagellar motor switch protein FliN  32.84 
 
 		 359 aa  46.2  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2067  type III secretion system protein BsaV  30.21 
 
 		 335 aa  46.2  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0878838  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0747  type III secretion system protein BsaV  30.21 
 
 		 335 aa  46.2  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1664  flagellar motor switch protein FliN  29.23 
 
 		 249 aa  46.2  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  28.17 
 
 		 147 aa  46.2  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  29.85 
 
 		 174 aa  46.2  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2814  flagellar motor switch protein  29.58 
 
 		 155 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535531  normal  0.0823858 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00973  flagellar protein  28.26 
 
 		 112 aa  46.2  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0380826  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06193  flagellar protein  28.26 
 
 		 112 aa  46.2  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2164  surface presentation of antigens (SPOA) protein  28.17 
 
 		 143 aa  45.8  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5213  surface presentation of antigens (SPOA) protein  23.35 
 
 		 327 aa  45.8  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.200341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3663  surface presentation of antigens (SPOA) protein  29.41 
 
 		 122 aa  45.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  28.17 
 
 		 226 aa  45.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4176  flagellar motor switch protein FliN  31.34 
 
 		 155 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  29.85 
 
 		 190 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5643  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  24.42 
 
 		 374 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.82857  normal  0.117856 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  31.34 
 
 		 188 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0707  flagellar motor switch protein FliN  31.34 
 
 		 137 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00348203  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  27.78 
 
 		 152 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1626  flagellar motor switch protein  27.37 
 
 		 129 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2928  flagellar motor switch FliN  29.85 
 
 		 111 aa  45.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  25.35 
 
 		 124 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  25.35 
 
 		 124 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  25.35 
 
 		 124 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0478  flagellar motor switch protein  29.85 
 
 		 406 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000894996  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  25.35 
 
 		 126 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  25.35 
 
 		 126 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  25.35 
 
 		 126 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  30 
 
 		 401 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  25.35 
 
 		 126 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>