More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4570 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4570  flagellar motor switch protein FliN  100 
 
 
115 aa  226  6e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4457  flagellar motor switch protein FliN  99.13 
 
 
115 aa  225  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4089  flagellar motor switch protein FliN  99.13 
 
 
115 aa  225  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00242044  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6060  flagellar motor switch protein FliN  81.98 
 
 
116 aa  179  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.378141  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5123  flagellar motor switch protein FliN  81.08 
 
 
116 aa  178  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5056  flagellar motor switch protein FliN  80.36 
 
 
110 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.423676  normal  0.789491 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1873  flagellar motor switch protein  65.22 
 
 
115 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507856  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0542  flagellar motor switch protein  61.54 
 
 
115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20621  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0944  flagellar motor switch protein  68.52 
 
 
116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342827  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3843  flagellar motor switch protein  65.45 
 
 
116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0103448  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1275  flagellar motor switch protein  65.45 
 
 
116 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665997  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1460  flagellar motor switch protein  69.16 
 
 
115 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.775368  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0596  flagellar motor switch protein  64.1 
 
 
116 aa  128  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0688  flagellar motor switch protein  63.25 
 
 
116 aa  127  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0528144  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1015  flagellar motor switch protein  63.21 
 
 
111 aa  120  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491923  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2181  flagellar motor switch protein FliN  60 
 
 
117 aa  120  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.475911  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1473  flagellar motor switch protein FliN  58.82 
 
 
132 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0683  flagellar motor switch protein  71.25 
 
 
118 aa  113  7.999999999999999e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.455198  normal  0.747466 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3461  flagellar motor switch protein FliN  56.38 
 
 
125 aa  104  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.5644  normal  0.0306476 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2806  flagellar motor switch protein FliN  46 
 
 
109 aa  85.1  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  44.05 
 
 
393 aa  83.6  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3215  flagellar motor switch protein FliN  50.65 
 
 
125 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1168  putative flagellar motor switch protein FliN  41.67 
 
 
103 aa  82.8  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  51.35 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0650  flagellar motor switch protein FliN  45.45 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  47.95 
 
 
357 aa  82  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0639  flagellar motor switch protein FliN  45.45 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.26439  normal  0.185523 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0020  flagellar motor switch protein FliN  46.15 
 
 
110 aa  82.4  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0618  flagellar motor switch protein FliN  48.05 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.662589 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  48.65 
 
 
154 aa  81.3  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  45.78 
 
 
170 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  48.19 
 
 
97 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1091  surface presentation of antigens (SPOA) protein  49.35 
 
 
131 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.553841 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  48.19 
 
 
97 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0123  flagellar motor switch protein FliN, putative  40 
 
 
106 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  45.12 
 
 
190 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  44.87 
 
 
375 aa  79  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  47.56 
 
 
175 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0114  putative flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 
115 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1714  flagellar motor switch protein FliN  46.75 
 
 
130 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal  0.04146 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  48.19 
 
 
97 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3292  flagellar motor switch protein FliN  42.86 
 
 
99 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02879  flagellar motor switch protein  41.67 
 
 
135 aa  77.8  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4220  flagellar motor switch protein FliN  39.32 
 
 
115 aa  77.8  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278556  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  47.3 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  53.42 
 
 
360 aa  77.4  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  42.86 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  42.86 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  42.86 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  43.9 
 
 
124 aa  77  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  47.95 
 
 
346 aa  77  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  42.86 
 
 
127 aa  77  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  47.95 
 
 
346 aa  76.6  0.00000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5883  Type III secretion system outer membrane O protein  41.57 
 
 
142 aa  76.6  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.6073  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06193  flagellar protein  45.68 
 
 
112 aa  76.6  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00973  flagellar protein  45.68 
 
 
112 aa  76.6  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0380826  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  45.33 
 
 
422 aa  77  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1151  flagellar motor switch protein fliY  40.66 
 
 
139 aa  76.6  0.00000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  41.57 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3220  flagellar motor switch protein  42.86 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  45.33 
 
 
417 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  41.67 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1369  flagellar motor switch protein  43.37 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0028  flagellar motor switch protein FliN  34.78 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182038  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  45.16 
 
 
135 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1334  flagellar motor switch protein  41.67 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  41.67 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  41.67 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  43.16 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  41.67 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1403  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  40.19 
 
 
381 aa  76.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  44.59 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  39.64 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1510  flagellar motor switch protein  40.48 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.176164  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1872  flagellar motor switch protein FliN  45.33 
 
 
111 aa  75.9  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267191  normal  0.473896 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1866  flagellar motor switch protein FliN  34.78 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996713  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  34.78 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  42.86 
 
 
401 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3223  Type III secretion system outer membrane O protein  35.71 
 
 
163 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0058  flagellar motor switch protein FliN  35.71 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0030  flagellar motor switch protein FliN  34.78 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  39.64 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0031  flagellar motor switch FliN  35.71 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3039  flagellar motor switch protein  41.67 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0030  flagellar motor switch protein FliN  34.78 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1190  flagellar motor switch protein  41.67 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2686  flagellar motor switch protein FliN  34.78 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0039  flagellar motor switch protein FliN  35.71 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3496  flagellar motor switch protein FliN  34.78 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2380  flagellar motor switch protein  47.3 
 
 
411 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1680  flagellar motor switch protein  39.33 
 
 
375 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0558  flagellar motor switch FliN  40.82 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139719  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1374  flagellar motor switch protein  41.67 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0862  CheC, inhibitor of MCP methylation  45 
 
 
398 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0855  flagellar motor switch protein FliN  47.5 
 
 
123 aa  74.7  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.172432  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4387  flagellar motor switch protein FliN  41.58 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0724  flagellar motor switch protein FliN  42.22 
 
 
220 aa  74.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0040  flagellar motor switch protein FliN  35.71 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  48.65 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>