More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6060 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6060  flagellar motor switch protein FliN  100 
 
 		 116 aa  223  6e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.378141  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5123  flagellar motor switch protein FliN  92.24 
 
 		 116 aa  207  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4457  flagellar motor switch protein FliN  82.88 
 
 		 115 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4089  flagellar motor switch protein FliN  82.88 
 
 		 115 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00242044  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4570  flagellar motor switch protein FliN  81.98 
 
 		 115 aa  179  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5056  flagellar motor switch protein FliN  74.77 
 
 		 110 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.423676  normal  0.789491 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1873  flagellar motor switch protein  66.96 
 
 		 115 aa  134  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0944  flagellar motor switch protein  81.48 
 
 		 116 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1275  flagellar motor switch protein  66.99 
 
 		 116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665997  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1460  flagellar motor switch protein  67.96 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.775368  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0542  flagellar motor switch protein  66.02 
 
 		 115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20621  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3843  flagellar motor switch protein  77.11 
 
 		 116 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0103448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0596  flagellar motor switch protein  79.01 
 
 		 116 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0688  flagellar motor switch protein  63.72 
 
 		 116 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0528144  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1015  flagellar motor switch protein  63.81 
 
 		 111 aa  123  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2181  flagellar motor switch protein FliN  58.18 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.475911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0683  flagellar motor switch protein  57.02 
 
 		 118 aa  114  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.455198  normal  0.747466 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1473  flagellar motor switch protein FliN  64.77 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3461  flagellar motor switch protein FliN  58.23 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.5644  normal  0.0306476 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1168  putative flagellar motor switch protein FliN  46.34 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  43.14 
 
 		 154 aa  84  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  49.32 
 
 		 357 aa  82.4  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3215  flagellar motor switch protein FliN  50.65 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2806  flagellar motor switch protein FliN  43.69 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0020  flagellar motor switch protein FliN  48.24 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  42.35 
 
 		 393 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0639  flagellar motor switch protein FliN  48.05 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.26439  normal  0.185523 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0618  flagellar motor switch protein FliN  48.05 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.662589 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0650  flagellar motor switch protein FliN  48.05 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  45.12 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  51.22 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  47.56 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  51.22 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  45.12 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1714  flagellar motor switch protein FliN  46.25 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal  0.04146 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3220  flagellar motor switch protein  38.6 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  46.34 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  46.15 
 
 		 375 aa  79  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  52.44 
 
 		 360 aa  79  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  51.22 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1091  surface presentation of antigens (SPOA) protein  49.35 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.553841 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  39.32 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  39.32 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  39.32 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  45.12 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4220  flagellar motor switch protein FliN  43.02 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278556  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  40.43 
 
 		 166 aa  77  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06193  flagellar protein  42.55 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1403  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  43.53 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00973  flagellar protein  42.55 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0380826  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0123  flagellar motor switch protein FliN, putative  42.11 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  42.16 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0114  putative flagellar motor switch protein FliN  42.11 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  46.67 
 
 		 417 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  42.68 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1151  flagellar motor switch protein fliY  42.5 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1872  flagellar motor switch protein FliN  45.33 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267191  normal  0.473896 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1334  flagellar motor switch protein  41.46 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  42.67 
 
 		 422 aa  74.7  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  39.76 
 
 		 401 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  41.46 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  41.46 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  41.46 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  47.95 
 
 		 346 aa  74.3  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0558  flagellar motor switch FliN  41.67 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139719  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  41.46 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  47.95 
 
 		 346 aa  74.3  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0855  flagellar motor switch protein FliN  49.37 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.172432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1374  flagellar motor switch protein  39.81 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02879  flagellar motor switch protein  39.29 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1369  flagellar motor switch protein  42.35 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1510  flagellar motor switch protein  37.17 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.176164  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2380  flagellar motor switch protein  46.34 
 
 		 411 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0573  flagellar motor switch protein  38.24 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3292  flagellar motor switch protein FliN  40.48 
 
 		 99 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3170  surface presentation of antigens (SPOA) protein  46.67 
 
 		 93 aa  73.2  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3039  flagellar motor switch protein  40.48 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1190  flagellar motor switch protein  41.46 
 
 		 127 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  43.24 
 
 		 156 aa  72  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3436  flagellar motor switch protein FliN  42.68 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0724  flagellar motor switch protein FliN  41.38 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5883  Type III secretion system outer membrane O protein  41.38 
 
 		 142 aa  72  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.6073  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0040  flagellar motor switch protein FliN  38.68 
 
 		 163 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  41.67 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4176  flagellar motor switch protein FliN  45.45 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1680  flagellar motor switch protein  41.38 
 
 		 375 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2193  flagellar motor switch protein FliN  36.94 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1265  flagellar motor switch protein FliN  36.94 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2140  flagellar motor switch protein FliN  36.94 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280572 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  39.36 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  37.84 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  37.84 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1142  flagellar motor switch protein FliN  36.94 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0539046  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  42.86 
 
 		 226 aa  72  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  38.68 
 
 		 161 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3567  flagellar motor switch protein FliN  45.33 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  37.84 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2135  flagellar motor switch protein FliN  36.94 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.120788 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4755  flagellar motor switch protein FliN  43.24 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.853225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>