282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0305 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0305  flagellar motor switch protein FliN  100 
 
 
121 aa  241  3e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0248  flagellar motor switch protein FliN  64.94 
 
 
215 aa  106  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00193923  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0114  putative flagellar motor switch protein FliN  51.89 
 
 
115 aa  106  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0343  flagellar motor switch protein FliN  50.98 
 
 
194 aa  104  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24486  normal  0.0165317 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0724  flagellar motor switch protein FliN  64.38 
 
 
220 aa  104  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0123  flagellar motor switch protein FliN, putative  50.94 
 
 
106 aa  103  7e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0311  flagellar motor switch protein FliN  59.49 
 
 
195 aa  103  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4220  flagellar motor switch protein FliN  50.5 
 
 
115 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278556  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1151  flagellar motor switch protein fliY  55.56 
 
 
139 aa  98.2  3e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0618  flagellar motor switch protein FliN  56.98 
 
 
108 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.662589 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0650  flagellar motor switch protein FliN  59.26 
 
 
108 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0639  flagellar motor switch protein FliN  59.26 
 
 
108 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.26439  normal  0.185523 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3215  flagellar motor switch protein FliN  66.2 
 
 
125 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1714  flagellar motor switch protein FliN  59.49 
 
 
130 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal  0.04146 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2806  flagellar motor switch protein FliN  63.38 
 
 
109 aa  95.9  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0020  flagellar motor switch protein FliN  61.64 
 
 
110 aa  94.4  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1091  surface presentation of antigens (SPOA) protein  55 
 
 
131 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.553841 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0114  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  43.9 
 
 
372 aa  81.6  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00175388  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  46.58 
 
 
188 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1168  putative flagellar motor switch protein FliN  45.95 
 
 
103 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0542  flagellar motor switch protein  48.61 
 
 
115 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20621  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1275  flagellar motor switch protein  44.68 
 
 
116 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665997  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  47.95 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3461  flagellar motor switch protein FliN  51.39 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.5644  normal  0.0306476 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  42.05 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  43.59 
 
 
136 aa  74.7  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  39.81 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1473  flagellar motor switch protein FliN  45.35 
 
 
132 aa  74.3  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  46.58 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  46.58 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1970  flagellar motor switch FliN  42.86 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  45.45 
 
 
370 aa  73.9  0.0000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  42.22 
 
 
124 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1755  flagellar motor switch protein FliN  38.3 
 
 
111 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  37.61 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1431  Type III secretion system outer membrane O protein  43.06 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  44.32 
 
 
97 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3843  flagellar motor switch protein  43.62 
 
 
116 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0103448  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5299  flagellar motor switch FliN  43.18 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.934631  normal  0.10372 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2583  flagellar motor switch protein FliN  45.21 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1883  flagellar motor switch protein FliN  45.21 
 
 
137 aa  73.6  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1702  flagellar motor switch protein FliN  45.21 
 
 
137 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000907552  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  44.32 
 
 
97 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2537  flagellar motor switch protein FliN  45.21 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.964599 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2181  flagellar motor switch protein FliN  43.68 
 
 
117 aa  72.8  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.475911  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2814  flagellar motor switch protein  36.46 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535531  normal  0.0823858 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2179  flagellar motor switch protein FliN  45.21 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000312484  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  45.21 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1755  flagellar motor switch protein FliN  42.17 
 
 
109 aa  72.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  35.42 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  40.24 
 
 
154 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  45.21 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  41.76 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  45.21 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  44.32 
 
 
97 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2135  flagellar motor switch protein FliN  45.21 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.120788 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1334  flagellar motor switch protein  37.04 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  41.1 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1265  flagellar motor switch protein FliN  45.21 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  40.23 
 
 
401 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1238  flagellar motor switch protein FliN  45.21 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  42.22 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  42.22 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1190  flagellar motor switch protein  39.81 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0683  flagellar motor switch protein  47.22 
 
 
118 aa  72  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.455198  normal  0.747466 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1142  flagellar motor switch protein FliN  45.21 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0539046  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  45.21 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  36.7 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2140  flagellar motor switch protein FliN  45.21 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280572 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2193  flagellar motor switch protein FliN  45.21 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  40.24 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3058  flagellar motor switch protein  37.96 
 
 
127 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.173815  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3220  flagellar motor switch protein  38.46 
 
 
124 aa  72  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  43.59 
 
 
346 aa  72  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  40.24 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  43.59 
 
 
346 aa  71.6  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1015  flagellar motor switch protein  45.83 
 
 
111 aa  72  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491923  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  41.11 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  40.24 
 
 
154 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  41.77 
 
 
174 aa  72  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  44.16 
 
 
357 aa  71.6  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  39.02 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3436  flagellar motor switch protein FliN  46.58 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  43.84 
 
 
226 aa  71.2  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  39.02 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  43.84 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  42.5 
 
 
375 aa  70.9  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5056  flagellar motor switch protein FliN  45.83 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.423676  normal  0.789491 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0944  flagellar motor switch protein  45.57 
 
 
116 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342827  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0688  flagellar motor switch protein  46.84 
 
 
116 aa  71.2  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0528144  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1460  flagellar motor switch protein  45.57 
 
 
115 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.775368  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  36.11 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0596  flagellar motor switch protein  46.84 
 
 
116 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  36.11 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  43.84 
 
 
190 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  36.11 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  36.11 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  42.47 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1608  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein FliN  46.15 
 
 
132 aa  70.1  0.000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429927  normal  0.0945773 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1369  flagellar motor switch protein  42.05 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>