257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0248 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0248  flagellar motor switch protein FliN  100 
 
 		 215 aa  420  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00193923  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0343  flagellar motor switch protein FliN  50.76 
 
 		 194 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24486  normal  0.0165317 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0724  flagellar motor switch protein FliN  51.07 
 
 		 220 aa  158  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0311  flagellar motor switch protein FliN  52.02 
 
 		 195 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0305  flagellar motor switch protein FliN  64.94 
 
 		 121 aa  106  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0114  putative flagellar motor switch protein FliN  55 
 
 		 115 aa  101  7e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0123  flagellar motor switch protein FliN, putative  64.56 
 
 		 106 aa  100  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3215  flagellar motor switch protein FliN  55.43 
 
 		 125 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4220  flagellar motor switch protein FliN  60.76 
 
 		 115 aa  97.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278556  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1151  flagellar motor switch protein fliY  53.85 
 
 		 139 aa  97.1  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0020  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 110 aa  95.1  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0650  flagellar motor switch protein FliN  51.58 
 
 		 108 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0639  flagellar motor switch protein FliN  51.58 
 
 		 108 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.26439  normal  0.185523 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0618  flagellar motor switch protein FliN  52.75 
 
 		 108 aa  94  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.662589 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2806  flagellar motor switch protein FliN  56.25 
 
 		 109 aa  94  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1714  flagellar motor switch protein FliN  54.88 
 
 		 130 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal  0.04146 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1091  surface presentation of antigens (SPOA) protein  50 
 
 		 131 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.553841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  31.94 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  37.74 
 
 		 180 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  32.64 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  38.46 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  38.71 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  40.86 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0542  flagellar motor switch protein  37.5 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20621  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  37.63 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  32.41 
 
 		 154 aa  74.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  38.71 
 
 		 170 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1473  flagellar motor switch protein FliN  45.68 
 
 		 132 aa  74.3  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  33.87 
 
 		 152 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  34.95 
 
 		 152 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3461  flagellar motor switch protein FliN  42.2 
 
 		 125 aa  73.9  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.5644  normal  0.0306476 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3436  flagellar motor switch protein FliN  38.1 
 
 		 153 aa  73.9  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0862  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.71 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  36.26 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  34.07 
 
 		 422 aa  73.2  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1702  flagellar motor switch protein FliN  40.74 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000907552  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  40.74 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  40.74 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  40.74 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1238  flagellar motor switch protein FliN  40.74 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2537  flagellar motor switch protein FliN  40.74 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.964599 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  40.74 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2179  flagellar motor switch protein FliN  40.74 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000312484  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  36.26 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1142  flagellar motor switch protein FliN  40.74 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0539046  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1265  flagellar motor switch protein FliN  40.74 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0805  flagellar motor switch protein  41.03 
 
 		 395 aa  72.4  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0443911 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2140  flagellar motor switch protein FliN  40.74 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280572 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2193  flagellar motor switch protein FliN  40.74 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2135  flagellar motor switch protein FliN  40.74 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.120788 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  35.79 
 
 		 152 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  37.11 
 
 		 375 aa  72  0.000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0683  flagellar motor switch protein  43.59 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.455198  normal  0.747466 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1431  Type III secretion system outer membrane O protein  29.37 
 
 		 153 aa  71.2  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  35.63 
 
 		 166 aa  71.2  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0573  flagellar motor switch protein  35.29 
 
 		 142 aa  71.2  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6060  flagellar motor switch protein FliN  40.91 
 
 		 116 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.378141  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  30.13 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5123  flagellar motor switch protein FliN  42.05 
 
 		 116 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  41.18 
 
 		 97 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4457  flagellar motor switch protein FliN  42.31 
 
 		 115 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45790  flagellar motor switch protein  37.89 
 
 		 157 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5056  flagellar motor switch protein FliN  38.61 
 
 		 110 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.423676  normal  0.789491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4089  flagellar motor switch protein FliN  42.31 
 
 		 115 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00242044  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  36.56 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  36.84 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  37.8 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0596  flagellar motor switch protein  35.87 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2181  flagellar motor switch protein FliN  39.74 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.475911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  41.03 
 
 		 346 aa  70.1  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1275  flagellar motor switch protein  38.14 
 
 		 116 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665997  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3883  flagellar motor switch protein  37.89 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.444092  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  38.16 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1873  flagellar motor switch protein  37.36 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  36.59 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1680  flagellar motor switch protein  38.04 
 
 		 375 aa  70.1  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  41.03 
 
 		 346 aa  69.3  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3843  flagellar motor switch protein  38.37 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0103448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1460  flagellar motor switch protein  39.51 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.775368  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1883  flagellar motor switch protein FliN  37.5 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3058  flagellar motor switch protein  33.33 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.173815  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0944  flagellar motor switch protein  37.21 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4570  flagellar motor switch protein FliN  41.03 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2583  flagellar motor switch protein FliN  37.5 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  37.04 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  33.33 
 
 		 401 aa  68.2  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  35.29 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  36.84 
 
 		 357 aa  68.6  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0114  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  34.15 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00175388  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2164  surface presentation of antigens (SPOA) protein  36.84 
 
 		 143 aa  67.4  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  35.53 
 
 		 139 aa  68.2  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0688  flagellar motor switch protein  36.05 
 
 		 116 aa  68.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0528144  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3039  flagellar motor switch protein  33.33 
 
 		 131 aa  68.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1015  flagellar motor switch protein  41.67 
 
 		 111 aa  67.8  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2814  flagellar motor switch protein  36.84 
 
 		 155 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535531  normal  0.0823858 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1872  flagellar motor switch protein FliN  34.69 
 
 		 111 aa  67.8  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267191  normal  0.473896 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1374  flagellar motor switch protein  35.79 
 
 		 127 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  38.46 
 
 		 124 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>