276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1091 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1091  surface presentation of antigens (SPOA) protein  100 
 
 		 131 aa  256  8e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.553841 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3215  flagellar motor switch protein FliN  66.99 
 
 		 125 aa  135  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2806  flagellar motor switch protein FliN  83.33 
 
 		 109 aa  135  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1714  flagellar motor switch protein FliN  82.05 
 
 		 130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal  0.04146 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0639  flagellar motor switch protein FliN  79.49 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.26439  normal  0.185523 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0020  flagellar motor switch protein FliN  84.62 
 
 		 110 aa  131  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0618  flagellar motor switch protein FliN  79.49 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.662589 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0650  flagellar motor switch protein FliN  79.49 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4220  flagellar motor switch protein FliN  70.51 
 
 		 115 aa  117  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278556  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0114  putative flagellar motor switch protein FliN  61.36 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0123  flagellar motor switch protein FliN, putative  60.23 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1151  flagellar motor switch protein fliY  56.67 
 
 		 139 aa  111  3e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0724  flagellar motor switch protein FliN  52.56 
 
 		 220 aa  95.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0305  flagellar motor switch protein FliN  55 
 
 		 121 aa  93.6  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0311  flagellar motor switch protein FliN  48.72 
 
 		 195 aa  90.5  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0343  flagellar motor switch protein FliN  47.44 
 
 		 194 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24486  normal  0.0165317 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0248  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 215 aa  87.8  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00193923  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3461  flagellar motor switch protein FliN  45.65 
 
 		 125 aa  85.1  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.5644  normal  0.0306476 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3843  flagellar motor switch protein  45.19 
 
 		 116 aa  84.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0103448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1275  flagellar motor switch protein  47.87 
 
 		 116 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665997  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5056  flagellar motor switch protein FliN  54.43 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.423676  normal  0.789491 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0542  flagellar motor switch protein  52.44 
 
 		 115 aa  84  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20621  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1460  flagellar motor switch protein  45.92 
 
 		 115 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.775368  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2181  flagellar motor switch protein FliN  47.67 
 
 		 117 aa  82.8  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.475911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4457  flagellar motor switch protein FliN  50.65 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4089  flagellar motor switch protein FliN  50.65 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00242044  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4570  flagellar motor switch protein FliN  49.35 
 
 		 115 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0944  flagellar motor switch protein  40.71 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0688  flagellar motor switch protein  41.35 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0528144  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1473  flagellar motor switch protein FliN  38.66 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6060  flagellar motor switch protein FliN  49.35 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.378141  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5123  flagellar motor switch protein FliN  50.65 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0596  flagellar motor switch protein  41.35 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1873  flagellar motor switch protein  41.9 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  40.91 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  46.15 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0683  flagellar motor switch protein  44.05 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.455198  normal  0.747466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1015  flagellar motor switch protein  41.86 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2537  flagellar motor switch protein FliN  35.16 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.964599 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1680  flagellar motor switch protein  46.75 
 
 		 375 aa  73.6  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3058  flagellar motor switch protein  38.38 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.173815  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1168  putative flagellar motor switch protein FliN  36.7 
 
 		 103 aa  72  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  36.45 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02879  flagellar motor switch protein  35.77 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1431  Type III secretion system outer membrane O protein  33.33 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  42.86 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  40.38 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  44.16 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5883  Type III secretion system outer membrane O protein  45.45 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.6073  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1872  flagellar motor switch protein FliN  38.89 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267191  normal  0.473896 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  40.4 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  44.16 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  41.25 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  41.25 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  41.25 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  44.16 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  41.25 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  46.05 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  41.25 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  41.25 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  41.25 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  44.16 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1374  flagellar motor switch protein  35.09 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1334  flagellar motor switch protein  41.25 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  41.56 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  46.05 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1755  flagellar motor switch protein FliN  48.68 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0558  flagellar motor switch FliN  41.77 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139719  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  41.25 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3220  flagellar motor switch protein  41.25 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  44.74 
 
 		 175 aa  70.1  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06193  flagellar protein  44.87 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00973  flagellar protein  44.87 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0380826  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  41.25 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  44.16 
 
 		 154 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  38.96 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  35.54 
 
 		 161 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2939  flagellar motor switch protein FliN  42.35 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  44.16 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  48.68 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4755  flagellar motor switch protein FliN  44.16 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.853225 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1755  flagellar motor switch protein FliN  48.68 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  32.81 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3883  flagellar motor switch protein  44.16 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.444092  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  48.68 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  48.68 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  39.76 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0157  flagellar motor switch protein FliN  42.35 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.491458 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  40.26 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  44.16 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0031  flagellar motor switch FliN  37.5 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3039  flagellar motor switch protein  41.56 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3778  flagellar motor switch protein FliN  42.35 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45790  flagellar motor switch protein  44.16 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0039  flagellar motor switch protein FliN  37.5 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  41.77 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3292  flagellar motor switch protein FliN  44.83 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  43.59 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  41.57 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1369  flagellar motor switch protein  39.51 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>