More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4089 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4089  flagellar motor switch protein FliN  100 
 
 		 115 aa  227  5e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00242044  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4457  flagellar motor switch protein FliN  100 
 
 		 115 aa  227  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4570  flagellar motor switch protein FliN  99.13 
 
 		 115 aa  225  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6060  flagellar motor switch protein FliN  82.88 
 
 		 116 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.378141  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5123  flagellar motor switch protein FliN  81.98 
 
 		 116 aa  179  8.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5056  flagellar motor switch protein FliN  81.25 
 
 		 110 aa  179  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.423676  normal  0.789491 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1873  flagellar motor switch protein  66.09 
 
 		 115 aa  137  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0944  flagellar motor switch protein  69.44 
 
 		 116 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0542  flagellar motor switch protein  60.68 
 
 		 115 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20621  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3843  flagellar motor switch protein  68.52 
 
 		 116 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0103448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1460  flagellar motor switch protein  70.09 
 
 		 115 aa  130  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.775368  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0596  flagellar motor switch protein  64.96 
 
 		 116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1275  flagellar motor switch protein  66.36 
 
 		 116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665997  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0688  flagellar motor switch protein  64.1 
 
 		 116 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0528144  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1015  flagellar motor switch protein  62.26 
 
 		 111 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2181  flagellar motor switch protein FliN  59.09 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.475911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1473  flagellar motor switch protein FliN  57.84 
 
 		 132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0683  flagellar motor switch protein  70 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.455198  normal  0.747466 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3461  flagellar motor switch protein FliN  55.32 
 
 		 125 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.5644  normal  0.0306476 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2806  flagellar motor switch protein FliN  47 
 
 		 109 aa  86.7  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3215  flagellar motor switch protein FliN  51.95 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0639  flagellar motor switch protein FliN  46.59 
 
 		 108 aa  84  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.26439  normal  0.185523 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0650  flagellar motor switch protein FliN  46.59 
 
 		 108 aa  84  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1168  putative flagellar motor switch protein FliN  41.67 
 
 		 103 aa  83.6  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0020  flagellar motor switch protein FliN  47.25 
 
 		 110 aa  83.6  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0618  flagellar motor switch protein FliN  49.35 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.662589 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  51.35 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  42.86 
 
 		 393 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0123  flagellar motor switch protein FliN, putative  40.95 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1091  surface presentation of antigens (SPOA) protein  50.65 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.553841 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0114  putative flagellar motor switch protein FliN  40.95 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 188 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  48.65 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1714  flagellar motor switch protein FliN  48.05 
 
 		 130 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal  0.04146 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  46.58 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  48.19 
 
 		 97 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  48.19 
 
 		 97 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4220  flagellar motor switch protein FliN  40.17 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278556  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  45.78 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  48.19 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  54.79 
 
 		 360 aa  78.6  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  47.56 
 
 		 175 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  45.12 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1151  flagellar motor switch protein fliY  41.76 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3292  flagellar motor switch protein FliN  42.86 
 
 		 99 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02879  flagellar motor switch protein  41.67 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  43.59 
 
 		 375 aa  77  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  47.3 
 
 		 180 aa  77  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  43.9 
 
 		 124 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  43.9 
 
 		 124 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  43.9 
 
 		 124 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  39.64 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5883  Type III secretion system outer membrane O protein  41.57 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.6073  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06193  flagellar protein  45.68 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  43.75 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  42.86 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00973  flagellar protein  45.68 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0380826  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  39.64 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  43.9 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  41.57 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3220  flagellar motor switch protein  42.86 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  34.78 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  45.33 
 
 		 417 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  42.68 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  42.68 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  42.68 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  42.68 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0028  flagellar motor switch protein FliN  34.78 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182038  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1334  flagellar motor switch protein  41.67 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1369  flagellar motor switch protein  43.37 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1872  flagellar motor switch protein FliN  45.33 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267191  normal  0.473896 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  44.59 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1510  flagellar motor switch protein  40.48 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.176164  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1866  flagellar motor switch protein FliN  34.78 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996713  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3223  Type III secretion system outer membrane O protein  35.71 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0058  flagellar motor switch protein FliN  35.71 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0031  flagellar motor switch FliN  35.71 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3039  flagellar motor switch protein  41.67 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2686  flagellar motor switch protein FliN  34.78 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0039  flagellar motor switch protein FliN  35.71 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3496  flagellar motor switch protein FliN  34.78 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1374  flagellar motor switch protein  41.67 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  46.58 
 
 		 346 aa  74.7  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  46.58 
 
 		 346 aa  74.7  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0030  flagellar motor switch protein FliN  34.78 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0558  flagellar motor switch FliN  40.82 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139719  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  44 
 
 		 422 aa  74.7  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  38.05 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  42.11 
 
 		 175 aa  74.7  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0030  flagellar motor switch protein FliN  34.78 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1190  flagellar motor switch protein  41.67 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1403  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  39.25 
 
 		 381 aa  74.3  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2380  flagellar motor switch protein  47.3 
 
 		 411 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0724  flagellar motor switch protein FliN  42.22 
 
 		 220 aa  74.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4387  flagellar motor switch protein FliN  41.58 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3058  flagellar motor switch protein  41.18 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.173815  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0040  flagellar motor switch protein FliN  35.71 
 
 		 163 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  35.71 
 
 		 161 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3567  flagellar motor switch protein FliN  38.24 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  41.67 
 
 		 401 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>