283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0123 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0123  flagellar motor switch protein FliN, putative  100 
 
 
106 aa  208  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0114  putative flagellar motor switch protein FliN  98.11 
 
 
115 aa  202  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4220  flagellar motor switch protein FliN  92.45 
 
 
115 aa  192  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278556  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1151  flagellar motor switch protein fliY  78.48 
 
 
139 aa  128  3e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2806  flagellar motor switch protein FliN  68.97 
 
 
109 aa  119  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1714  flagellar motor switch protein FliN  60.19 
 
 
130 aa  118  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal  0.04146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3215  flagellar motor switch protein FliN  62.92 
 
 
125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0020  flagellar motor switch protein FliN  61.54 
 
 
110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1091  surface presentation of antigens (SPOA) protein  60.23 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.553841 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0618  flagellar motor switch protein FliN  66.67 
 
 
108 aa  110  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.662589 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0650  flagellar motor switch protein FliN  66.67 
 
 
108 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0639  flagellar motor switch protein FliN  66.67 
 
 
108 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.26439  normal  0.185523 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0724  flagellar motor switch protein FliN  62.07 
 
 
220 aa  107  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0305  flagellar motor switch protein FliN  50.94 
 
 
121 aa  103  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0248  flagellar motor switch protein FliN  64.56 
 
 
215 aa  100  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00193923  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0343  flagellar motor switch protein FliN  57.14 
 
 
194 aa  100  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24486  normal  0.0165317 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0311  flagellar motor switch protein FliN  58.54 
 
 
195 aa  98.6  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2181  flagellar motor switch protein FliN  45.74 
 
 
117 aa  84  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.475911  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0542  flagellar motor switch protein  48.89 
 
 
115 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20621  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1473  flagellar motor switch protein FliN  51.85 
 
 
132 aa  82.4  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3461  flagellar motor switch protein FliN  51.32 
 
 
125 aa  80.9  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.5644  normal  0.0306476 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4457  flagellar motor switch protein FliN  40.95 
 
 
115 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4089  flagellar motor switch protein FliN  40.95 
 
 
115 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00242044  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  41.67 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  42.22 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4570  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 
115 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  41.11 
 
 
170 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3843  flagellar motor switch protein  46.43 
 
 
116 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0103448  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1275  flagellar motor switch protein  46.43 
 
 
116 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665997  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5123  flagellar motor switch protein FliN  45.16 
 
 
116 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 
180 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  45.56 
 
 
175 aa  77  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1755  flagellar motor switch protein FliN  37.74 
 
 
111 aa  77  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  44.44 
 
 
97 aa  77  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1755  flagellar motor switch protein FliN  39.62 
 
 
109 aa  76.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0596  flagellar motor switch protein  45.24 
 
 
116 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0862  CheC, inhibitor of MCP methylation  47.5 
 
 
398 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  43.33 
 
 
97 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6060  flagellar motor switch protein FliN  42.11 
 
 
116 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.378141  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  41.57 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  36.84 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  43.33 
 
 
97 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0688  flagellar motor switch protein  45.24 
 
 
116 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0528144  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  44.3 
 
 
190 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  43.62 
 
 
422 aa  75.9  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1460  flagellar motor switch protein  46.43 
 
 
115 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.775368  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1680  flagellar motor switch protein  40.86 
 
 
375 aa  75.5  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  48.68 
 
 
357 aa  75.1  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0683  flagellar motor switch protein  42.11 
 
 
118 aa  75.1  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.455198  normal  0.747466 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  42.31 
 
 
154 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  38.54 
 
 
154 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1873  flagellar motor switch protein  44.19 
 
 
115 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507856  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0944  flagellar motor switch protein  45.24 
 
 
116 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342827  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5056  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 
110 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.423676  normal  0.789491 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  38.54 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  39.18 
 
 
152 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  38.54 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3438  flagellar motor switch protein FliN  40.66 
 
 
99 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2038  flagellar motor switch protein  48.1 
 
 
402 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0278595  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  43.04 
 
 
226 aa  73.6  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  42.68 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2814  flagellar motor switch protein  42.68 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535531  normal  0.0823858 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  41.57 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  43.59 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  42.55 
 
 
346 aa  72.8  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1353  surface presentation of antigens (SPOA) protein  41.11 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  42.55 
 
 
346 aa  72.8  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  44.94 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1702  flagellar motor switch protein FliN  38.53 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000907552  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2179  flagellar motor switch protein FliN  38.53 
 
 
137 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000312484  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  38.53 
 
 
137 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  43.9 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3883  flagellar motor switch protein  43.59 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.444092  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  37.39 
 
 
137 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2908  flagellar motor switch protein FliN  40.43 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4755  flagellar motor switch protein FliN  41.76 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.853225 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1238  flagellar motor switch protein FliN  38.53 
 
 
137 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  37.39 
 
 
137 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45790  flagellar motor switch protein  43.59 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3678  flagellar motor switch protein FliN  41.76 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  38.71 
 
 
124 aa  72  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  41.03 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  47.3 
 
 
370 aa  72  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  37.39 
 
 
137 aa  72  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0478  flagellar motor switch protein  46.34 
 
 
406 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000894996  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1142  flagellar motor switch protein FliN  45.12 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0539046  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2686  flagellar motor switch protein FliN  43.53 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0030  flagellar motor switch protein FliN  43.53 
 
 
165 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0030  flagellar motor switch protein FliN  43.53 
 
 
165 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2763  flagellar motor switch protein FliN  43.33 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  46.05 
 
 
147 aa  72  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  43.33 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2135  flagellar motor switch protein FliN  45.12 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.120788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2140  flagellar motor switch protein FliN  45.12 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280572 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2380  flagellar motor switch protein  40.91 
 
 
411 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3039  flagellar motor switch protein  39.18 
 
 
131 aa  72  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4387  flagellar motor switch protein FliN  37.08 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2193  flagellar motor switch protein FliN  45.12 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3496  flagellar motor switch protein FliN  43.53 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1866  flagellar motor switch protein FliN  43.53 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>